主页研究研究实验室 Research LabsNew England Biolabs 进行了广泛的研究处于生命科学行业前沿的计划。超过 30 个实验室参与了研究项目，这些项目得到了博士后研究员和硕士和博士生的帮助。程式。 NEB 科学家在基因表达、化学生物学、寄生虫学、RNA 生物学、DNA 酶和限制性内切酶等多个学科领域撰写或合着了 1,300 多篇出版物。通过使用下面的链接。 Biology\' title=\"GenomeBiology\">GenomeBiology

基因组生物学是从基因组的角度研究生命。基因组生物学部专注于限制修饰、表观遗传学、计算生物、NGS 技术和人类疾病（癌症、微生物组、被忽视的热带病）。

基因组生物学部的实验室利用不同的方法来解决这些研究领域，包括从事详细的机制研究（生物化学、结构生物学），以及着眼于基因组学和转录组学的全基因组研究，以及开发使能测序技术。

视频+Tilde Carlow，NEB® 基因组生物学研究在此视频中，Tilde Carlow描述了 NEB 基因组生物学研究部的目标和兴趣。克洛蒂尔德卡洛

伦敦大学科学主任博士，1984

关注领域：

被忽视的热带病和蜱传感染

查看实验室页面 克洛蒂尔德卡洛

S科学总监 伦敦大学博士，1984 年

关注领域:

被忽视的热带病和蜱传感染

当前研究：

人类最重要的几种被忽视的热带病，例如象皮癣s（淋巴丝虫病）和河盲症（盘尾丝虫病）是丝虫线虫寄生虫感染的结果。我的实验室对丝虫寄生虫生物学及其沃尔巴克氏体内共生体进行基础研究，并开展以开发新的诊断测试和疗法为重点的应用研究。

准确的寄生虫检测对于控制计划的成功至关重要。我们正在开发新的和改进的方法来诊断人类感染和监测昆虫媒介。这涉及识别新的生物标志物，包括 DNA、RNA 和 miRNA，以及开发易于执行且非常适合资源匮乏环境的灵敏且特异性的基于核酸的诊断分析。我们正在使用类似的方法为美国和世界上许多国家发生的蜱传感染开发新的诊断方法。

丝虫感染的控制主要基于使用数量有限的药物，这些药物具有功效有限。我们对寄生虫生物学及其细菌共生体的基础研究导致发现了寄生虫或 Wolbachia 中存在的新药物靶点。我们正在与学术界和工业界的合作者合作，以确定可能代表新药先导的这些靶标的抑制剂。

精选出版物：Poole, C.B., Li, Z., Alhassan, A., Guelig, D ., Diesburg, S., Tanner, N.A., Zhang, Y., Evans, T.C. Jr.、LaBarre, P.、Wanji, S.、Burton, R.A.和卡洛，C.K. (2017) 使用非仪器化核酸环介导等温扩增 (NINA-LAMP) 进行丝虫感染诊断和病媒监测的比色测试。 PLoS One，2 月 15 日；12(2):e0169011。 doi：10.1371/journal.pone.0169011。 eCollection 2017. PMID：28199317.Alhassan, A.、Osei-Atweneboana, M.Y.、Kyeremeh, K.F.、Poole, C.B.、Li, Z.、Tettevi, E.、Tanner, N.A. 和 Carlow, C.K. (2016) 一种新的视觉等温核酸扩增试验与 PCR 和皮肤切片分析诊断的比较人类盘尾丝虫病的病症。摩尔。生化。 Parasitol.，11 月 - 12 月；210(1-2):10-12。 doi：10.1016/j.molbiopara.2016.07.006。 Epub 2016 年 7 月 26 日。PMID：27473357.Poole, C.B., Ettwiller, L., Tanner, N.A., Evans, T.C. Jr.、Wanji, S. 和 Carlow, C.K. (2015) 适用于环介导等温扩增的 Loa loa 感染新 DNA 生物标志物的基因组过滤。 PLoS One，9 月 28 日；10(9)：e0139286。 doi：10.1371/journal.pone.0139286。 eCollection 2015。PMID：26414073.Alhassan, A.、Li, Z.、Poole, C.B. 和 Carlow, C.K. (2015) 扩展用于丝虫诊断和监测的 MDx 工具箱。趋势 Parasitol., Aug;31(8):391-400。内政部：10.1016/j.pt.2015.04.006。 Epub 2015 年 5 月 12 日。评论。 PMID：25978936.Yu, H., Dranchak, P., Li, Z., MacArthur, R., Munson, M.S., Mehzabeen, N., Baird, N.J., Battalie, K.P., Ross, D., Lovell, S. , Carlow, C.K., Suga, H. 和 Inglese, J. (2017) 大环肽描绘了微生物磷酸甘油酸变位酶的锁开抑制机制。纳特。社区，4 月 3 日；8：14932.doi：10.1038/ncomms14932。 PMID：2836800。

