基质金属蛋白酶（Matrix metalloproteinases, MMPs）抑制剂的设计——考虑受体柔性和诱导契合效应 基质金属蛋白酶MMPs 的过表达同许多病理生理过程相关联，包括血管性疾病、多发性硬化症、阿尔兹海默症及癌症等。其中，研发MMP 抑制剂用以阻止癌症转移已经成为当前研究的热点。典型的MMP 抑制剂都包含有锌离子结合基团（ZBG）。然而，由于MMP-2结合口袋的高度柔性，给MMP 抑制剂的合理药物设计带来了极大的挑战。本文联合采用了对接技术和分子动力学技术从而在药物设计的过程中考虑蛋白柔性和诱导契合效应。其中考虑到典型MMP 抑制剂都还有ZBG 基团，本文采用的是LUDI——基于片段的全新（De Novo）药物设计方法。通过该方法将默认的DS LUDI link 片段库中的片段对接至活性位点，并同事先定义好的ZBG 骨架相连接从而得到新的配体分子。更多详情
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