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ZYMO RESEARCH/Quick-DNA Fecal/Soil Microbe Microprep/D6012
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Highlights
- Rapid method for the isolation of inhibitor-free, PCR-quality DNA from fecal samples in minutes, including those from humans, birds, rats, mice, cattle, etc.
- Ultra-high density BashingBeads are fracture resistant and chemically inert.
- Zymo-Spin column and unique filtration technologies effectively removes PCR inhibitors from the DNA product.
Description
| Applicable For | All sensitive downstream applications such as qPCR and Next-Generation Sequencing. |
|---|---|
| Elution Volume | ≥ 20 µl |
| Equipment | Microcentrifuge, vortex, cell disruptor/pulverizer |
| Processing Volume | ≤50 mg feces, ≤ 250 mg soil, ≤20 mg fungal/bacterial cells (wet weight) |
| Purity | A260/A280 nm ≥1.8. |
| Sample Source | Feces or soil |
| Sample Storage | DNA stored at ≤ -20°C. |
| Size Range | Capable of recovering genomic DNA up to and above 40 kb. In most instances, mitochondrial DNA and viral DNA (if present) will also be recovered. |
| Type | Total DNA |
| Yield | ≤ 5 µg total DNA |
Q1: My lysate seems viscous. What is causing this to happen? How can I fix this?
A viscous sample can indicate incomplete sample lysis. Try using less of your sample and optimize bead beating conditions (duration, speed, time) to ensure samples are thoroughly lysed. After bead beating, pellet the cell debris before moving on. Adding more Genomic Lysis buffer to the lysate can help dilute and deproteinate the sample, making the sample less viscous and more suitable for DNA recovery.
Q2: Are there any tips in optimzing bead beating conditions?
We have validated our kits with both high-speed homgenizers and low-speed disruptors. We highly recommend users to optimize their bead beating conditions for their own instruments. We recommend using a 2 ml-tube adapter to ensure that the bead beating is efficent (do not use adapters made of foam). For high-speed homogenizers, we recommend a total of 5 mins bead beating (1 min interval at 6.5 m/s with 5 mins rest, repeat 5 times). For low-speed cell disruptors, we recommend 30 mins at max speed.
Q3: What is the purpose of Zymo-Spin II-µHRC step?
Environmental samples often contain inhibitors such as polyphenolics, humic/fulvic acids, tannins, melanins, etc. that affect downstream applications such as PCR. Once the DNA is eluted off the binding column, the DNA is then passed through the Zymo-Spin II-µHRC to remove the PCR inhibitors, and the DNA is then ready for downstream applications. The Zymo-Spin II-µHRC does not bind DNA, it simply removes the PCR inhibitors.
Q4: Is it necessary to add beta-mercaptoethanol? Can this step be substituted or omitted?
Addition of beta-mercaptoethanol is recommended to enhance sample lysis, but can be substituted with dithiothreitol (DTT, final concentration of 10 mM). However, if bead beating is optimized and lysis is efficient, the addition of BME is not necessary and can be omitted.
Q5: When can an RNase A treatment be implemented in the protocol?
No additional RNase A treatment is required when processing samples within kit capacity. The selective chemistry allows for binding of double stranded DNA to the column and for RNA to flow through.
| Cat # | Name | Size | Price | |
|---|---|---|---|---|
| D3004-1-100 | Genomic Lysis Buffer | 100 ml | $60.00 | |
| D3004-2-50 | g-DNA Wash Buffer | 50 ml | $18.00 | |
| D3004-4-10 | DNA Elution Buffer | 10 ml | $14.00 | |
| D3004-5-15 | DNA Pre-Wash Buffer | 15 ml | $10.00 | |
| D6001-3-40 | BashingBead Buffer | 40 ml | $29.00 | |
| D6035-1-30 | Prep Solution | 30 ml | $18.00 | |
| C1057-50 | Zymo-Spin III-F Filters | 50 Pack | $59.00 | |
| C1004-50 | Zymo-Spin IC Columns | 50 Pack | $53.00 | |
| C1059-50 | Zymo-Spin II-µHRC Filters | 50 Pack | $108.00 | |
| S6012-50 | ZR BashingBead Lysis Tubes (0.1 & 0.5 mm) | 50 Tubes | $101.00 |
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蚂蚁淘（www.ebiomall.cn）是中国大陆目前唯一的生物医疗科研用品B2B跨境交易平台，
该平台由多位经验丰富的生物人和IT人负责运营。蚂蚁淘B2B模式是指客户有采购意向后在蚂蚁
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运输到中国口岸，最后由蚂蚁淘国内团队报关运输给客户...
