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Illumina/TruSeq FFPE DNA Library Prep QC Kit (24 samples)/FC-121-9999/1 Ea
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Illumina/TruSeq FFPE DNA Library Prep QC Kit (24 samples)/FC-121-9999/1 Ea
品牌 / 
Illumina
货号 / 
FC-121-9999
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ProductHighlights:

TheTruSeqCustomAmpliconLowInputLibraryPrepKitisascalableampliconsequencingsolutionthatdeliverssensitiveandspecificresultsfrombothlow-inputandformalin-fixed,paraffin-embedded(FFPE)DNAsamples.Itoffers:

  • Accuratevariantdetectionfromaslowas10ngofinputgenomicDNA(gDNA)andchallengingFFPEsamples
  • Fullysupported,optimizedworkflowsolutionincludingsimpledataanalysis
  • Automation-friendlyworkflowthatcanbecompletedin6hours,withonly3hoursofhands-ontime
LowDNAInputandFFPECompatibility

TheTruSeqCustomAmpliconLowInputLibraryPrepKitisafullycustomizable,amplicon-basedassayfortargetedresequencingstartingfromaslowas10ngofgenomicDNA(gDNA).Thisscalableassayallowsresearcherstocapturemultipletargetsofinterestsimultaneouslyandsequenceupto1536ampliconsinasinglepool,usingasinglereaction.ThislibraryprepkitofferstheflexibilitytoaccommodateFFPEsamples,suchaspreservedtumortissue.

ConfidentAssayDesign

DesigntargetedTruSeqCustomAmpliconoligonucleotideprobeswithDesignStudio,afree,easy-to-useonlinetoolthatprovidesoptimizedcoverage.

LearnmoreaboutDesignStudio
StartaprojectinDesignStudionow(loginrequired)

AssessFFPESampleQualitybeforeSequencing

TheTruSeqFFPEDNALibraryPrepQCKitusesasimpleqPCRreactiontodetermineDNAqualityandprovideguidanceonsequencingparameters.Thisstepensuresthatonlysamplesthatwillachievethenecessarysequencingmetricsareprepared,conservingresourcesthatmightbeusedonpotentiallylow-quality,unrecoverablesamples.TheresultsoftheQCstepdeterminetherecommendedamountofinputDNA.TheTruSeqFFPEDNALibraryPrepQCKitcanbebundledwiththeTruSeqCustomAmpliconLowInputLibraryPrepKittomaximizelabbudgets.

ForFFPEapplications,wesuggestdesigningyourprojectwith150bpor175bpampliconssinceFFPEDNAishighlydegraded.TruSeqCustomAmpliconLowInputcannotbeusedwithapplicationsrequiring425bpamplicons.

SpeciesCompatibility

TheTruSeqCustomAmpliconLowInputLibraryPrepKitsupportshuman,mouse,rat,andbovinesamples.DesignStudiodesignalgorithmsarealsoavailableformaize,rice,pig,dog,soybean,chicken,andsheep;however,assayperformancecannotbeguaranteedastheresultingassayshavenotbeentested.Inaddition,IlluminaConciergeservicescandesigncustomassaysand/orprovideassayoptimizationsupportforanyspeciesofinterest.

InquireaboutIlluminaConciergeservices

Findanup-to-datelistofhigh-throughputautomationvendorswithroboticsystemscompatIBLewiththislibrarypreparationkit

Specifications:

AssayTime1day
Hands-OnTime4hours
InputQuantity50ngRNA,50nghigh-qualitytotalRNA,≥200ngFFPEtotalRNA;Recommendedquantitymayvarywithexpressionlevel,targetplexity,andsamplequality
ContentSpecificationsChoosefrom400,000+pre-designedtargetedRNA-Seqassays.Oraddcontenttoafixedpanelorpreviouslydesignedcustompanel.
MultiplexingUpto384samplespersequencingrun
MechanismofActionAmplification

TruSeqCustomAmpliconLibraryPrepProtocol:

TheTruSeqCustomAmpliconassayisasimpleandstreamlinedmethodforcapturingandamplifyingtargetedregionsofinterest.