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Laurence Ettwiller

资深科学家 大学博士剑桥，2005

焦点区域：

NGS 和计算生物学

查看更多Laurence Ettwiller

高级科学家博士，大学 of 剑桥，2005

重点领域：

NGS 和计算生物学

当前研究：

Ettwiller 小组的主要课题是将 NEB 进行的大型酶发现和优化工作与最新的大规模并行测序技术。我们的研究以开发创新的大规模应用为中心目标，涉及对此类应用固有的实验方法和数据分析策略的阐述。这些努力的成果是双重的：首先，解决生物学问题的独特新能力；第二，改进现有技术或新技术的观点。

Selected Publications:Chen, L., Liu, P., Evans, T.C.和 Ettwiller, L.M.（2017 年）DNA 损伤是测序错误的普遍原因，直接混淆变异识别。科学，355 (6326)，752-756。 PMID：28209900.Chen, L., Ettwiller, L., Sumner, C., Stewart, F.J., Dimalanta, E.T.和戴维斯，T.B. (2016) 提高l的测序质量从 FFPE DNA 制备的文库。癌症研究，76（14 增刊），3628-3628。Boutard, M.、Ettwiller, L.、Cerisy, T.、Alberti, A.、Labadie, K.、Salanoubat, M.、Schildkraut, I. 和 Tolonen， A.C. (2016) 植物发酵细菌中转录起始位点的全球重新定位。纳特。社区，12 月 16 日；7:13783。内政部：10.1038/ncomms13783。 PMID：27982035.Ettwiller, L.、Buswell, J.、Yigit, E. 和 Schildkraut, I. (2016) 一种新的富集策略揭示了模型原核生物和肠道微生物组中单碱基分辨率下前所未有的新转录起始位点数量. BMC 基因组学，3 月 8 日；17:199。内政部：10.1186/s12864-016-2539-z。 PMID：26951544。

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理查德罗伯茨爵士

谢菲尔德大学首席科学官博士，1968 年

关注领域：

限制和修饰的生物信息学

查看更多S ir Richard Roberts

首席Scientific Officer Ph.D., University of Sheffield, 1968

研究方向：

限制和修饰的生物信息学

当前研究：

我的实验室对限制和修饰的研究历史悠久限制酶及其相关的 DNA 甲基转移酶 (MTases)。我们正在开发方法，结合生物信息学和生化实验来寻找具有新特性的新酶继续分析来自现在可用的许多微生物基因组序列的 DNA 序列信息。目前的工作重点是使用 PacBio 测序来识别新的限制系统并确定 MTases（m4C 和 m6A）的识别序列。我们还在开发用于 m5C 识别序列确定的新方法。我们运行 REBASE (www.neb.com/rebase)，这是一个人工管理的限制酶及其相关蛋白信息数据库，例如 MTases、对照蛋白、切口酶等。我们欢迎外部用户与 PacBio 合作数据，因为甲基化分析在生物学上很重要，无法通过任何其他方式轻易获得。

在 Rich Roberts 在加利福尼亚州立大学的演讲中了解更多信息。

已选择出版物：Fomenkov, A.、Sun, Z.、Dila, D.K.、Anton, B.P.、Roberts, R.J.和罗利，E.A. (2017) EcoBLMcrX，大肠杆菌中一种经典的修饰依赖性限制酶hia coli B：使用新的切割位点测定方法进行体内和体外表征。公共科学图书馆一号，12：e0179853。 PMID：28654677.Blow, M.J., Clark, T.A., Daum, C.G., Deutschbauer, A.M., Fomenkov, A., Fries, R., Froula, J., Kang, D.D., Malmstrom, R.R., Morgan, R.D., Posfai, J ., Singh, K., Visel, A., Wetmore, K., Zhao, Z., Rubin, E.M., Korlach, J., Pennacchio, L.A. and Roberts, R.J. (2016) 原核生物的表观遗传景观。 PLoS 遗传学，12：e1005854。 PMID：26870957.Roberts, R.J.、Vincze, T.、Posfai, J. 和 Macelis, D. (2015) REBASE - DNA 限制和修饰数据库：酶、基因和基因组。核素。酸研究，43：D298-D299。 PMID：25378308.Klimasauskas, S., Kumar, S., Roberts, R.J.和 Cheng, X. (1994) HhaI 甲基转移酶将其目标碱基翻转出 DNA 螺旋。细胞，76：357-369。 PMID：8293469Chow, L.T., Gelinas, R.E., Broker, T.R.和罗伯茨，R.J. (1977) 腺病毒 2 信使 RNA 5\' 末端的惊人序列排列。细胞，12：1-8。PMID:11187030

