一.常用贮液与溶液
1mol/L亚精胺(Spermidine):溶解2.55g亚精胺于足量的水中,使终体积为10ml。分装成小份贮存于-20℃。
1mol/L精胺(Spermine):溶解3.48g精胺于足量的水中,使终体积为10ml。分装成小份贮存于-20℃。
10mol/L乙酸胺(ammoniumacetate):将77.1g乙酸胺溶解于水中,加水定容至1L后,用0.22um孔径的滤膜过滤除菌。
10mg/ml牛
血清蛋白(BSA):加100mg的牛血清蛋白(组分V或分子生物学试剂级,无DNA酶)于9.5ml水中(为减少变性,须将蛋白加入水中,而不是将水加入蛋白),盖好盖后,轻轻摇动,直至牛血清蛋白完全溶解为止。不要涡旋混合。加水定容到10ml,然后分装成小份贮存于-20℃。
1mol/L二硫苏糖醇(DTT):在二硫苏糖醇5g的原装瓶中加32.4ml水,分成小份贮存于-20℃。或转移100mg的二硫苏糖醇至微量离心管,加0.65ml的水配制成1mol/L二硫苏糖醇溶液。
8mol/L乙酸钾(potassiumacetate):溶解78.5g乙酸钾于足量的水中,加水定容到100ml。
1mol/L氯化钾(KCl):溶解7.46g氯化钾于足量的水中,加水定容到100ml。
3mol/L乙酸钠(sodiumacetate):溶解40.8g的三水乙酸钠于约90ml水中,用冰乙酸调溶液的pH至5.2,再加水定容到100ml。
0.5mol/LEDTA:配制等摩尔的Na2EDTA和NaOH溶液(0.5mol/L),混合后形成EDTA的三钠盐。或称取186.1g的Na2EDTA·2H2O和20g的NaOH,并溶于水中,定容至1L。
1mol/LHEPES:将23.8gHEPES溶于约90ml的水中,用NaOH调pH(6.8-8.2),然后用水定容至100ml。
1mol/LHCl:加8.6ml的浓盐酸至91.4ml的水中。
25mg/mlIPGT:溶解250mg的IPGT(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷)于10ml水中,分成小份贮存于-20℃。
1mol/LMgCl2:溶解20.3gMgCl2·6H2O于足量的水中,定容到100ml。
100mmol/LPMSF:溶解174mg的PMSF(苯甲基磺酰氟)于足量的异丙醇中,定容到10ml。分成小份并用铝箔将装液管包裹或贮存于-20℃。
20mg/ml蛋白酶K(proteinaseK):将200mg的蛋白酶L加入到9.5ml水中,轻轻摇动,直至蛋白酶K完全溶解。不要涡旋混合。加水定容到10ml,然后分装成小份贮存于-20℃。
10mg/mlRnase(无DNase)(DNase-freeRNase):溶解10mg的胰蛋白RNA酶于1ml的10mmol/L的乙酸钠水溶液中(pH5.0)。溶解后于水浴中煮沸15min,使DNA酶失活。用1mol/L的Tris-HCl调pH至7.5,于-20℃贮存。(配制过程中要戴手套)
5mol/L氯化钠(NaCl):溶解29.2g氯化钠于足量的水中,定容至100ml。
10N氢氧化钠(NaOH):溶解400g氢氧化钠颗粒于约0.9L水的烧杯中(
磁力搅拌器搅拌),氢氧化钠完全溶解后用水定容至1L。
10%SDS(十二烷基硫酸钠):称取100gSDS慢慢转移到约含0.9L的水的烧杯中,用磁力搅拌器搅拌直至完全溶解。用水定容至1L。
2mol/L山梨(糖)醇(Sorbitol):溶解36.4g山梨(糖)醇于足量水中使终体积为100ml。
100%三氯乙酸(TCA):在装有500gTCA的试剂瓶中加入100ml水,用磁力搅拌器搅拌直至完全溶解。(稀释液应在临用前配制)
2.5%X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷):溶解25mg的X-gal于1ml的二甲基甲酰胺(DMF),用铝箔包裹装液管,贮存于-20℃。
100×Denhardt试剂(Denhardt"sregent)
成分及终浓度 | 配制100ml溶液各成分的用量 |
2%聚蔗糖(Ficoll,400型)2%聚乙烯吡咯烷酮(PVP-40)2%BSA(组分V)水 | 2g2g2g加水至总体积为100ml |
依照上表称取各组分,溶于水中定容。过滤除菌及杂质,分装成小份于-20℃贮存。
10×标准DNA
连接酶缓冲液(standardDNAligasebuffer)(粘端、平端连接)
成分及终浓度 | 配制10ml溶液各成分的用量 |
0.5mol/LTris-HCl100mmol/LMgCl2100mmol/LDTT2mmol/LATP5mmol/L盐酸亚精胺(可选)0.5mg/mlBSA(组分V)(可选)水 | 5ml1mol/L贮液1ml1mol/L贮液1ml1mol/L贮液200ul100mmol/L贮液50ul1mmol/L贮液0.5ml10mg/mL贮液2.25ml |
将配制好的缓冲液分装成小份,贮存于-20℃。
100mmol/LdNTP溶液(dNTPsolutions)可以购买到100mmol/L纯dNTPs贮液,-80℃可贮存至少6个月。
10mmol/LdNTP混合液
成分及终浓度 | 配制20ul溶液各成分的用量 |
