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RNA 干扰慢病毒稳定株筛选
来自 : 蚂蚁淘

小分子RNA干扰技术是一种特异性地阻断某些基因表达的研究手段,在肿瘤、病毒感染,遗传病及其它疾病的治疗中均有广泛应用。慢病毒载体是一类来源于重组逆转录病毒的载体,由于具有可以感染非分裂期与分裂期细胞,容纳大的外源性目的基因片段,免疫反应小等特点,现已成为转移目的基因进入哺乳动物细胞的理想载体。将慢病毒载体应用于RNA干扰当中,可以特异性抑制哺乳动物的各类细胞中基因的表达,成为基因功能研究和基因治疗的有力手段。目前研究表明慢病毒载体能在哺乳动物各类细胞稳定表达siRNA,长期抑制基因表达。为建立细胞模型后续基因治疗提供有效的研究手段。

生博目前为客户筛选过几百种基因的干扰片断,并通过慢病毒得到几十种稳定细胞株。为后续研究基因治疗提供了有效依据。

BXXX1基因干扰稳定HeLa细胞株构建

第一部分:BXXX1干扰载体构建(载体pMagic4.1)

siRNA设计:

MarkergeneGeneIDTargetSeqGC%
KD1BXXX1NM_XXX4 GCCXXXXXXXXXXXXXGA47.4 
KD2BXXX1NM_XXX4GGTXXXXXXXXXXXXXTAT52.6
KD3BXXX1NM_XXX4CCAXXXXXXXXXXXXXTTT52.6
KD4 BXXX1NM_XXX4GCAXXXXXXXXXXXXXGAA47.4
pLVT4NC TTCTCCGAACGTGTCACGT 52.6

 

第二部分QPCR筛靶实验

Real-timePCR检测结果显示:HeLa细胞中,相对NC组,四个靶点中,KD2,KD4对目的基因BXXX1的表达的敲减效率达到80%以上,KD3对目的基因BXXX1的表达的敲减效率也达到50%以上,都是有效靶点。

 

第三部分Westernblot内源验证实验报告

WesternBlot检测结果

样品说明:

M  为Marker;

1 CON为正常目的空细胞(HeLa)样品;

2 NC为正常目的细胞(HeLa),加阴性对照病毒感染的细胞样品(NegativeControl);

3 KD为正常目的细胞(HeLa),加RNAi靶点病毒感染的细胞样品(KnockDown)

从WesternBlot结果可以看出,KD1,KD2靶点对HeLa细胞BXXX1的表达有敲减效果,为有效靶点。

第四部分:干扰慢病毒KD1.、对照慢病毒CMV-GFP-L.V.感染HeLa细胞株后筛选稳定株。

HeLa
 白光组Whitelight荧光组Fluoresce 
稀释度Day3,100× 
Blank
KD1MOI10
KD1MOI20
CMV-GFPMOI10
CMV-GFPMOI20 

 

三、实验总结:

1、HeLa细胞感染KD1.慢病毒,MOI10、MOI20时毒性大,死细胞多。若只计活细胞,感染效率高,都超过80%。

2、HeLa细胞感染CMV-GFP-L.V.慢病毒,MOI10、MOI20时感染效率高,都超过90%。

3、传代培养后,最终筛选出HeLa-KD1MOI10稳定株,HeLa-KD1MOI20稳定株、HeLa-CMV-GFPMOI20稳定株。

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