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4.3 非洲爪蟾卵母细胞体外翻译系统一非洲爪蟾卵母细胞体外翻译系统
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实验材料
仪器、耗材
实验步骤
一、材料与设备

(一)非洲爪蟾卵母细胞提取物的制备

1)成年雌性非洲爪蟾:数只。

2)高盐的ModifiededBarth、X(MBS):每升溶液中补加1.28gNaCl,以使其终浓度达到llOmmol/L。

3)血浆促性腺激素和绒毛膜促性腺激素。

4)溶液A;2%半胱氨酸的盐酸溶液,用NaOH调节PH至7.7。

5)溶液B(抽提缓冲液):100mol/LKCl,0.1mmol/LCaCl2,1mmol/LMgCl2,50mmol/L蔗糖和10mmol/LHEPES-KOH(pH7.7)

6)VersilubeVF50:密度介于蛙卵和溶液B之间

7)细胞松弛素B:在4℃,以储存于DMSO中

8)抑肽酶:在—20℃,以10mg/ml储存于水中

9)RNaseA:以1mg/ml溶于水中;分装后存于一20℃

10)核糖核酸酶抑制剂

11)DTT:lmol/L,分裝存于-20℃。在加入抽提物之前应现稀释成lOOmmol/L使用。

12)tRNA:以5mg/ml溶于水中,分装后存于一20℃

13)离心机。

14)冷室。

(二)非洲爪蟾卵母细胞提取物的翻译

1)磷酸肌氨酸:350mmol/LL,储存于-20℃

2)[32S]-甲硫氨酸:100uCi/管分装,储于一70°C

3)亚精胺:120mmol/L,储存于一20℃

4)兔网织红细胞裂解液/S-100提取物:如要去除反应中外源的核糖体,那么就必须制备S-100片段.假如对外源性的核糖休并无特殊要求,那么可用经核酸酶处理过的网织红细胞裂解液代替S-100片段。制备S-lOO的方法..将100ul网织红细胞裂解液以100000g离心2h,可得到约80ul的上清液。将上清以10ul的休积分装后,立即置入液氮中快速冷却,然后储于一70℃备用。注意:在移出上清时不要吸入核糖体

5)离心机

6)冷室

(二)翻译产物的分析

1)10%TritonX-100:在开封后,未用的溶液应于4℃避光保存

2)PMSF

3)TritonX-100,1mmol/LPMSF:新鲜配制

4)2XT缓冲液:100mmol/LKCl,10mmol/L乙酸镁,200mmol/LNaCl和40mmol/LTris-HCl(PH7.5)D超滤火菌后存于一20℃。产物可与40%的蔗糖储液混合,分别稀释成1XT+10%和1XT+20%蔗糖溶液,未使用的lXT-f10%和1XT+20%蓆糖溶液可存于一20℃

5)蛋白酶K:25mg/ml储于50%甘油屮

6)Na2CO3:对于每一个碱性蔗糖密度梯度分离实验,应新鲜配制1mol/L储液,其100mmol/h溶液PH应为11,储液用水以1:5的比例稀释成200mmol/L的使用液.用以处理膜片段。另外,储液还可以与40%的蔗糖溶液混合(1体积的1moL/L4体积的水和5体积的40%的蔗糖溶液)以制成20%的蔗糖密度梯度。

7)1mol/LHCL

8)丝氨酰醅氨酰天冬酰胺(ThrTyr-Asn):由于其在水中的溶解件不好,因此储液一般用DMSOS成lOOmmol/L使用时,吋用储液做相应稀释。

9)离心机。

10)冷室.

二、操作方法

(一)非洲爪蟾卵母细胞提取物的制备

1.基本提取物的制备

整个操作过程进行得越快.所得的最终提取物的翻泽效果就越好,因此,在开始制备提取物之前,应务必确定是否所有的缓冲液、试管和离心机转子都预冷到4°C,以及确定所有必需的材料都备齐。另外,除非温度被特别指出,否则在上述的笫2)步之后的所有步骤都应在4°C冷室中置于冰浴上迸行

1)挑选较大的成年雌性非洲爪蟾数只,于第1天给每只注射50〜1O0U的血浆促性腺激素,3〜5天之后,即在制备提取物的前一天晚上再向每只非洲爪蟾注射500〜750U,绒毛膜促性腺激素,以诱K排卵。之后,非洲爪蟾被放置过夜,并使之将卵排到商盐的MBS中,以保持卵的生物学活性

