海报|生物基因有限公司,Circ RNA的发家史-蚂蚁淘生物

Circ RNA才逐渐走进了科研工作者视线中2013年在Natrue中刊登了关于Circ RNA充当分子海绵作用的文献2012年分子生物学家Julia Salzman通过RNA-Seq首次报道了Circ RNA

1990s中人类中发现Circ RNA，但当时绝大数科学研究者认为RNA是线状的，误把Circ RNA当作实验人工产物或者遗传意外产物。

1970s在RNA病毒种发现

Circ RNA

Circ RNA是一类由特殊的可变剪切产生的非编码RNA，它不具有5 末端帽子和3 末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构（图1），使其具有高度的保守性，不易被降解，表达更稳定。目前大量的研究表明Circ RNA分子含有micro RNA（miRNA）和RNA结合蛋白（RBP）结合位点（图2），在细胞中起到mi RNA海绵和反式作用因子的作用。因此在疾病的发生发展中发挥着重要的调控作用。正因Circ RNA的分子结构特以及重要的调控作用，Circ RNA虽然大规模研究时间不长，但研究热潮早已升起。

$\"\"$ 图1 Circ RNA的生源论

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图2 CircRNA功能示意图

随着近几年高通量测序技术的快速发展，也使得Circ RNA的大规模发现成为可能，如目前在circbase中人类Cric RNA已过9万条。然对于绝大多数的Circ RNA的功能研究仍然未知，目前可利用通过高通量测序平台进行测序分析。

我们诺唯赞信息分析中心根据Circ RNA特有的分子特征，对测序所得的原始测序数据（raw reads），经过质控过滤得到后续分析可用高质量数据，随后通过比对软件将其比对到参考序列中，对于不能mapping到基因组上的reads，通过分析方法，并选取将unmapped reads与参考基因组比对，对unmapped reads采用反向剪接的算法提取出反向剪切的junction，最后利用该软件将Circ RNA 提取出来，从而鉴定出Circ RNA，同时也利用这些反向剪接的unmapped reads计算出Circ RNA的表达量，获得样品中Circ RNA的信息，为后续的功能分析提供理论依据（图3）。

$\"\"$ 图3 Circ RNA 的生物信息分析流程图

参考文献

[1] Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency.

[2] Circular RNAs: Identification, biogenesis and function.

[3] Comparison of circular RNA prediction tools.

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