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2021-08-12
本章所讲述的方法应尽可能地与特定的功能相结合，但在应用到某一给定的问题时，没有硬性和快捷的准则可以判断哪一种方法是最合适的，这取决于许多因素，并非所有的因素都在研究者的控制之中，包括个人的经验、材料的来源、成像的有效性和数据记录的仪器。 查看更多
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区分活细胞和死亡细胞的关键在于死亡细胞膜转运功能及膜完整性的丧失。许多阳离子染料，如台盼蓝、碘化丙锭（PI）、溴化乙锭（EB）以及7-氨基放线菌素D（7-ADD）等，常被用于检测细胞的存活率。活细胞由于膜具有完整性而不被着色，死亡细胞（如坏死细胞或晚期凋亡细胞）由于其膜完整性的丧失而被着色。 查看更多
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2018-12-26
一、原理 1976年Goodpasture等应用银染色技术，使9种哺乳动物的核仁组织者区（NORs）特异性的染为黑色，该技术被称为Ag-As的银染技术，银染色阳性的NORs被称为Ag-NORs，与Hsu等人用原位分子杂交得到的结果比较，表明Ag-NORs就是18S+28S核糖体基因（rDNA）的分布区，后证实染色的不 查看更多
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2018-08-05
本章介绍了酵母遗传学实验相关技术和方案。 查看更多
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2018-08-05
来源：《遗传学实验教程》 查看更多
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2018-08-03
本实验来源「细胞实验指南」 黄培堂 等译。 查看更多
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2021-08-20
本实验来源「实用流式细胞术彩色图谱」 王书奎、周振英主编。 查看更多
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2018-08-06
当程序性细胞死亡（PCD)或凋亡被认识到是多细胞生物体内生长和体内平衡的一个重要调控元件时，用于定量细胞凋亡及区别细胞凋亡和坏死的方法得到了发展。决定一细胞死亡是由于凋亡而不是坏死的标准的最好依据是：①细胞膜和质的变化；②细胞的染色质变化，这两者的发生先于膜的裂解。来源：《精编分子生物学实验指南》第五版 查看更多
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2018-08-06
结缔组织广泛分布于入体和动物体内，而疏松结缔组织在组织损伤后的修复过程中，纤维细胞可转化为活跃的成纤维细胞。成纤维细胞能形成胶原纤维、弹力纤维和网状纤维以及基质等成分。致密结缔组织的间质内含有大量纤维，排列紧密，细胞和基质比较少，主要含有弹性纤维，又称为弹性致密结缔组织。网状结缔组织由网状细胞和网状纤维组成，其化学成分含有蛋白质和多糖。通过染色试剂，能够证明结缔组织纤维分类和纤维之间存在的相互关系。 查看更多
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2021-08-11
本章所讲述的方法应尽可能地与特定的功能相结合，但在应用到某一给定的问题时，没有硬性和快捷的准则可以判断哪一种方法是最合适的，这取决于许多因素，并非所有的因素都在研究者的控制之中，包括个人的经验、材料的来源、成像的有效性和数据记录的仪器。 查看更多
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2021-08-26
