随着个人电脑、网络技术、关系数据库管理技术的快速发展，开发基于个人电脑的分子模拟软件，已经成为广大科研人员的迫切要求。顺应这一要求，全球最大的分子模拟、化学信息学和生物信息学产品与服务的提供商 - 美国Accelrys公司于2002年10月2日正式推出了基于个人电脑的分子模拟产品：Discovery Studio Modeling。　　Discovery Studio Modeling（简称DS Modeling），是全球第一个可以通过基于Windows系统的个人电脑访问到的、面向生命科学领域的完整的分子建模和模拟环境。它服务于结构生物学家、计算生物学家、结构化学家和计算化学家，满足他们希望建模和模拟软件具有专家水平、易于学习且功能强大的诸多要求。通过高质量的图形、历经多年验证的技术以及集成的环境，DS Modeling提供序列和分子三维结构的表征、显示、分析工具以及蛋白质靶点建模工具。无论是计算方面的专业人员，还是这个领域的新手，都能够方便地使用这个软件。DS Modeling将包括以下模块：DS Modeling Visualizer：DS Modeling客户端-服务器结构的可视化界面。提供序列和分子三维结构的表征、显示、分析和建模功能。图形化的界面便于使用。同时，DS Modeling中的其他功能模块需要通过Visualizer进行调用。DS ProjectKM：基于Oracle的关系数据库工作环境，通过它，不同研究小组之间可以进行项目、数据的交流，获取、管理、分享在计算机上进行的（in silico）实验和计算结果。DS CHARMm：CHARMm是一个被广泛承认并应用的模拟程序。CHARMm包含具有专家特点的（包括正常模式计算、相关性分析、量子力学与分子力学的组合等）标准最小化、分子动力学方法。CFF：先进的Class II力场, 用于优化DNA、RNA、糖类、类脂化合物、蛋白质和小分子模型，为药物开发和蛋白质设计提供高可靠性的力场。DS Analysis：分析和显示蛋白质、蛋白质与配体复合物的分子动力学轨迹文件。DS Biopolymer：构建、修改多肽，可以对蛋白质进行编辑、capping/uncapping等操作。DS Protein Similarity Search：通过web，或者本地安装的数据库，查找与你的蛋白质序列同? 源性高的蛋白。DS MODELER：自动进行蛋白质同源建模、loop区建模、序列比对、基于结构的比对、蛋白质突变。DS Protein Health：利用Profiles 3D验证方法确定模建蛋白质结构的合理性与可靠性。DS Protein Families：利用序列和结构信息进行多重序列比对，还可以完成进化树（Evolutionary Trace）分析，识别重要的功能残基。DS DelPhi：生物分子表面静电势和溶剂化效应的计算。Discovery Studio Modeling对软、硬件环境的要求DS ProjectKM Oracle客户端Oracle 8.1.7 Client (Standard or Enterprise Edition)Windows® NT 4.0 with Service Pack 6，或Windows® 2000 with Service Pack 2，或Windows® XP128MB以上内存DS ProjectKM Oracle服务器端Oracle 8i (recommended 8.1.7) Server (Standard or Enterprise Edition)Windows® NT 4.0 with Service Pack 6，或Windows® 2000 with Service Pack 2，或Windows® XPSGI (IRIX 6.5.10 or above)其中： SGI：R10KPC：Intel® Pentium® III or 4 processor，CPU主频>1.0 GHz，512MB以上内存DS Modeling客户端软件环境： Internet Explorer 6.0Adobe SVG 3.0Windows® NT 4.0 with Service Pack 6，或Windows® 2000 with Service Pack 2硬件环境： Intel® Pentium® III or 4 processor，CPU主频>1.0 GHz，512MB以上内存DS Modeling计算服务器软件环境： Windows® NT 4.0 with Service Pack 6，或Windows® 2000 with Service Pack 2，或IBM AIX硬件环境： PC Intel® Pentium® III or 4 processor，CPU主频>1.0 GHz，512MB以上内存，80MB硬盘空间用于安装软件关于Discovery StudioTM　　Discovery StudioTM是一个针对生命科学领域的功能强大的研究平台，整合了广泛的信息学、分子建模和模拟工具；作为一个Client-Server结构的平台，它允许用户在客户端通过普通个人电脑访问以上工具。这些工具针对解决的是整个药物发现过程中可能遇到的技术问题。Discovery Studio作为一个平台，同时提供针对项目的核心管理系统，支持不同的科研人员之间的合作。同时，Discovery Studio是一个开放的平台，允许用户整合第三方产品、个人数据或公共数据。Discovery StudioTM系列已经发布的其他软件Discovery Studio Gene：显示、编辑和分析DNA序列和蛋白质序列的工具，可以处理不同格式的文件，包括：DNA，蛋白质和三维分子图像。这个产品可以作为一个序列分析系统单独运行，也作为GCG® Wisconsin Package®在客户端的界面，将来还可以成为SeqStore在客户端的界面。Discovery Studio ViewerPro：一个方便的分子模建和显示工具，允许研究人员在普通个人电脑上生成高品质的三维分子模型。这些图形可以方便地转到Microsoft® PowerPoint®或Word®文件中。Discovery Studio™ MedChem Explorer：药效基团模建和设计工具。使得化学家可以在计算机上设计有活性的化合物， 加快先导化合物获得进程。它提供药效基团模建、构象分析、性质计算、ADME预测等功能。　　所有软件可以通过Discovery Studio Project Knowledge Manager（DS ProjectKM）集成在一起，而DS ProjectKM是一个基于Oracle®平台的基本组件，通过它，来自研究队伍的所有人员，都可以获取、保存通过Discovery Studio应用程序得到的信息和知识，并更加有效地分享、利用这些信息和知识。欢迎访问www.accelrys.com/dstudio，获取更详细信息。