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NP40以及菌体/细胞裂解法
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细胞裂解分析化学,论坛,化学分析,仪器分析,分析测试,色谱,电泳,光谱u5kLlIOT采用温和的裂解条件,不能破坏细胞内存在的所有蛋白质-蛋白质分析化学论坛~O/b:te}相互作用,多采用非离子变性剂(NP40或TritonX-100)。每种细胞的裂解条件是不一样的,通过经验确定。不能用高浓度的变性剂(0.2%SDS),细胞裂解液中要加各种酶抑制剂,如商品化的cocktailer。2、如何得到比较纯的包涵体对于包涵体的纯化,包涵体的前处理是很重要的。包涵体中主要含有重组蛋白,但也含有一些细菌成分,如一些外膜蛋白、质粒DNA和其它杂质。洗涤常用1%以下的中性去垢剂,如Tween、Triton、Lubel和NP40等加EDTA和还原剂2-巯基苏糖醇(DTT)、β-巯基乙醇等反复多次进行,因去垢剂洗涤能力随溶液离子强度升高而加强,在洗涤包涵体时可加50mMNaCL。这样提取的包涵体纯度至少可达50%以上,而且可保持元结构。也可用低浓度的盐酸胍或尿素/中性去垢剂/EDTA/还原剂等洗去包涵体表面吸附的大部分不溶性杂蛋白。洗涤液pH以与工程菌生理条件相近为宜,使用的还原剂为0.1-5mM。EDTA为0.1-0.3mM。去垢剂如TritonX-100、脱氧胆酸盐和低浓度的变性剂如尿素充分洗涤去除杂质,这一步很重要,因为大肠杆菌外膜蛋白OmpT(37KDa)在4-8mol/L尿素中具有蛋白水解酶活性,在包涵体的溶解和复性过程中可导致重组蛋白质的降解。1.2.5DNA片段分析SGC-7901感染Ad-p27mt和Ad-LacZ48h后离心去上清,在剩余细胞沉淀中加500mL的细胞裂解液(10g/LNp40,20mmol/LEDTA,50mmol/LTris-HCl(pH7.5)]和10mL蛋白酶K.在56℃水浴中加热1-2h,用苯酚和氯仿提取,然后用脱水酒精沉淀DNA.在700mL/L酒精洗涤一次后加入200mLTE.然后再加入RNA酶(最终浓度为50mL/L),37℃下过夜.然后在101.3DNA琼脂糖凝胶电泳检测细胞凋亡1×106细胞在含50μg/ml顺铂的培养液中培养12h,离心沉淀后,加入细胞裂解液(1%NP40,20mmol/LEDTApH8.0,50mmol/LTris-clpH7.5),离心取上清加入10%SDS、蛋白酶K,50℃孵育2h,再加入RNaseA室温放置1h。酚、氯仿抽提,取10μlDNA,70℃放5min后,15g/L琼脂糖凝胶,4V/cm电泳3h,观察结果并照像保存。一、反复冻融法:1、将细胞在-20度以下冰冻,室温融解,反复几次,由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。

2、至少3次以上冻溶。

3、IFCC推荐法:收集细胞悬液,4℃低温离心(3000rpm,5min),弃上清,加入一定量PBS(200ul),轻轻吹打混匀,-200C冷冻30min,370C解冻,如此反复3次,可形成细胞裂解液。

4、用液氮冻融三四次就可以了,细胞冻住后,取出放37度水浴,溶解后震荡,再冻

二、超声波处理法1、要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间,这些都有利于保护酶的活性。我的实验超声时间5秒、间隙时间10秒、工作次数20次。

2、每个样本超声时间5秒,每个间隔5秒,粉碎5次。

3、100ml菌液离心,用8ml缓冲液悬浮,加8mg溶菌酶,冰浴30min,然后超声处理。750W40%功率。5秒超声,9秒间隔。超声至少90min。

4、综合冻融和超声的方法:1500g离心,弃除上清。冰上,用小体积PBS重悬细胞。将重悬液集中,1500g离心浓缩,弃除上清。液氮骤冷。用约5倍体积的PBS缓冲液重悬细胞,并搅拌。可选择:4℃下超声破碎细胞。加入终浓度为0.25M的KCl,15mM的DTT。4℃下111500g×60min离心裂解液。取出上清。过柱子。PurificationofGST-FusionProteinsfromE.coli-AlternateProtocol

三、渗透法:冰冷的20mmol/LTris-Cl(pH8.0),2.5mmol/LEDTA处理,冰浴放置10min。《精编分子生物学实验指南》

四、裂解液处理法:1、细胞裂解液:50mmol/LTris-ClpH6.8,100mmol/LDTT,2%SDS,0.1%溴酚蓝,10%甘油。SDS是阴离子型表面活性剂、极易促溶、强变性作用。

2、在loADIngbuffer加SDS,100度5分钟,是变性方法。SDS与蛋白等量结合,可以通过条带位移判断蛋白大小,考染不会影响结果。

3、如果是做小量菌液,跑PAGE胶看其表达情况的话,可以直接加蛋白loadingbuffer煮沸5分钟即可,需注意的是上样前要离心12000rpm至少5分钟,然后上样时,枪头别吸最底下的。

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