超薄切片技术 (Ultramicrotomy)是为透射电镜观察提供薄标本的专门技术，是生物学中研究细胞、组织超微结构最常用的技术，也是生物学中其它电子显微技术，如电镜放射自显影、电镜酶细胞化学以及免疫电镜技术等关键性的技术。目前有关生物体的各种细胞、组织的超微结构知识几乎都是这种技术所提供的。使用该技术观察研究病毒标本，既能看清病毒内部的微细结构，还能观察到病毒与宿主细胞的关系，但对宿主细胞引起的超微形态的改变以及病毒对宿主细胞的吸附、进入宿主细胞、在宿主细胞内的增殖复制等机理的研究，都需将宿主动物的组织 查看更多
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2021-08-09
所有的生物都是由细胞组成的，只是不同的生物体细胞的大小和形状有所不同。有的细胞人的眼睛可以看得见，如鸟类的蛋，最大的直径近10厘米（鸵鸟蛋）。 查看更多
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荧光染料标准品_标准品_生化试剂_知道_生物信息网123
matsukoko2021-07-23
阅读下面语段.完成下题. 金龟子科中有一些贪食树根或农作物根的...123
星月青城2018-01-26
运用了哪些说明方法，有什么作用？新兴的生物循环再生技术将染料及其他材料完全去除，无限循环再生。这和在一定条件下从石油中制造出聚醋原料再焚烧相比，能量消耗量及二氧化碳排出量均可削减80%。而回收的服装可以返回工厂，重新再生为长纤维。这种方法为延...
应用酸性染料比色法测定总生物碱的含量123
独脚金鸡2004-04-19
我想测定中药中总生物碱的含量，不知道用酸性染料法该注意哪些事项？
请各位大侠给予帮助！！
谢谢！！
请各位大侠给予帮助！！
谢谢！！
【求助】酸性染料比色法测定溶出度,随着时间的增加,溶出量减少? ...123
mxyy2021-07-25
一新药，以麻黄总生物碱作溶出方法学研究如下：
取片剂一片，照溶出度测定法（中国药典2000年版二部附录ⅩC第三法），以水250ml为溶剂，转速为每分钟50转，依法操作，分别经15、30、45、60、75、210分钟取溶液滤过，精密量取续滤液5ml于分液漏斗中，加入pH7.4磷酸盐缓冲液5ml，5ml0.3%溴麝香草酚蓝溶液，用15ml氯仿分两次萃取，合并萃取液，加入0.4g无水硫酸钠，照分光光度法（中国药典2000年版二部附录ⅥA），在410nm波长处测得溶出A值。现15、30、45、60、75、210分钟溶出A值分别为0.0413、0.0544、0.0437、0.0479、0.0394、0.0302。（测定吸收度偏小是否不准，有影响。）
请各位站友指教。
取片剂一片，照溶出度测定法（中国药典2000年版二部附录ⅩC第三法），以水250ml为溶剂，转速为每分钟50转，依法操作，分别经15、30、45、60、75、210分钟取溶液滤过，精密量取续滤液5ml于分液漏斗中，加入pH7.4磷酸盐缓冲液5ml，5ml0.3%溴麝香草酚蓝溶液，用15ml氯仿分两次萃取，合并萃取液，加入0.4g无水硫酸钠，照分光光度法（中国药典2000年版二部附录ⅥA），在410nm波长处测得溶出A值。现15、30、45、60、75、210分钟溶出A值分别为0.0413、0.0544、0.0437、0.0479、0.0394、0.0302。（测定吸收度偏小是否不准，有影响。）
请各位站友指教。
同一基因突变,为何向左为LQT3,向右为Brugada综合征?_心肌细胞123
第537位访客2018-02-18
在生物中，健那绿染液是专一性染线粒体的活细胞染料。
健那绿染液是一种活体染液，实验对象必须是活细胞，健那绿可以使活细胞中的线粒体呈现蓝绿色，而细胞质接近无色。
健那绿染液是一种活体染液，实验对象必须是活细胞，健那绿可以使活细胞中的线粒体呈现蓝绿色，而细胞质接近无色。
【分享】酸性染料比色法测定生物碱含量时为什么硫酸钠会变为蓝色？...123
小帅帅5162021-07-21
我在用酸性染料比色法测定生物碱含量时发现加入的无水硫酸钠变为蓝色了,这是为什么啊
而且样品中的无水硫酸钠未变色,而做标准曲线的五个和空白对照的变为蓝色了,请高手指教,多谢!
