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Phenolbased Method for the Isolation of DNA Fragments from LowMelting Temperature Agarose
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Phenol-basedMethodfortheIsolationofDNAFragmentsfromLow-MeltingTemperatureAgarose

  • Reference:Favre,D.1992.Biotechniquesvol.13

  1. CutoutslicecontainingDNA,smallestsizepossIBLe.

  2. EstimatevolumeanddoublewithTE(10mMTris-HCl,pH8.0/1mMEDTA).Meltat65C5-10min.

  3. Add1volumeTris-bufferedphenolatroomtemperature,mixbyinversion.

  4. Spin3minat10-12krpmandtransferaqueousphasetonewtube.Phenolextractagain.

  5. Spinasin(4)andtransferaqueousphasetonewtubecontaining0.1volume4MLiCl.Mixbyinversion;awhiteprecipitateformsimmediately.Placetubeonice2min.Spinasabove,3min.

  6. Transfertonewtube,leavingtransparentpelletbehind.Add1ulcarrier(glycogen)andprecipitatewith2.5volumescoldethanol.Mix,leaveat-70C5-10min,andspinasabove,10min.Washpelletwith1ml70%ethanol,dryundervacuum,andresUSPendin10-20ulwaterorTE.

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