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Richard Morgan

波士顿高级科学家博士大学，2009

焦点区域：

蛋白质工程、DNA 识别、R-M 系统、基因组学

查看更多Richard Morgan

高级科学家博士，波士顿大学，200 9

关注领域：

蛋白质工程、DNA 识别、R-M 系统、基因组学

当前研究：

限制性核酸内切酶 (REases) 是基因组防御系统，通过识别和切割侵入性 DNA 中的短 DNA 靶序列来提供先天免疫。 REases 与 DNA 甲基转移酶 (MTase) 合作，后者修饰相同的 DNA 靶标以形成限制性修饰 (R-M) 系统。由于 REases 以极高的保真度识别和切割其定义的 DNA 靶位点，因此它们既是分子生物学的主力工具，也是研究蛋白质-DNA 相互作用的模型系统。我们的实验室致力于发现、表征和设计新型 R-M 酶。我们针对具有独特功能的系统，例如负责 DNA 识别、切割、修改或易位的域的新组织。我们对大型 R-M 家族进行表征，以识别其他高度相似的蛋白质之间的关键差异，然后使用协变分析来识别保守位置以及负责特定 DNA 识别的氨基酸残基。我们通过合理诱变在这些 REases 和 MTases 中设计了新的特异性。我们通过利用 SMRT 测序同时读取单个 DNA 分子的基因型和表型（目标特异性 DNA 甲基化）来进一步研究 DNA 识别。我们的最终目标是通过更好地了解特定 DNA 识别的分子基础，为特定 DNA 切割和修饰生成更多不同的工具。

精选出版物：Callahan, S.J., Luyten, Y.A., Gupta, Y.K., Wilson, G.G. , Roberts, R.J., Morgan, R.D. 和 Aggarwal, A.K. (2016) 与 DNA 复合的 IIL 型限制性修饰酶 MmeI 的结构对设计新的特异性有影响。 PLoS 生物学，14：e1002442。 PMID：27082731.Blow, M.J., Clark, T.A., Daum, C.G., Deutschbauer, A.M., Fomenkov, A., Fries, R., Froula, J., Kang, D.D., Malmstrom, R.R., Morgan, R.D., Posfai, J ., Singh, K., Visel, A., 我们tmore, K.、Zhao, Z.、Rubin, E.M.、Korlach, J.、Pennacchio, L.A. 和 Roberts, R.J. (2016) 原核生物的表观基因组景观。 PLoS Genet.，12：e1005854。 PMID：26870957.Morgan, R.D., Luyten, Y.A., Johnson, S.A., Clough, E.M., Clark, T.A., Roberts NS R.J. (2016) I 型限制修改系统中的新型 m4C 修改。核素。酸研究，44：9413-9425。 PMID：27580720.Morgan, R.D. 和 Luyten, Y.A. (2009) II 型限制性核酸内切酶 DNA 结合和切割特异性的合理工程。核酸研究 37：5222-5233。 PMID：19567736Morgan, R.D.、Dwinell, E.A.、Bhatia, T.K.、Lang, E.M. 和 Luyten, Y.A. (2009) MmeI 家族：II 型限制性修饰酶，采用单链修饰来保护宿主。核酸研究 37：5208-5221。 PMID:19578066

