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急急急急急急!!!克隆基因目的片断大小为180bp左右、可行吗?
2021-07-31
问题描述:

本人是个菜鸟、设计引物时忘记考虑目的片断大小了!引物已经合成了、才发现克隆基因目的片断大小为180bp左右、是兼并引物来克隆未知基因片断、再做全基因克隆。向大家请教一下,这样做可行吗?是不是片断太小???老板还不知道、估计要废废了。恳请大家多多指教。有没有什么补救的办法?好的建议?????

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csh7311
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不错啊!将180bp克隆测序,序列在ncbi上blast比对一下,看是否你的目的基因,再作下一步的3‘RACE和5’RACE,即可获得全长基因。
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zjubell
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180bp可能在蓝白斑筛选时会出错,片段过小,有可能找不到白斑了。
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tiger22
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只提醒一个问题:多切几管多回收,越多越好。
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xiaoyao0305
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谢谢各位!我试一试!~
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bentz
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180bp的基因还需要克隆吗?直接合成就行了,或者自己拿3,4条引物相互进行PCR反应即得结果,屡试屡爽。
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xiaoyao0305
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兼并引物来克隆未知基因片断、再做全基因克隆。未知基因序列如何合成?敬请指教!先谢谢了!
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zjubell
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bentz180bp的基因还需要克隆吗?直接合成就行了,或者自己拿3,4条引物相互进行PCR反应即得结果,屡试屡爽。180bp只是基因中的一部分,他要做的是预测与克隆基因,如果都不知道基因的序列,如何去合成啊?根据其他物种的同源性,用兼并引物拉出180bp序列,然后在中间设计一条上游引物,并做3’race,已经是比较常规的方法了。
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