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来自革兰氏阳性细菌的自诱导肽 (AIP) 允许细胞间通讯，称为群体感应。 AIP 通常有专门的出口商；它们从细菌中释放出来，然后细胞外的浓度被连接到双组分系统的受体感知。多种受体可能识别 AIP，而已知来自不同物种的 AIP 会抑制彼此的受体结合。

AIP 允许对细胞密度和生长阶段做出协调反应，以调节各种化合物的表达，尤其是毒力因子、遗传能力和抗菌肽。在某些情况下，例如来自乳酸乳球菌的乳链菌肽，AIP 可以具有群体感应和抗菌肽的双重功能。

AIP 在群体感应中的重要性从与它们一起发现的大量生物体中可见一斑以及允许细胞间通信的多个群体感应系统的存在。由于它们在细胞生长和毒力中的流行和关键作用，正在进行广泛的研究，以尝试和了解如何利用 AIP 来抑制革兰氏阴性人类病原体的感染。

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YSTCDFIM（硫内酯 4-8）

GVNACSSF（硫内酯 5-9）

INCDFLL（硫内酯 3-7）

YSTCYFIM（硫内酯 4-8）

Accelrys公司（Pharmacopeia公司全资子公司，Nasdaq: PCOP）宣布，他们用GeneAtlas? 软件对人类蛋白质组功能蛋白的注释数量，与已经发表的数量相比，提高了将近20%。这些新的功能注释有效地将一些难以破译的序列转化成上千个潜在的新药作用靶点，正等待进一步的实验验证。这次新的功能注释是AtlasStore数据库的一部分，这个数据库只对 Accelrys公司功能基因组协会的会员开放。　　GeneAtlas?是Accelrys公司提供的自动高通量分析和注释工具，已经功能性的注释了在Ensembl数据库中29,000多个可能的开放阅读框架中的89%。这个自动的分析工具对于一多半的ORF都产生了三维蛋白结构，而剩余的一些序列发现与已知的序列同源，或者通过进行功能比较，发现具有化学上相似的活性位点。　　Accelrys公司生命科学部的首席副经理Dr. Scott Kahn说：“这组由GeneAtlas?得到的预测结果，数量与目前存在的数量或者用通常的技术方法可以得到的数量有非常明显的提高，序列分析和三维结构分析合并成为一个完整的靶点发现平台，提高了可以破译的人类基因组的数量，多样性分析提供了一个对预测进行内部交叉的验证，从而可以达到以前不可能达到的较高水平的精确度。这些新预测的蛋白为下一代药物作用靶位点提供了无数的机遇，并且可以让人更加了解药物由于遗传背景差异产生效用不同的原因。”　　关于Accelrys公司的功能基因组协会　　功能基因组协会是去年发起的，可以为会员提供已知功能的蛋白序列的最完整的资料。由于基因组序列是公开的，他们被自动地由协会的核心技术GeneAtlas?处理，做高通量的序列和结构的分析。这些结果被储存在AtlasStore, 一个包括蛋白序列、结构和化学、功能信息的完整的数据库中。这个国际项目的目的是发布新的自动分析技术和高质量的功能预测技术，从而加快靶点的筛选、药物的发现并且帮助使药物基因组数据更加合理化。　　Pharmacopeia公司在加速和提高药物发现和化学材料开发的进程中提供科学和技术支持方面处于领先地位。Pharmacopeia的软件子公司Accelrys, 开发并且销售分子模建软件，用于生命科学、材料研究、化学信息学以及决策支持系统，并且提供生物信息学工具包括基因序列分析，还包括为客户提供药物发现和化学材料开发方面的咨询服务。Pharmacopeia公司Drug Discovery 软件包集成了其独有的小分子组合、医用化学、高通量筛选、体外药理学、计算方法学和信息学等技术来发现和优化先导化合物。 Pharmacopeia公司员工接近750人，总部位于Princeton。