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Sriharsa Pradhan

杰出科学家博士，格拉斯哥大学，1995

关注领域：

表观遗传基因调控和遗传

查看更多Sriharsa Pradhan

杰出科学家大学博士格拉斯哥，1995 年

关注领域：

表观基因调控和遗传

当前研究：

在真核生物中，表观基因组在基因表达调控中起着重要作用。染色质中的DNA高甲基化通常ally 导致基因沉默，并且对于大多数真核生物（包括动物、真菌和植物）的各种表观遗传过程至关重要。同样，组蛋白的翻译后修饰（甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化和 ADP 核糖基化）决定了调节蛋白和结构蛋白与核小体的相互作用，从而改变了染色质结构。在包括癌症在内的病理条件下，有许多异常 DNA 甲基化的例子。癌症特异性 DNA 甲基化模式的获得在致癌转化中起着重要作用，因此可用作早期诊断标记。我的实验室专注于了解 DNA 和蛋白质修饰的调节，尤其是作用于染色质的酶。我们还研究了各种转录因子和肿瘤抑制蛋白作为表观遗传调节剂在细胞生长、发育和程序性细胞死亡过程中的作用。菲最后，我们将包括染色质可及性和结构研究在内的表观基因组信息与生物化学、结构生物学和活细胞成像相结合，以破译细胞功能中涉及的复杂表观遗传机制。

精选出版物：Ponnaluri, V.K., Zhang, G., Xu, S.U., Estève, P.O.和 Pradhan, S. (2017) 用于癌症基因组高分辨率开放染色质分析的切口酶辅助测序 (NicE-seq)。基因组生物学，18:122。 PMID：28655330.Estève, P.O., Zhang, G., Ponnaluri, V.K.C., Deepti, K., Chin, H.G., Dai, N., Sagum, C., Black, C., Corrêa, I.R. Jr., Bedford, M.T., Cheng, X 和 Pradhan, S. (2016) Binding of 14-3-3 reader proteins to phosphorylated DNMT1 facilitates aberrant DNA methylation and gene expression.核素。酸研究，44，1642-1656。 PMID：26553800.Estève, P.O.、Chang, Y.、Samaranayake, M.、Upadhyay, A.K.、Horton, J.R.、Feehery, G.R.、Cheng, X. 和 Pradhan, S. (2011) 甲基化和磷酸化开关相邻赖氨酸和丝氨酸之间的 tch 决定了人类 DNMT1 的稳定性。纳特。结构。摩尔。生物学，18:42-48。 PMID：21151116.Estève, P.O., Chin, H.G., Benner, J., Feehery, G.R., Samaranayake, M., Horwitz, G.A., Jacobsen, S.E.和 Pradhan, S. (2009) 通过哺乳动物细胞中 SET7 介导的赖氨酸甲基化调节 DNMT1 稳定性。美国国家科学院院刊，106：5076-5081。 PMID：19282482.Bostick, M.、Kim, J.K.、Esteve, P.O.、Clark, A.、*Pradhan, S. 和 *Jacobsen, S.E. (2007) UHRF1 在维持哺乳动物细胞的 DNA 甲基化中发挥作用。科学，317：1760-1764。 PMID：17673620。

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Enzymology\' title=\"Molecular Enzymology\">Molecular Enzymology

The Molecular Enzymology Division 使用各种技术来询问：

什么是酶活性？该酶最重要的部分是什么？如何对酶进行改造使其具有新的活性？

这使 NEB 研究人员和 NEB 客户能够在新的和创新的领域使用酶加速基础研究发现和生物技术工作流程创新的有效方法。

视频+Andy Gardner，NEB® 的分子酶学研究

在此视频中，Andy Gardner 描述了 NEB® 的目标和兴趣NEB 分子酶学研究部。

Andrew Gardner

波士顿大学科学总监，博士，2010

关注区域：

DNA amplification; Genomics

查看实验室页面Andrew Gardner

科学总监博士。 , 波士顿大学, 2010

研究方向：

DNA扩增；基因组学

当前研究：

每次细胞分裂时，其复制机制都会高效准确地复制整条染色体。我们的目标是了解个体复制和修复酶的生物化学特性以及它们如何协同工作完成快速和准确的合成。为了了解复制和修复途径和中间体，我们正在开发新的遗传、生物化学、单分子和下一代测序分析。新的太ls 和分析帮助我们了解古细菌中的冈崎片段成熟和偶联碱基切除修复途径，并且新型的下一代测序工作流程能够观察全基因组 DNA 复制和体内修复。我们不断创新以发现酶途径和机制。

