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我的质粒拿去测序,为什么正向测不出
2017-10-05
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反向测不需要正向引物,但它需要一个反向引物。其实测序也就是一个单向的PCR反应,只是在反应体系中加入了四种不同颜色染料(常用的是ET或BigDye)染过的ddNTP,当不同大小的片断在毛细管胶上通过荧光扫描器后,电脑会记录染料颜色,从而得出序列的。正向测不通,可能是因为:1、你的模板比较困难,比如GC含量局部比较高,形成发夹结构,或出现连续的G、C,也可能是连续的C、T。而生工一板要做384或96个反应,用的PCR条件是统一的,不可能兼顾到你的序列的特殊情况,因此你的序列PCR不出来2、PCR纯化试剂盒有问题,可以考虑换纯化试剂盒。3、测序时进样太多或太少解决方法:1、你可以试试用载体上的通用引物进行测序2、已经设计出来的序列上设计一段引物,进行walking
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