SeamlessAmpliconSequencingWorkflow:

TheTruSeqCustomAmpliconLowInputLibraryPrepKitispartofanintegrated,fullysupportedworkflowforampliconsequencingthatguidesresearchersfromdesignthroughdataanalysis.Illuminatechnicalandfieldspecialistshelpensurerapidresolutionandminimizepotentiallaboratorydowntime.

RobustVariantDetectionatLowDNAInput:

TheTruSeqCustomAmpliconLowInputLibraryPrepKitdemonstrateshighconcordancebetweenexpectedandobservedvariantfrequenciesfor10nghigh-qualityFFPEDNA.ReferenceDNAsampleswerepreparedfollowingtheTruSeqCustomAmpliconLowInputworkflowwiththeTruSeqAmplicon-CancerPanelprimerpool,andsequencedontheMiSeqSysteminreplicatesof4.VariantswerecalledusingMiSeqReporterSoftware.R2valuesareshown.
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蚂蚁淘(www.ebiomall.cn)是中国大陆目前唯一的生物医疗科研用品B2B跨境交易平台, 该平台由多位经验丰富的生物人和IT人负责运营。蚂蚁淘B2B模式是指客户有采购意向后在蚂蚁 淘搜索全球供应信息,找到合适的产品后在蚂蚁淘下单,然后蚂蚁淘的海外买手进行跨境采购、 运输到中国口岸,最后由蚂蚁淘国内团队报关运输给客户...
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Source: Protocol OnlineAbstract: Modifying DNA using sodium bisulfite to convert unmethylated cytosines to uracils and subsequently detect methylated cytosines 查看更多>
OUTLINEThe erythrophagocytosis assay is performed to compare the phagocytic rate with and without anti-eythrocyte antibody in either macrophages from control a 查看更多>
DNA-Methyltransferase AssayThis protocol was written by Jean-Pierre Issa, based on Adams et al.* Kam-Wing Jair has made some useful shortcuts that work well if 查看更多>
苏州泓迅生物科技股份有限公司在发布的杂交瘤细胞抗体基因测序供应信息,浏览与杂交瘤细胞抗体基因测序相关的产品或在搜索更多与杂交瘤细胞抗体基因测序相关的内容。 查看更多>
单细胞测序的价值随着第二代测序(next generation sequencing,NGS) 技术和第三代测序( third generation sequencing,TGS)技术的飞速发展,引起生物研究领域的巨大变革。以前,需要从大量细胞中获取足够多的DNA 进行测序,因此测序结果是这些细胞“整体”的表征。然而,由于细胞异质性,相同表型的细胞的遗传信息可能存在显著性差异,很多低丰度的信息会在整体表征中丢失。为了弥补 查看更多>
基因组学是研究生物基因组的组成,组内各基因的精确结构、相互关系及表达调控的科学。从1988年人类基因组计划启动开始,到1998年毛细管测序技术问世,测序提速超10倍,原计划15年 查看更多>
cDNA文库构建/EST测序分析 cDNA文库构建/EST测序分析【相关服务:DNA测序】,DNA测序 8月2日,绿叶制药(02186.HK)母公司绿叶集团宣布收购新加坡基因测序公司Vela Diagnostics。这标志着绿叶集团正式进军精准医疗市场,而该公司的基因测序技术将与绿叶集团现有业务产生协同效应,形成从诊断到治疗的精准医疗全产业服务。绿叶集团人士告诉21世纪经济报道记者:“这家公司生产的设备、试剂已经拿到批文,接下来在国内注 查看更多>
2018-12-18
基因测序 查看更多>
随着高通量测序技术的引入和“大数据”处理能力的提高,现代医学正在经历巨大的变革,由传统标准化医疗模式向精准医疗模式转变。而人类基因组计划和DNA元素百科全书计划的完成及肿瘤基因图谱的绘制,更为“量体裁药”式的精准医疗提供了有力工具,医学领域面临新的机遇。精准医疗是以个人的基因组信息为基础,结合蛋白质组,代谢组等相关内环境信息,为病人量身设计治疗方案,以期达到治疗效果最大化和副作用最小化的一... 查看更多>
南京科佰生物科技有限公司在发布的基因测序供应信息,浏览与基因测序相关的产品或在搜索更多与基因测序相关的内容。 查看更多>