2)将约30ml的松散结合的卵转移到一个250ml的广口玻璃杯中,用高盐的MBS反复冲洗几次后,用塑料移液管吸去细胞碎片以及已死亡的卵细胞。尽可能多的去除上清缓冲液加人100ml溶液A,重复以上操作2〜3次。^不时涡旋振动悬浮的卵,并持续5〜lOmin当蚌卵所占的体积显著性的减少时,说明卵外层的胶状衣鞘已逐渐溶解。此时,闻用溶液A冲洗蛙卵,然后弃去溶液,重复儿次后将蛙卵转人冰预冷的溶液B中,

3)用广口移液管耗轻将蛙卵吸到4个2ml的离心管巾,在此过程中应尽可能少的吸入浴液B上,蛙卵靜置约1min后仔细地吸去上清,然后在液面上梗盖一层VersihjbeVF50,并于4℃以500g离心1min。离心后,蛙卵应紧靠在一起,但不应破裂。离心结束时.溶液B应位于最上层,Vei^lubeVF50层位于中间,而蛙卵则位于最下层。

4)用200ul移液器小心地移去上层缓冲液及油层,然后将离心管置于离心机中,于4℃以20000g离心15min,以裂解蛙卵。预期的离心产物山多层细胞裂解产物所组成,而其中黏稠的琥珀色的屮间层大约占40%的体积,这就是目的产物,即细胞质。用塑料移液管穿过脂质的薄层插入到中间层中.使细胞质转移出来。

5)从所有的离心管中将产物一移出,估汁体积后按5ul/ml的量加入10mg/ml的细胞松弛素轻轾吹打混匀后,将混合物转入新的1.5ml离心管中,于4℃以20000g离心15min,离心后,细胞质应占绝大多数的休积,在将其移出时,应十分小心以避免吸出底部的沉淀。

6)按1ul/ml的量加入10mg/ml抑肽酶,轻较充分混匀。

提取物可以用于翻译反应、冻存,也可按如下步骤对其中的内源性mRNA进行去除。

2.内源性mRNA的去除

像制备基本提取物时一样.内源性mRNA的去除也最好在冷室中进行。

1)稀释RNaseA储液的浓度到100X的使用液。

2)按lul/管的量向具有螺旋盖的1.5ml的离心管屮加入稀释好的RNawA,然后向每管中加入100ul提取物,上下吹打混匀。置10℃孵育I5min

3)将离心管背于冰上,按1ul/管的量加入100mmol/LDTT,接着按50U/管的量加入RNa此抑制剂。充分混匀,置10℃孵育15min,,按2ul/管的最加入5mg/mltRNA.去除了内源性mRNA的提取物可以立接用于翻译反成,或尽快冻如液氮中备用

(二)外源mRNA在非洲爪蟾卵母细胞提取物中的翻译

1)室温融化冻存的提取物,然后即置于冰上。

2)同时,应将用于翻译的mRNA分装于0.5ml或1.5ml离心管中,置于冰上

3)每100ul提取物应分別加入以下各成分:10ul网织红细胞裂解液S-100,1ul120mmol/L精胺,2.5ul350mol/L磷酸肌氨酸和lO0ulCi[35S]-甲硫氨酸。按10〜50ul/管的量向盛有mRNA的离心管屮加入此种混合物,混合均匀后,置21℃孵育lh

4)如果具有高放射件活性的体外合成mRNA被用于翻译,则在反应结朿时应加入lOug/mlRNaseA并置于21°C孵育15min,以除去由放射性mRNA带来的将会妨碍进一步分析的放射性背景。

5)如需储存,反应可在此步通过冷冻加以终止

6)如用凝胶电泳分析或TCA沉淀反成,在加入等体积的2XSDS聚丙烯酰胺凝胶电泳加样缓冲液或筛选过滤前,应向反应产物加入1%X-100和lmmol/LPMSF

(三)翻译产物的分析

对翻泽产物逬行普通的凝胶电泳常常可揭不其分泌表型:假如位爭肽序列被切割,则
分子质览通常町减少2k〜3kDa;如果发生糖基化,则产物的迁移宇通常比麦胚提取物或网织红细胞裂解液翻译产牛的末修饰的蛋白的辽移率有相对的降低。由于其他原因也对能导致迁移率改变,所以我们可以通过蛋H酶保护反说或者蔗糖密度梯度离心来确定
导致迁移率改变的真正原因=碱性蔗糖密度梯度离心能用于确定蛋白是否是否自由存在于内质网腔中或是整合十膜上,而特异的N-糖基化的抑制可能表现为表面上的分子质量的增加。

