PCR扩增产物鉴定与纯化
实验原理
实验试剂
实验设备
实验材料
实验步骤
1. 使用1×TAE缓冲液制作琼脂糖凝胶,然后对目的DNA进行琼脂糖凝胶电泳。(参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验)
2. 在紫外灯下切出含有目的DNA(约600bp)的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面的液体。此时应注意尽量切除不含目的DNA部分的凝胶,尽量减小凝胶体积,提高DNA回收率。
注意:切胶时请注意不要将DNA长时间暴露于紫外灯下,以防止DNA损伤。
3. 切碎胶块。胶块切碎后可以加快操作步骤6的胶块融化时间,提高DNA的回收率。
4. 称量胶块重量,计算胶块体积。计算胶块体积时,以1mg=1µL进行计算。
5. 向胶块中加入胶块融化液DR-IBuffer,DR-IBuffer的加量如下表:
凝胶浓度 | DR-IBuffer使用量 |
1% | 3个凝胶体积量 |
1%-1.5% | 4个凝胶体积量 |
1.5%-2% | 5个凝胶体积量 |
6. 均匀混合后75℃加热,融化胶块(低熔点琼脂糖凝胶只需在45℃加热)。此时应间断振荡混合,使胶块充分融化(约6~10分钟)。
注意:胶块一定要充分融化,否则将会严重影响DNA的回收率。
7. 向上述胶块融化液中加入DR-IBuffer量的1/2体积量的DR-IIBuffer,均匀混合。当分离小于400bp的DNA片段时,应在此溶液中再加入终浓度为20%的异丙醇。
8. 将试剂盒中的SpinColumn安置于CollectionTube上。
9. 将上述操作7的溶液转移至SpinColumn中,12000rpm离心1min,弃滤液。
注意:如将滤液再加入SpinColumn中离心一次,可以提高DNA的回收率。
10.将500µL的RinseA加入SpinColumn中,12000rpm离心30s,弃滤液。
11.将700µL的RinseB加入SpinColumn中,12000rpm离心30s,弃滤液。
12.重复操作步骤11。
13.将SpinColumn安置于新的1.5mL的离心管上,在SpinColumn膜的中央处加入25µL的灭菌蒸馏水或ElutionBuffer,室温静置1min。
注意:使用加热至60℃的灭菌蒸馏水或ElutionBuffer有利于提高洗脱效率。
14.12000rpm离心1min洗脱DNA。
-20℃低温保存纯化的目的DNA片段。