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琼脂糖凝胶电泳检测DNA
来自 : mayitao
目的:学习水平式琼脂糖凝胶电泳,检测质粒DNA的构型、分子量的大小。
原理:琼脂糖是从海藻中提取出来的一种线状高聚物,可作为电泳支持物,适用于分离大小范围在0.2-50kb的DNA片段。DNA分子的迁移率与分子量的对数值成反比关系。观察其迁移距离,与标准DNA片段进行对照,就可获知该样品分子量大小。在质粒抽提过程中,由于各种因素的影响,使质粒DNA呈现超螺旋的共价闭合环状、开环状分子、线状分子三种不同的构型,这三种分子有不同的迁移率。在一般情况下,超螺旋型迁移速度最快,其次为线状分子,最慢的为开环状分子。用荧光染料溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)进行检测,溴化乙锭嵌入碱基对之间形成荧光络合物,在紫外线激发下发出红色荧光。
仪器与主要试剂:
仪器:
1)电泳仪
2)水平电泳槽
3)紫外检测仪
主要试剂:
1)提取的质粒DNA
2)5×TBE:54gTris;27.5g硼酸;EDTA(0.5mol/l,pH8.0)20ml,加水至1l,用前稀释10倍
3)溴化乙锭(EB):10mg/ml溶液
4)溴酚蓝
实验方法:
1)称取1g琼脂糖于100ml0.5×TBE中,加热溶解,冷却至65℃左右再加入终浓度为0.5%-1.0%的EB。
2)电泳胶模两端用透明胶带封固,梳子至于适当位置,将冷却至65℃左右的琼脂糖溶液慢慢倒在胶模上,厚度约3㎜。静置,待胶凝固后揭去胶模两端的透明胶带,放入电泳槽内,倒入适量电泳缓冲液(一般液面高出凝胶1㎝),小心拔出梳子。
3)将5μg提取的质粒DNA样品,与等体积溴酚蓝指示剂混匀,加入凝胶点样孔内,防止产生气泡和样品溢出。
4)将电泳槽通电,80V恒压电泳30分钟。
5)电泳完毕,关掉电泳仪,倒去电泳槽中的电泳缓冲液,小心取出凝胶置于紫外灯下观察结果,质粒DNA条带发出红色荧光。
注意事项:
1)防止紫外线对人皮肤及眼睛的损伤,避免直接照射皮肤与眼睛。
2)EB是强诱变剂,有致癌性,操作时要带手套,防止污染。所有含有EB的溶液在弃置前应当进行净化处理
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