Gardner 实验室的另一个目标是在试管中匹配大自然的复杂性。为完成复制整个基因组的任务而自然进化的重组复制体具有实现常规体外基因组合成和操作的潜力。在单细胞基因组学中，需要长线性 DNA 扩增 (>100,000 bp) 才能准确再现单细胞基因组的序列和拷贝数变异。在合成生物学中，DNA 组装方法被限制在大约 20 kb，并且必须以非常低的频率在体内组装更大的片段，从而限制了实用性。重组的复制体可以满足这种超长 DNA 合成的需要。

精选出版物：Heider, M.R.、Burkhart, B.W.、Santangelo, T.J. 和 Gardner, A.F. (2017) 在古细菌中定义 RNaseH2 酶启动的核糖核苷酸切除修复途径。 J.生物学。化学，292 (21):8835-8845。 PMID：28373277.Schermerhorn, K.M.、Tanner, N.、Kelman, Z. 和 Gardner, A.F.（2016）嗜热古菌 MCM 解旋酶的高温单分子动力学分析。核素。酸研究，44 (18)：8764-8771。 PMID：27382065.Greenough, L.、Schermerhorn, K.M.、Mazzola, L.、Bybee, J.、Rivizzigno, D.、Cantin, E.、Slatko, B.E.和 Gardner, A. F.（2015 年）采用毛细管凝胶电泳作为一种灵敏的高通量方法来加速核酸代谢酶的表征。核素。酸研究，doi：10.1093/nar/gkv899。 PMID：26365239.Schermerhorn, K.M.和 Gardner, A.F. (2015) 来自 Thermococcus sp. 的 D 族 DNA 聚合酶的前稳态动力学分析。 9°N 揭示了古菌基因组复制和维护的机制。 J.生物学。化学, 290(36):21800-10。 PMID：26160179.Greenough, L., Kelman, Z. 和 Gardner, A.F. (2015) The roles of family B and D DNA polymerases in Thermococcus species 9°N Okazaki fragment maturation. J.生物学。化学，290(20):12514-22。 PMID：25814667。

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Greg Lohman

马萨诸塞州科学博士技术学院，2007

重点领域：

DNA & RNA 连接酶机制、动力学和应用

查看实验室页面Greg Lohman

研究员，麻省理工学院博士，2007 年

关注领域：

DNA & RNA 连接酶机制、动力学和应用

当前研究：

Lohman 实验室的主要研究目标是深入了解 DNA 修复中的关键酶。我们研究在修复过程中发挥重要作用的酶生物学和生物技术，旨在分析底物特异性，阐明酶反应的机制并表征酶反应的详细动力学。我们研究核酸酶的目的是发表基础研究，扩展这些系统的知识，并将信息应用于开发

多核苷酸连接酶是我迄今为止工作的核心重点，在维持基因组完整性、复制和修复方面起着关键作用。这些酶在传统克隆方法、Golden Gate 和 Gibson Assembly 等现代合成生物学基因组装方法、下一代测序文库的制备以及连接酶检测反应和连接酶链反应等分子诊断方法等方法学中发挥着关键作用.

尽管 DNA 连接酶在生物学和生物技术中都具有核心重要性，但仍有大量需要了解的机制。许多问题仍然存在，包括酶动力学的动力学、DNA 结合和搜索的细节、底物特异性和连接保真度的决定因素，以及末端连接连接的机制。我们的目标是开发高通量、信息密集型分析，用于研究 DNA 连接的细节，利用快速化学淬灭、停流、高通量毛细管电泳和下一代测序方法。

我们最近的研究末端连接中的 DNA 连接酶保真度和偏差模拟反应揭示了 DNA 连接的趋势，这些趋势已应用于改进 DNA 组装方法。我们已经证明，通过我们对连接酶保真度的全面研究，使用数据驱动的连接序列选择可以轻松实现一锅 25+ 片段金门组装反应。

Lohman 实验室也开始了 DNA 外切酶的详细研究。目前的项目旨在详细研究市售核酸外切酶的底物特异性，包括研究一系列修饰底物的抑制机制起源、杂交螺旋特异性，以及 DNA 结合和核酸外切酶持续合成能力的机制细节。与 DNA 连接酶一样，这些知识将促进现有核酸外切酶应用的改进和新技术的开发。