还有,是否变蓝对测定结果有影响吗?
谢了哈
欢迎你！请下次规范发贴:)
而且样品中的无水硫酸钠未变色,而做标准曲线的五个和空白对照的变为蓝色了,请高手指教,多谢!
还有,是否变蓝对测定结果有影响吗?
谢了哈
欢迎你！请下次规范发贴:)
Lumiprobe』动物活体成像用染料|活体成像|性能参数,报价/价格,...123
cnbio62172021-07-22
lumiprobeCorporation是美国一家高品质生物技术公司，专业提供分子生物学研究用的活性荧光染料。从2006年开始，公司生产并销售生命科学研究和诊断学应用的优质化学药品。产品主要有：活性染料(ReactiveDye)和SYBRGreenI染料，用于寡核苷酸合成的亚磷酰胺，点击化学和其它试剂。
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
氨基类染料是包含自由氨基的活性染料，染料可与活化羧酸衍生物和其他亲电子的试剂结合。比如：氨基与EDC-活化的羧基结合。
相关产品如下：
中文名英文名产品编号分子结构Cy7.5胺Cy7.5amineAGF1350A[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704110804_5250.jpg[/img]Cy5胺Cy5amineAGF1332A[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704110715_7750.jpg[/img]相似系列产品：
抗体、核酸、蛋白质等生物分子标记染料
羰基活性荧光染料
巯基反应性染料
羧酸类染料
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
氨基类染料是包含自由氨基的活性染料，染料可与活化羧酸衍生物和其他亲电子的试剂结合。比如：氨基与EDC-活化的羧基结合。
相关产品如下：
中文名英文名产品编号分子结构Cy7.5胺Cy7.5amineAGF1350A[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704110804_5250.jpg[/img]Cy5胺Cy5amineAGF1332A[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704110715_7750.jpg[/img]相似系列产品：
抗体、核酸、蛋白质等生物分子标记染料
羰基活性荧光染料
巯基反应性染料
羧酸类染料
【资源】蛋白质、多肽、核酸等生物分子标记染料_问答123
cnbio62172014-05-23
lumiprobeCorporation是美国一家高品质生物技术公司，专业提供分子生物学研究用的活性荧光染料。从2006年开始，公司生产并销售生命科学研究和诊断学应用的优质化学药品。产品主要有：活性染料(ReactiveDye)和SYBRGreenI染料，用于寡核苷酸合成的亚磷酰胺，点击化学和其它试剂。
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
N-羟基琥珀酰亚胺酯类活性染料 罗丹明类化合物是以氧杂蕙为母体的碱性咕吨染料，由于特殊的结构及相应的荧光特性，使罗丹明类荧光染料成为化学和生物分析领域中研究较为广泛的课题。与其他常用的荧光染料相比，罗丹明类荧光染料具有光稳定性好、对PH不敏感、较宽的波长范围和较高的荧光量子产率等优点，因此被广泛应用在医学、生物学、环境化学等方面，是分析化学和生物技术领域中最常用的荧光染料。
菁染料是性能优良的荧光标记染料，摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的。N-羟基琥珀酰亚胺酯是最常用的脂肪氨基标记试剂，广泛用于蛋白质、氨基酸多肽、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度,可改变其荧光发射波长，每增加一个双键，按照Huoffman规则正好红移约100nm。
菁染料Cy3和Cy5已成为基因芯片的首选荧光标记物；另外,Cy5,Cy5.5和Cy7，Cy7.5的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料，特别适合于活体小动物体内成像。但由于菁染料,尤其是不对称菁染料的合成副反应多,副产物极性相近,产物的分离提纯相当困难。菁染料特别是水溶性菁染料分子极性大,分离提纯越加困难。Lumiprobe供应脂溶性和水溶性菁染料。
相关产品：
产品分子结构可替代染料编号：AGF1371A
6-ROX-N-羟基琥珀酰亚胺酯
ROXNHSester,pure6-isomer[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704102819_7906.jpg[/img]AlexaFluor568编号：AGF1326A
Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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编号：AGF1330A
Cy3.5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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DyLight594NHSester
编号：AGF1338A
Cy5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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编号：AGF1345A
