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蚂蚁淘实验室:土壤DNA提取试剂盒应用实例
来自 : 蚂蚁淘

土壤的成分包括矿物质、粘土等无机物、植物及植物的遗体、腐殖物质等土壤有机物以及在土壤中存在的微生物。

目录
  1. 1土壤DNA提取的难点

  2. 2原理与操作

  3. 3试剂盒组成

  4. 4应用实例

土壤DNA提取试剂盒土壤DNA提取的难点

从土壤中提取的DNA,是微生物、动植物遗体等的总DNA,同时,腐殖物质的性质与DNA很相似,DNA提取过程中会将腐殖等物质一起纯化,采用传统的DNA提取方法来除去腐殖物质等抑制因子是十分困难的。而这些腐殖物质会抑制聚合酶链式反应(PCR)及限制性酶切等。因而,从土壤中提取DNA,腐殖物质等抑制因子的除去干净是重中之重。广州捷倍斯生物科技有限公司根据腐殖物质等特点,发明了高效的腐殖酸吸附剂,再与硅胶柱纯化的技术结合,开发出了高效土壤DNA提取试剂盒(SoilDNAKit),已为广大客户所采用,完全能够替代价格昂贵的进口产品。

土壤DNA提取试剂盒原理与操作

土壤样品加入悬浮缓冲液BufferC1,并加入玻璃珠与专利的腐殖酸吸附剂BufferC2,涡旋使土壤充分重悬,腐殖物质充分释放,让吸附剂有效吸附腐殖酸。再加入高效的裂解液BufferC3并涡旋在玻璃珠的摩擦作用下,裂解土壤中的所有生物包括G细菌、酵母菌、真菌、藻类、线虫甚至真细菌的孢子、芽孢、动植物遗体等,游离DNA。之后,再加入沉淀剂BufferC4,离心沉淀除去土壤残渣、吸附有腐殖酸的吸附剂、多糖多酚、绝大部分的色素等,获得清亮的、含有DNA的上清,上清加入异丙醇沉淀获得DNA粗品。粗品中加入ddH2O溶解后,再加入BufferC5离心进一步除去腐殖酸等杂质,获得上清,往上清加入乙醇后转移到硅胶纯化柱中过柱吸附DNA,除去杂质。再加入漂洗液BufferWB离心进一步除去蛋白质、腐殖酸等杂质,加入漂洗液DNAWashBuffer除去盐分等。干燥柱子后加入灭菌去离子水后,离心获得高纯的DNA。

土壤DNA提取试剂盒试剂盒组成

产品编号

D8101

D8105

D8106

次数

5

50

100

纯化柱子

5

50

100

收集管

5

50

100

BufferC1

4ml

39ml

80ml

BufferC2

700μl

6ml

12ml

BufferC3

700μl

6ml

12ml

BufferC4

700μl

10ml

16ml

BufferC5

2ml

20ml

37ml

GlassBeads

2g

20g

40g

BufferWB

3ml

30ml

55ml

DNAWashBuffer

2ml

20ml

2x20ml

说明书

1

1

1

土壤DNA提取试剂盒应用实例

腐殖酸吸附剂使用效果比较:

BufferC2为独特的腐殖酸吸附剂,在裂解时加入BufferC2。左图,为样品裂解后离心获得的上清,加有BufferC2的裂解液明显颜色浅很多。

1,2:裂解时加有BufferC2

3,4:裂解时不加BufferC2

裂解液加BufferC4进一步沉淀除杂效果:

上一步获得的裂解液上清加入BufferC4进一步处理,沉淀离心除杂,裂解时加有BufferC2(腐殖酸吸附剂)的,再经BufferC4处理几乎不再有染色,而不加BufferC2的颜色还很深。

1,2:裂解时加有BufferC2

3,4:裂解时不加BufferC2

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