精选出版物：Potapov, V., Ong, J.L., Kucera, R.B., Langhorst, B.W., Bilotti , K., Pryor, J.M., Cantor, E.J., Canton, B., Knight, T.F., Evans, T.C., Jr. 和 Lohman, G.J.S. (2018) T4 DNA 连接酶对四碱基悬垂连接保真度的综合分析及其在 DNA 组装中的应用。 ACS 合成生物学。 7(11):2665-2674。 doi：10.1021/acssynbio.8b00333.Potapov V.、Ong J.L.、Langhorst B.W.、Bilotti K.、Cahoon D.、Canton B.、Knight T.F.、Evans T.C. Jr. 和 Lohman G.J.S. (2018) 用于全面分析 DNA 末端连接过程中 T4 DNA 连接酶保真度和偏倚的单分子测序分析。核酸研究。 46（13）：e79。 doi: 10.1093/nar/gky303Bauer, R.J., Jurkiw, T.J., Evans, T.C. Jr. 和 Lohman, G.J.S. (2017) T4 DNA 连接酶-DNA 结合的快速时间尺度分析。生物化学，56(8):1117-29。 doi: 10.1021/acs.biochem.6b01261 PMID: 28165732.Lohman, G.J.S, Bauer, R.J., Nichols, N.M., Mazzola, L., Bybee, J., Rivizzigno, D., Cantin, B.A.和埃文斯，T.C. Jr. (2015) DNA 连接酶保真度综合分析的高通量分析。核酸研究，doi：10.1093/nar/gkv898 PMID：26365241.Lohman, G.J., Zhang, Y., Zhelkovsky, A.M., Cantor, E.J.和埃文斯，T.C. Jr. (2014) 通过小球藻病毒 DNA 连接酶在 DNA-RNA 杂交螺旋中进行高效 DNA 连接。核酸研究, 42, 1831–44。 PMID：24203707。

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拉娜萨利赫

高级科学家博士,宾夕法尼亚州立大学，2005

焦点区域：

十一转位酶 (TET) 蛋白

查看更多Lana Saleh

高级科学家博士，宾夕法尼亚州立大学，2005

重点领域：

11-11 转位酶(TET) 蛋白

当前研究：

在真核生物中，DNA 和 RNA 上的甲基化都是可逆的，并以 2\'-deoxy-5-methylcytidine (5mC) 和 N6-methyladenosine 的形式存在于 DNA 上(m6A) on RNA。我的小组的主要兴趣是参与这些碱基去甲基化过程的加氧酶的生化表征，例如 5mC 和 FTO 中的 10-11 易位 (TET) 酶，以及 5mC 和 FTO 中的 AlkBH5 m6A。这些加氧酶是 Fe(II)/α-酮戊二酸依赖性双加氧酶的成员，它们采用基于自由基的机制氧化其相应底物上的甲基部分。我的小组有兴趣了解以下化学机制这些酶用于产生这些氧化碱基，以及破译它们的模式底物识别和产品发布。我们还对核酸加氧酶亚家族的各个成员如何进化以执行各种氧化功能以及了解最终决定其特异性的因素感兴趣。

1. DNA 和 RNA 上 5mC 的氧化去甲基化

TET 酶参与将 5mC 氧化成三种氧化形式，5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC)、5-甲酰基胞嘧啶 (5fC) 和 5-羧基胞嘧啶 ( 5caC）。这些碱基被认为是哺乳动物主动去甲基化途径的中间产物，但最近的文献提供了这些修饰碱基作为表观遗传标记参与细胞调节和发育过程的可能性的证据。我们正在对来自单细胞原生生物 Naegleria gruberi 的哺乳动物 TET (mTET) 及其进化远亲 NgTET1 进行体外生化表征，并进行相关研究体内生物学报告的体外作案手法。我们也有兴趣研究 TET/JBP 家族的其他各种成员，mTET 和 NgTET1 是其中的成员。具体来说，我们热衷于识别对 mRNA 和长链非编码 RNA 上的 5mC 表现出氧化功能的新型加氧酶。最后但同样重要的是，我们正在利用结构和生物信息学工具来识别具有改变的氧化产物分布和底物特异性的 TET 同系物。