Cy5.5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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编号：AGF1349A
Cy7-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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Cy7.5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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磺酸基-Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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DyLight549
编号：AGF1377A
磺酸基-Cy5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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DyLight649
编号：AGF1379A
磺酸基-Cy7-N-羟基琥珀酰亚胺酯
Sulfo-Cy7NHSester[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704104047_6968.jpg[/img]相似系列产品：
羰基活性荧光染料
氨基类染料
巯基反应性染料
羧酸类染料
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
菁染料是性能优良的荧光标记染料，摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的。N-羟基琥珀酰亚胺酯是最常用的脂肪氨基标记试剂，广泛用于蛋白质、氨基酸多肽、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度,可改变其荧光发射波长，每增加一个双键，按照Huoffman规则正好红移约100nm。
菁染料Cy3和Cy5已成为基因芯片的首选荧光标记物；另外,Cy5,Cy5.5和Cy7，Cy7.5的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料，特别适合于活体小动物体内成像。但由于菁染料,尤其是不对称菁染料的合成副反应多,副产物极性相近,产物的分离提纯相当困难。菁染料特别是水溶性菁染料分子极性大,分离提纯越加困难。Lumiprobe供应脂溶性和水溶性菁染料。
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Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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编号：AGF1330A
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编号：AGF1345A
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磺酸基-Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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编号：AGF1377A
磺酸基-Cy5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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编号：AGF1379A
磺酸基-Cy7-N-羟基琥珀酰亚胺酯
Sulfo-Cy7NHSester[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704104047_6968.jpg[/img]相似系列产品：
羰基活性荧光染料
氨基类染料
巯基反应性染料
羧酸类染料
【求助】酸性染料比色法测定总生物碱含量中遇到的问题123
防风半夏2007-03-31
我在做中药提取物中总生物碱含量测定,用的是酸性染料比色法,两次试验在处理样品时,同样的重量,同样的溶剂量,只是最后在调节PH值时一次用的是氨水调到9-10,一次用的氢氧化钠溶液调到9-10,但是发现用氨水调的溶液测定值明显比氢氧化钠调的要高得多,这是怎么回事呢?有同学说氨水可能有部分也与酸性染料形成络合物了,但是我的供试液是经三氯甲烷萃取,挥掉三氯甲烷,再用无水乙醇定容的,应该不会存在这种可能的.请教各位大侠,这是什么原因呢?
生物质燃料的类型有哪些123
小海8792018-03-01
一般分固体成型燃料、气体燃料和液体燃料
DNA显示中三种染色方法的比较123
haolixx2018-01-29
高中生物，老师貌似说了有三种染料都可以染色dna。而且用处不一样
二苯胺
甲基绿派洛宁
还有一种忘了。
假期没法联系老师呵呵。
这三种的作用都是什么。
二苯胺
甲基绿派洛宁
还有一种忘了。
假期没法联系老师呵呵。
这三种的作用都是什么。
生物中唯一能进行活体染色的染色剂123
2018-01-09
一般的生物材料不能穿透细胞膜,只有当细胞被固定后,细胞膜被破坏,染料才能进入...
健那绿——高中唯一一个活体染色剂。染线粒体的，染成蓝绿色
健那绿——高中唯一一个活体染色剂。染线粒体的，染成蓝绿色
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