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PCR扩增产物鉴定与纯化
来自 : mayitao

PCR扩增产物鉴定与纯化

实验原理

琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验)
本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(AgaroseGelDNAPurificationKit),该试剂盒是从琼脂糖凝胶中回收并纯化DNA片段的试剂盒。试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DNA制备膜技术,具有高效、快速、方便的特点,全套操作只需30min便可完成。使用该试剂盒每次可纯化得到多至10µg的DNA片段(100bp~30kb),回收率高达50~80%。本试剂盒回收纯化的DNA片段纯度高,完整性好,可直接用于连接反应、PCR扩增、DNA测序等各种分子生物学实验。
经胶纯化试剂盒回收的DNA片段采用-20℃低温保存,延缓DNA的降解。

实验试剂

1.PCR扩增产物
2.AgaroseGelDNAPurificationKit(TaKaRa)
3.琼脂糖
4.1×TAE
5.6×LoadingBuffer
6.DNAMarker2000

实验设备

1.琼脂糖凝胶电泳系统
2.紫外透射仪
3.台式离心机
4.移液枪(配套枪头)
5.-20℃低温冰箱
6.分析天平

实验材料

1.单面刀片
2.纯化试剂盒
3.1.5mL离心管
4.超纯水(无菌)

实验步骤

1. 使用1×TAE缓冲液制作琼脂糖凝胶,然后对目的DNA进行琼脂糖凝胶电泳。(参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验)

2. 在紫外灯下切出含有目的DNA(约600bp)的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面的液体。此时应注意尽量切除不含目的DNA部分的凝胶,尽量减小凝胶体积,提高DNA回收率。

    注意:切胶时请注意不要将DNA长时间暴露于紫外灯下,以防止DNA损伤。

3. 切碎胶块。胶块切碎后可以加快操作步骤6的胶块融化时间,提高DNA的回收率。

4. 称量胶块重量,计算胶块体积。计算胶块体积时,以1mg=1µL进行计算。

5. 向胶块中加入胶块融化液DR-IBuffer,DR-IBuffer的加量如下表:

 

  凝胶浓度   DR-IBuffer使用量 
  1%   3个凝胶体积量
  1%-1.5%   4个凝胶体积量
  1.5%-2%   5个凝胶体积量

 

6. 均匀混合后75℃加热,融化胶块(低熔点琼脂糖凝胶只需在45℃加热)。此时应间断振荡混合,使胶块充分融化(约6~10分钟)。

    注意:胶块一定要充分融化,否则将会严重影响DNA的回收率。

7. 向上述胶块融化液中加入DR-IBuffer量的1/2体积量的DR-IIBuffer,均匀混合。当分离小于400bp的DNA片段时,应在此溶液中再加入终浓度为20%的异丙醇。

8. 将试剂盒中的SpinColumn安置于CollectionTube上。

9. 将上述操作7的溶液转移至SpinColumn中,12000rpm离心1min,弃滤液。

    注意:如将滤液再加入SpinColumn中离心一次,可以提高DNA的回收率。

10.将500µL的RinseA加入SpinColumn中,12000rpm离心30s,弃滤液。

11.将700µL的RinseB加入SpinColumn中,12000rpm离心30s,弃滤液。

12.重复操作步骤11。

13.将SpinColumn安置于新的1.5mL的离心管上,在SpinColumn膜的中央处加入25µL的灭菌蒸馏水或ElutionBuffer,室温静置1min。

    注意:使用加热至60℃的灭菌蒸馏水或ElutionBuffer有利于提高洗脱效率。

14.12000rpm离心1min洗脱DNA。

                -20℃低温保存纯化的目的DNA片段。

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