10mmol/LdATP10mmol/LdCTP10mmol/LdGTP10mmol/LdTTP水 | 2ul100mmol/LdATP贮液2ul100mmol/LdCTP贮液2ul100mmol/LdGTP贮液2ul100mmol/LdTTP贮液12ul |
20%PEG8000/2.5MNaCl
成分及终浓度 | 配制10ml溶液各成分的用量 |
质量浓度为20%聚乙二醇2.5mol/L氯化钠水 | 20g50ml5mol/L氯化钠或14.6g固体氯化钠补足100ml |
加聚乙二醇于含有氯化钠的烧杯中,加水至终体积100ml,用磁力搅拌器搅拌溶解。
20×SSC
成分及终浓度 | 配制1L溶液各成分的用量 |
300mmol/L柠檬酸三钠(二水)3mol/L氯化钠水 | 88.2g175.3g补足1L |
溶解柠檬酸三钠(二水)和氯化钠于约0.9L水中,加几滴10NNaOH溶液调pH为7.0,用水补足体积至1L。
DEPC(焦碳酸二乙酯)处理水加100ulDEPC于100ml水中,使DEPC的体积分数为0.1%。在37℃温浴至少12h,然后在15psi条件下高压灭菌20min,以使残余的DEPC失活。DEPC会与胺起反应,不可用DEPC处理Tris缓冲液。
甲酰胺(deionizedformamide)直接购买或加DowexXG8混合树脂于装有甲酰胺的玻璃烧杯中,用磁力搅拌器轻轻搅拌1h,可去除甲酰胺中的离子。经Whatman1号滤纸过滤除去树脂后分成小份,充氮气于-80℃贮存(防止氧化)。
磷酸缓冲液(phosphatebuffer)按照下表所给定的体积,混合1mol/L的磷酸二氢钠(单碱)和1mol/L磷酸氢二钠(双碱)贮液,获得所需pH的磷酸缓冲液。配制1mol/L的磷酸二氢钠(NaH2PO4·H2O)贮液:溶解138g于足量水中,使终体积为1L;1mol/L磷酸氢二钠(Na2HPO4)贮液:溶解142g于足量水中使终体积为1L。
1mol/L磷酸二氢钠(ml) | 1mol/L磷酸氢二钠(ml) | 最终pH值 |
877850815775735685625565510450390330280 | 123150185225265315375435490550610670720 | 6.06.16.26.36.46.56.66.76.86.97.07.17.2 |
TE(用于悬浮和贮存DNA)
成分及终浓度 | 配制100ml溶液各成分的用量 |
10mmol/LTris-HCl1mmol/LEDTA水 | 1ml1mol/LTris-HCl(pH7.4-8.0,25℃)200ul0.5mol/LEDTA(pH8.0)98.8ml |
Tris缓冲液(Tris-HClbuffer)将121g的Tris碱溶解于约0.9L水中,再根据所要求的pH(25℃下)加一定量的浓盐酸(11.6N),用水调整终体积至1L。
浓盐酸的体积(ml) | pH |
8.6142128.53846566671.376 | 9.08.88.68.48.28.07.87.67.47.2 |
电泳缓冲液
50×Tris-乙酸(TAE)缓冲液
成分及终浓度 | 配制1L溶液各成分的用量 |
2mol/LTris碱1mol/L乙酸100mmol/LEDTA水 | 242g57.1ml的冰乙酸(17.4mol/L)200ml的0.5mol/LEDTA(pH8.0)补足1L |
5×Tris-硼酸(TBE)缓冲液
成分及终浓度 | 配制1L溶液各成分的用量 |
445mmol/LTris碱445mmol/L硼酸盐10mmol/LEDTA水 | 54g27.5g硼酸20ml的0.5mol/LEDTA(pH8.0)补足1L |
染料
1%溴酚蓝(bromophenolblue)加1g水溶性钠型溴酚蓝于100ml水中,搅拌或涡旋混合直到完全溶解。
1%二甲苯青FF(xylenecyanoleFF)溶解1g二甲苯青FF于足量水中,定容到100ml。
10mg/ml的溴化乙锭(ethidiumbromide)小心称取1g溴化乙锭,转移到广口瓶中,加100ml水,用磁力搅拌器搅拌直到完全溶解。用铝箔包裹装液管,于4℃贮存。
凝胶上样液(gello
ADIngsolutions)6×碱性凝胶上样液(室温贮存)
成分及终浓度 | 配制10ml溶液各成分用量 |
0.3N氢氧化钠6mmol/LEDTA18%聚蔗糖(400型)0.15%溴甲酚绿0.25%二甲苯青FF水 | 300ul10N氢氧化钠120ul0.5mol/LEDTA(pH8.0)1.8g15mg25mg补足到10ml |
6×聚蔗糖凝胶上样液(室温贮存)
成分及终浓度 | 配制10ml溶液各成分用量 |
0.15%溴酚蓝0.15%二甲苯青FF5mmol/LEDTA15%聚蔗糖(400型)水 | 1.5ml1%溴酚蓝1.5ml1%二甲苯青FF100ul0.5mol/LEDTA(pH8.0)1.5g补足到10ml |
6×溴酚蓝/二甲苯青/聚蔗糖凝胶上样液(室温贮存)
成分及终浓度 | 配制10ml溶液各成分用量 |
0.25%溴酚蓝0.25%二甲苯青FF15%聚蔗糖(400型)水 | 2.5ml1%溴酚蓝2.5ml1%二甲苯青FF1.5g补足到10ml |
6×甘油凝胶上样液(4℃贮存)
成分及终浓度 | 配制10ml溶液各成分用量 |