2. RNA 和 DNA 上 m6A 的氧化去甲基化

已知 RNA 上的 m6A 在剪接、核输出、翻译能力和稳定性等各种 RNA 代谢过程中发挥作用。我的团队专注于各种 m6A 去甲基化酶的功能和生化表征，这些酶催化 m6A 转化为 RNA 上的腺苷 (A)，例如 FTO 和 AlkBH5，以及 DNA，例如来自秀丽隐杆线虫的预测 AlkB 同系物。在其去甲基化反应中，FTO 已被证明可以催化 t在 A 的形成途径中形成了两种氧化中间体，即羟基 6-甲基腺苷 (hm6A) 和甲酰基 6-腺苷 (f6A)。另一方面，在哺乳动物 AlkBH5 的反应中未检测到这两种中间体。因此，我们有兴趣在实验室研究的方面之一是这两种酶的化学去甲基化机制可能存在差异，或者在 AlkBH5 反应中未检测到相同中间体是否仅与体外活性低有关这种酶。我们还专注于使用一系列生化工具确定上述酶的最佳底物的性质，例如基于液相色谱 (LC)-三重四极杆质量 (QQQ) 光谱的动力学分析、紫外-可见光谱、停流光谱, 和下一代测序方法。

3.用于 DNA 和 RNA 甲基化组测序的生物技术工具。

我的团队正在探索生物技术应用TET 酶和 m6A 去甲基化酶分别用于 DNA 和 RNA 的单碱基分辨率甲基化组测序，最终目标是开发商业测序试剂盒，它将作为 5mC 和转录组范围内表观基因组和转录组图谱的分子诊断工具m6A 以了解这些碱基及其修饰在各种生物过程和疾病状态中的作用。

精选出版物：Tamanaha, E.、Guan, S.、Marks, K. 和 Saleh, L.（ 2016) TET 酶的铁 (II)/α-酮戊二酸依赖性催化域的分布处理与氧化 5-甲基胞嘧啶碱基的表观遗传作用一致。 J. Am。化学。社会学杂志，138，9345-9348。 PMID：27362828.Pais, J.E., Dai, N., Tamanaha, E., Vaisvila, R., Fomenkov, A., Bitinaite, J., Sun, Z., Guan, S., Corrêa, I.R. Jr., Noren, C.J., Cheng, X., Roberts, R.J., Zheng, Y. 和 Saleh, L. (2015) Naegleria Tet 样加氧酶的生化特性及其应用 in 5-甲基胞嘧啶的单分子测序。美国国家科学院院刊，112，14-21。 PMID：25831492.Beech, J.*、Saleh, L.*、Frentzel, J.、Figler, H.、Corrêa, I.R. Jr.、Baker, B.、Ramspacher, C.、Marshall, M.、Dasa, S.、Linden, J.、Noren, C.J. 和 Kelly, K.A. (2015) 多价位点特异性噬菌体修饰增强了受体配体的结合亲和力。生物偶联物。化学，26，529-536。 PMID：25692462.Hashimoto, H, Pais, J.E., Zhang, X., Saleh, L., Fu, Z.Q., Dai, N., Corrêa, I.R. Jr., Zheng, Y. 和 Cheng, X. (2014) 与 5-甲基胞嘧啶 DNA 复合的 Naegleria Tet 样双加氧酶的结构。自然，506, 391-395。 PMID：24390346.Saleh, L. 和 Noren, C. N. (2011) 噬菌体颗粒的定点化学修饰。在 Petrenko, V. 和 Smith, G.P. （编辑）Phage Nanobiotechnology：RSC Nanoscience & Nanotechnology (17, 202-219)。英国皇家化学学会。

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徐明群

纽约州立大学奥尔巴尼分校高级科学家博士，1989

关注领域：

蛋白质工程、蛋白质标记和成像

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高级科学家博士，国家纽约大学奥尔巴尼分校，1989 年

重点领域：

蛋白质工程、蛋白质标记和成像

当前研究：

我们相信酶技术对科学进步和人类健康。我组目前的研究重点是开发酶固定化技术。我们旨在通过研究影响共价结合到固体载体上的酶的动力学和稳定性的各种参数来改善固相催化的微环境。我们努力证明固定化酶是解决生物学问题和改进现有技术的独特工具。特别是，我们正在探索 DNA 修饰酶在大规模平行测序技术中的无偏文库制备中的应用。