1.蛋白酶保护反应

1)从转录反应体系屮取出3X10ul的反应液用于实验,并置于冰上。假如必须使用少于10ul的反应液,例如当产物要用于多种方法分析时.可加入4倍体积的1XT缓冲液+10%蔗糖对反应液进行稀释。

2)向毎个试管中加入1ul的10%TrimnX-100以裂解存在的膜,并提供一个蛋白质水解酶的阳性对照。

3)在10%的蔗糖溶液屮加入1ul1/ml的蛋白酶K溶液并同时加人Triton(二个样品屮冇一个不添加,以作为加工过程中的稳定性对照)置于冰上1h

4)用3倍体积的10%蔗糖溶液对lOOmmol/LPMSF进行稀释:按1ul/反应的试加入PMSF,使其终浓度达到2〜2.5mmol/L,并继续在冰上孵育15min。

5)加入lOOul2XSDS聚丙烯酰胺凝胶屯泳加样缓冲液其中包括1%TntonX-100).沸水浴5min,如样品在进行蛋白酶处沔前进行了稀释,应加入更少体积的2XSDS聚丙烯酰胺凝胶屯泳加样缓冲液,以使最终混合物中提取物的体积不少于10%。

6)SDS聚两烯酰胺凝胶电泳分析(其中包括-管来自同—反设体系的经相同稀释的未作处理的样品.并将之作为标记物)。

2.中性蔗糖密度梯度分离

蔗糖密度梯度分离不但可作为分析的工貝.而旦能对样品中的翻泽产物作活性分析前的纯度分析。

假设按照如下所述的碱性蔗糖密度梯度分离,建议将反应的起始体积设为最少50ul,即这样体积就更容易控制。

1)于冰上用10倍体积的1XT缓冲液+10%蔗糖溶液对样品进行稀释.留一点样品作为SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的标记物,然后小心的将剩余的部分铺于盛有1ml1XT缓冲液蔗糖溶液的1.5ml离心管中。

2)于4℃、40000g离心30min。

3)回收顶端包含细胞质蛋白的液层(10%蔗糖溶液),操作时应避免此液层与20%蔗糖溶液层的互溶,以提高产物的纯度。移出并弃余下的蔗糖缓冲液,小心不要触动管底的呈褐色的膜珠。

4)如果膜的稳定性对于蛋白酶保护反应或碱性蔗糖密度梯度分离等实验是必需的,则首先用前述蔗糖密度梯度的一半体积的1XT缓冲液十20%的蔗糖溶液轻轻重悬膜珠,然后分别加入TritonX-100和PMSF至终浓度为1%X-100和Immol/LPMSF,以溶解膜珠。

5)通过SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳对总反应产物以及每一组分进行分析.

3.碱性蔗糖密度梯度分离

碱性处珅可以破坏襄泡膜,释放放囊泡内的蛋由,但并不溶解脂质双分子层。在经蔗糖密度梯度分离后,囊泡蛋白将仍留在上清中,而膜结合的组分将以小珠的形式沉淀下来。

1)取(三)翻译产物的分析」中的2中的「中性蔗糖密度梯度分离」屮的第4)步所得的1OOul膜溶液,加人等体积的200mmol/LNa2C03,置冰上孵育30min。

2)取上步所得的膜250ul的Na2C03溶液平铺于盛有lml20%蔗糖溶液的1.5ml离心管中,于4℃以100000g离心1h

3)移出100〜150ul上清,注意:此处允许小部分的损失,不要全部移出。去除20%的蔗糖溶液后,用1%TritonX-100,1mmol/LPMSF重新溶解膜珠。

4)在进行SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳分析前,应加入大约占总体积10%的lmol/L的HCL以中和上淸液。注意:HC1应缓缓加入,井不断搅拌混匀,以防止局部的蛋白质变件沉淀。另外,在此过程中应不断用pH试纸检测溶液pH,以防HC1过量

4.特异的N-糖基化抑制

传统上,位于多肽链上的N-糖基化位点可通过能特异对其进行切割的内切糖苷酶H来测这里将介绍一种在策略下完全不同的新方法,通过加入竞争性的Thr-Tyr-Asn"肽序列可以特异件的抑制非洲爪蟾提取物屮体外翻译多肽的糖基化,以揭示所翻译的多肽序列是否进行了N-糖基化