0.15%溴酚蓝0.15%二甲苯青FF5mmol/LEDTA50%甘油水 | 1.5ml1%溴酚蓝1.5ml1%二甲苯青FF100ul0.5mol/LEDTA(pH8.0)3ml3.9ml |
6×蔗糖凝胶上样液(室温贮存)
成分及终浓度 | 配制10ml溶液各成分用量 |
0.15%溴酚蓝0.15%二甲苯青FF5mmol/LEDTA40%聚蔗糖水 | 1.5ml1%溴酚蓝1.5ml1%二甲苯青FF100ul0.5mol/LEDTA(pH8.0)4g补足到10ml |
10×十二烷基硫酸钠/甘油凝胶上样液(室温贮存)
成分及终浓度 | 配制10ml溶液各成分用量 |
0.2%溴酚蓝0.2%二甲苯青FF200mmol/LEDTA0.1%SDS50%甘油水 | 20mg20mg4ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)100ul10%SDS5ml补足到10ml |
LB培养基将下列组分溶解在0.9L水中:
如果需要用1NNaOH(~1ml)调整pH至7.0,再补足水至1L。注:琼脂平板需添加琼脂粉12g/L,上层琼脂平板添加琼脂粉7g/L。
SOB培养基将下列组分溶解在0.9L水中:
蛋白胨 | 20g |
酵母提取物 | 5g |
氯化钠 | 0.5g |
1mol/L氯化钾 | 2.5ml |
用水补足体积到1L。分成100ml的小份,高压灭菌。培养基冷却到室温后,再在每100ml的小份中加1ml灭过菌的1mol/L氯化镁。
SOC培养基成分、方法同SOB培养基的配制,只是在培养基冷却到室温后,除了在每100ml的小份中加1ml灭过菌的1mol/L氯化镁外,再加2ml灭菌的1mol/L葡萄糖(18g葡萄糖溶于足够水中,再用水补足到100ml,用0.22um的滤膜过滤除菌)。
TB培养基将下列组分溶解在0.9L水中:
各组分溶解后高压灭菌。冷却到60℃,再加100ml灭菌的170mmol/LKH2PO4/0.72mol/LK2HPO4的溶液(2.31g的KH2PO4和12.54gK2HPO4溶在足量的水中,使终体积为100ml。高压灭菌或用0.22um的滤膜过滤除菌)。
2×YT培养基将下列组分溶解在0.9L水中:
如果需要用1NNaOH(~1ml)调整pH至7.0,再补足水至1L。注:琼脂平板需添加琼脂粉12g/L,上层琼脂平板添加琼脂粉7g/L。
YPD培养基将下列组分溶解在0.9L水中:
用水补足体积为1L后,高压灭菌。建议在高压灭菌之前,对色氨酸营养缺陷型每升培养基添加1.6g色氨酸,因为YPD培养基是色氨酸限制型培养基。为了配制平板,需要在高压灭菌前加入20g琼脂粉。
氨苄青霉素(ampicillin)(100mg/ml)溶解1g氨苄青霉素钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以25ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
羧苄青霉素(carbenicillin)(50mg/ml)溶解0.5g羧苄青霉素二钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以25ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
甲氧西林(methicillin)(100mg/ml)溶解1g甲氧西林钠于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以37.5ug/ml终浓度与100ug/ml氨苄青霉素一起添加于生长培养基。
卡那霉素(kanamycin)(10mg/ml)溶解100mg卡那霉素于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
氯霉素(chloramphenicol)(25mg/ml)溶解250mg氯霉素足量的无水乙醇中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以12.5ug/ml~25ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
链霉素(streptomycin)(50mg/ml)溶解0.5g链霉素硫酸盐于足量的无水乙醇中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
萘啶酮酸(nalidixicacid)(5mg/ml)溶解50mg萘啶酮酸钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。分装成小份于-20℃贮存。常以15ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
四环素(tetracyyline)(10mg/ml)溶解100mg四环素盐酸盐于足量的水中,或者将无碱的四环素溶于无水乙醇,定容至10ml。分装成小份用铝箔包裹装液管以免溶液见光,于-20℃贮存。常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。