BRCA1是个庞大的基因,蕴藏着许多未知的信息。 查看更多>
导读: 基因测序 市场的下一个爆发点在哪里呢?我国已宣布启动精准医疗计划,基因检测被视为精确打击肿瘤的重要手段,那么肿瘤基因的液态活检技术,必将成为下一个巨大市场机会 查看更多>
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基因组dna文库CDNa文库在构建原理和用途上的主要区别是什么
不是太了解!我建议你用河南惠尔生物的磁珠法土壤DNA提取试剂盒!效果不错!
产品介绍:
普通的手提或者试剂盒提取的土壤基因组DNA由于常常残留有PCR的强烈抑制物如腐殖酸、棕黄酸等杂质造成实验失败,此外,由于采用了剧烈的玻璃珠击打来破裂菌体,常常造成DNA剪切和降解。本公司经过长期研发开发出了具有自主知识产权的土壤基因组DNA,通过专利配方的腐殖酸和棕黄酸去除试剂配合特殊处理的纯化柱,可以最大程度的去除这些杂质,同时加上多次柱漂洗,确保得到的DNA具有极高纯度,此外独特的抽提和裂解体系可以迅速裂解细胞(壁)和灭活细胞内核酸酶,不需要借助玻璃珠破壁,有效保证了基因组DNA的完整性。
产品特点:
1.本公司独有的专利配方和纯化柱能有效去除腐殖酸等杂质。
2.不需要借助玻璃珠破壁,有效保证了基因组DNA的完整性,长度可达30kb -50kb,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应。
3.兼容性强,适用于各种不同的土壤包括淤泥等提取困难的土壤。
4.多步骤去除各种杂质和抑制物,保证了极高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9。
5.不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
6.快速,简捷,单个样品操作一般可在60分钟内完成。
你找下,杭州昊鑫生物
请教DOP-PCR和ALU-PCR在扩增BAC/PACDNA制备探针文库时的优劣,或者说都可以。
天根的DNA提取试剂盒中,组织样品要求先将组织制备成单细胞悬液,再进行下一步操作。http://www.tiangen.com/?productShow/t1/1/id/26.html请问大家用过这个试剂盒的是怎么操作的?
是单链cDNA,想合成双链cDNA需要另外操作:一、cDNA第二链的合成:1. 第一链反应完成后,取2ul一链产物-20℃冰箱中保存,待电泳检测。其余的产物合并,混匀,然后顺序加入下列试剂(promega):20ul 10×DNA Polymerase I buffer6ul10mM dNTP(自己配制)xuldd H2O1ulRNase H(2U/ul)10ul DNA Polymerase I(10U/ul)总体系为200ul;2. 混匀后,16℃反应2.5小时;3. 70℃灭活10分钟;4. 反应完成后,得到200ul cDNA第二链反应体系,将此体系置于冰上;5.取2ul二链产物,同保存的一链产物一起电泳鉴定。同时上1kb ladder,确定双链的大小范围。注:一链,二链的电泳图是smear,且二链稍比一链大一些。二、双链cDNA末端补平:1. 在第二链反应体系中,顺序加入下列试剂(promega):6ul 10mM dNTP2ul T4 DNA Polymerase(8.7U/ul) 2ul BSA(10mg/ml)2. 稍微离心混匀反应物, 37℃反应至少30分钟,然后75℃灭活10分钟;3. 加入等体积酚/氯仿/异戊醇,剧烈振荡后,常温下13000g离心5分钟;4. 离心后,吸取上清于另一1.5ml eppendof管中,加入等体积氯仿,上下颠倒几次混匀后,常温下13000g离心5分钟;5. 吸取上清至另一eppendof管,加入1/10V3M NaAc(PH5.2)和2.5V预冷的无水乙醇,混匀,-20℃放置过夜以沉淀双链cDNA;6. 第二日,将昨日沉淀物在4℃,13000g离心60分钟以充分沉淀双链cDNA;7.离心完毕,弃上清,加入1ml 70%乙醇洗涤沉淀,常温下13000g离心5分钟;8.离心完毕,弃上清,干燥沉淀至无乙醇气味.注:第3,第4步可以用PCR 纯化试剂盒代替。PCR纯化试剂盒操作流程:1.溶液PE使用前应加入适量体积95%-100%的乙醇,混匀。2.向200ul二链补平产物中加入5倍体积的buffer PB,混匀。3.加入spin column中,13000rpm离心1min。4.加入0.75ml buffer PE,13000rpm离心1min。5.13000rpm,再离心1min。6.将spin column放入一新的离心管中,加入50ul buffer EB,静置10min。7.13000rpm离心2min。8.加入30ul buffer EB,静置10min。9.13000rpm离心2min。10.加入1/10体积3M的NaAc,2.5倍体积无水乙醇,混匀,-20℃沉淀过夜。
我以前溶解DNA、PCR产物用的一直是fermentas的PCR酶带的一些nuclear-free的水。
现在..用完了..因为接下来的PCR产物会做酶切,测序,而且保存时间也可能比较长(1个月左右吧)。
Qiagen的DNA提取试剂盒中提到过溶解DNA不可以用酸性的水,会发生水解。但是超纯水机出来的水确实是酸性的...再高压过估计也不会改变。该怎么制备呢?
请教DOP-PCR和ALU-PCR在扩增BAC/PACDNA制备探针文库时的优劣,或者说都可以。
QPCR常见问题123
富家子弟2021-07-30