1)准备两组浓度经系列稀释的二肽水溶液,其浓度范围为1.5〜50mol/L

2)在冰上准备好-个至少80UL的休外翻译反应系统,其中应包含用于翻译成目的蛋白的mRNTA。

3)在每9ul翻译反应液中加入lul的经系列浓度梯度稀释的三肽溶液。另外,取一份9ul的翻译反应液加入1ulDMSO以代替三肽溶液作为DMSO对应应影响的对照。将这些混合物S剩余的作为阳性对照的反应物共问于21℃孵育1h。然后对样品进行SDS聚内烯酰胺凝胶电泳分析,其中应包括一个经网织红细胞裂解液翻译的未糖基化蛋白作为标志物,从电泳结果中应可以看出,被特异抑制的糖基化的蛋比已经糖基化的蛋白泳动速度要快


注意事项
1)与任何体外翻译系统一样,非洲爪蟾卵母细胞体外翻泽系统也应注意尽量避免其内含物具有RNase活性。

2)不同的雌性爪蟾所排出的卵之间的质量是存在差別的,因此在使用前应对卵的活性进行检测。检测卵的受精能力是较为有效的方法。

3)在极其偶然的情况下,一批卵可能不能很好的裂解。这种情况发生的显著性标志是,在制备过程中经第一次离心后提取物不是呈琥珀色而是呈灰色.这种提取物不能很好的进行体外翻评,因此应放弃不用

4)如用于冻存,应将提取物按l00ul//管或更少的量分装到经冰预冷的离心管中,然后置于液氮中1min,冷冻后,提取物最好存于液氮中,但如存于一70℃也可保存其活件数月。

5)如用冻苻的提取物进行翻译反应,应避免进行如T操作:即在融化的提取物中加入所需的各种试剂.然后将反应物一分为_并分别进行翻泽反应。因为经这样操作后,提取物的浓度会被稀释,这将大大影响其反应活性。

6)不同的来源和批次的RNNaseA的纯度是不冋的,因此每一批次使用前应进行滴定,以确定其最适使用浓度。RNNaseA便用浓度一般为0.1〜5ug/ml,浓度过低不能去除内源性RNA的干扰,而过高则会降解后加入的外源性mRNA。

7)在非洲爪蟾卵母细胞体外翻译系统中,大多数来源于比作洲爪擔更高等的真核生物的mRNA时以得到很好的翻译,但是原核生物的mRNA却不行。另外,天然的mRNA比体外合成的mRNA的翻译效率要高.

8)用于体外翻译的mRNA的量在很大程度上取决于其来源与活性。通常,体外合成的mRNA的用量一般为约50ug/ml,而poly(A)+mRNA的用量为100〜200ug/ml,这个用量并未超出提取物进行体外翻泽后修饰的能力。假如超出此用1,则分泌性蛋白的有效分泌将会显著下降,N-糖基化效率将会大幅度降低.但是,即便使用非常高的mRNA的量,也未发现有信号肽末经剪切的情况出现

9)提取物中的甲硫氨酸的含最大约是35umol/L(±10%),因此可以通过TCA-沉淀反应的产物中[35S]〜甲硫氨酸所占的打分比来估计个反应的蛋白质产景。当用单克隆的mRNA进行反应时,产物屮甲硫氨酸的含t能被精确的计算得到;但当用poly(A)1mRNA时.甲硫氨酸的含最一般被合砰的估计为2%。如翻译反应的£3标是尽町能多的获得蛋白质时,那么我们可以通过添加过量的氨基酸以使蛋白的产量增加约体做法是:向提取物中加入约5%体积的包含700umol/L的甲硫氨酸和2mmol/L的所有其他各种氨基酸。

10)作体外翻译反应中:[35S]甲硫氨酸常常被使用,这不仅因为它来源方便,而且因为它在提取物中的含量较低,此可产生较好的信号.但是,当目的蛋白质的甲硫氨酸含极低或是根本不含甲硫氨酸时,可用其他的氨基酸代替甲硫氨酸用于反应。但是,其前提是这些氨基酸要像甲硫氨酸一样在非洲爪蟾卵母细胞中的含量有限,例如:半胱氨酸、亮氨酸、组氨酸和脯氨酸。

11)最好在翻译反应结東时就立即进行蔗糖密度梯度分离反应或蛋白酶保护反应

12)在蛋白酶保护试验中,一些信号肽位于胞质屮的穿膜蛋白会因为所添加的蛋白酶K的剪切作用而使肽链长度有所减少。
 
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