各位好,希望能得到你的建议与帮助!

从人的冰冻组织提取DNA,Nanodrop定量纯度a260/a280在1.86左右,qubit2.0定量浓度达到了100ng/ul以上,按照Thermo的建库试剂盒操作,建库完成后,利用qPCR进行文库定量,有几个文库定量值只有20pM,问题在哪呢?

我试着更换Barcode重新建库,部分文库定量居然达到了600多pM,问了技术支持,他们也没有相关经验,请问群里的大神可否遇到过?

建库试剂盒是在保质期内IONAmpliseqlibrarykit2.0,引物是2013年自己定制的panel,一直储藏在-20℃冰箱,Barcode超出保质期半年。

求助大神:有人提过柔嫩**尔球虫的DNA吗?要求是能构建出文库的,一般文献记载的都是跑PCR就可以了,质量不够。我需要能构建文库的。
不要RNA,不要CDNA文库,就要DNA文库!
好人一生平安,大神帮帮忙!
你说的是哪款试剂盒呢?根据样本不同,可以选择不同的试剂盒的。比如抽血液样本的QIAamp DNA Blood Mini Kit 50次目录价为1630元。如果要购买应该会给折扣。
我用的是华美生物工程公司全血基因组DNA纯化系统试剂盒,说明书上说利用A260光吸测定浓度对该方法制备的基因组DNA是不适用的,产量可达1ug/20ul全血,5-10ul上清液可以直接用于PCR扩增。
我分别用3ul、5ul、8ul都试过了,没有任何条带,用别人别的方法提好的DNA做,却能出现结果,不知道是自己提取的DNA浓度不够,还是根本没有提取出来。
不知道谁用过,或者有更好的全血提取NDA的试剂盒推荐呢?
本人刚刚开始做PCR,谢谢各位高手!