精选出版物：Bombardier, J.P., Eskin, J.A., Jaiswal, R, Corrêa, I.R. Jr, Xu, M.Q., Goode, B.L.和 Gelles, J. (2015) 单分子可视化肌动蛋白丝倒刺端的甲醛封端蛋白\"决策复合物”。 Nature Communications，6. PMID：26566078.Sun, X., Dusserre-Bresson, F., Baker, B., Zhang, A, Xu, P., Fibbe, C., Noren, C.J., Corrêa, I.R. Jr. 和 Xu, M.Q. (2014) 通过选择性交联探测表皮生长因子受体的同型二聚体形成。欧元。 J. 医学。化学，S0223-5234(14)00648-5。 PMID：25042004.Corrêa, I.R. Jr.、Baker, B.、Zhang, A.、Sun, L.、Provost, C.R.、Lukinavičius, G.、Reymond, L.、Johnsson, K. 和 Xu, M.Q. (2013) 改进 SNAP 标签活细胞荧光标记的底物。当前。医药。设计, 19, 5414-5420。 PMID：23431983.Shcherbakova, I., Hoskins, A.A., Friedman, L.J., Serebrov, V., Corrêa, I.R. Jr., Xu, M.Q., Gelles, J. 和 Moore, M.J. (2013) 单分子荧光显微镜揭示的替代剪接体组装途径。细胞报告，5, 151-165。 PMID：24075986.Ghosh, I.、Considine, N.、Maunus, E.、Sun, L.、Zhang, A. Buswell, J.、Evans, T.C. Jr. 和 Xu, M.Q. (2010) 通过内含肽介导的蛋白质连接进行位点特异性蛋白质标记。在埃文斯，T.C.小和徐。 M.Q. （编辑），分子生物学方法 705：大肠杆菌中的异源基因表达。 （第 87-107 页）。 Humana Press, Inc. PMID：21125382。

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Peter Weigele

高级科学家博士.D.，犹他大学，2003

重点领域：

复杂核酸修饰的生物化学

查看更多Peter Weigele

森博士，美国大学tah, 2003

研究领域：

复杂核酸修饰的生物化学

当前研究：

我的团队致力于发现新的复杂核酸修饰并弄清楚它们是如何修饰的制成。我们有多个目标：识别生物来源的非规范核苷，确定它们的确切化学结构，找到负责它们形成的基因，在体外重建修饰的生物合成，并在可能的情况下利用这些活动作为工具来操纵核酸

与 Ivan Corrêa 实验室合作，我们最近发现了两种新型胸苷碱基\"超修饰”：5-氨基乙氧基甲基-2\'-脱氧尿苷 (5-NeOmdU) 和 5-氨基乙基-2\'-脱氧尿苷 (5-NedU) 在某些噬菌体的染色体 DNA 中。我的小组随后确定了负责它们生物合成的基因，表征了它们形成过程中的主要途径中间体，并发现了 t修饰化学基团的代谢起源。这些发现现在使我们能够在体外从纯化的酶和底物中重建 5-NeOmdU 和 5-NedU 的形成。我们现在正在探索利用这些碱基修饰酶活性将有用的化学功能引入 DNA 的方法。

除了碱基超修饰的技术应用外，我们将继续研究复合物的生物学特性DNA修饰。编码 DNA 超修饰功能的基因的同系物也被发现编码在移动 DNA、多种细菌甚至真菌中，这表明碱基超修饰被\"重新利用”用于各种表观遗传指导的基于 DNA 的功能。未来的工作将利用我们经过验证的生化方法来识别细胞生物体中预测的 DNA 超修饰基因产物的功能。对其活动的生化鉴定和表征将揭示新的生物学功能复杂碱基修饰的功能并扩展我们对核酸聚合物表观遗传编码能力的理解。

精选出版物：Lee, Y. J., Dai, N., Walsh, S. E., Müller, S., Fraser, M. E., Kauffman, K. M., Guan C, Corrêa IR, & Weigele, P. R. (2018)。广泛存在的细菌病毒基因组 DNA 中胸苷过度修饰的鉴定和生物合成。美国国家科学院院刊，201714812.Weigele, P. 和 Raleigh, E.A. (2016) 细菌及其病毒修饰碱基的生物合成和功能。化学。牧师，116，12655–12687。 PMID：27319741.Carson, S.、Wilson, J.、Aksimentiev, A.、Weigele, P.R. 和 Wanunu, M. (2016) 羟甲基尿嘧啶修饰增强了双链 DNA 的柔韧性和亲水性。核素。酸研究, 44, 2085–2092。 PMID：26578595.Ajayi, F.F.和 Weigele, P.R. (2012) 一种陶土生物电池。生物资源。技术，116，86–91。 PMID：22609660.Jensen, H.M., Albers, A.E., Malley, K.R., Londer, Y.Y., Cohen, B.E., Helms, B.A., Weigele, P., Groves, J.T.和 Ajo-Franklin, C.M. (2010) 活细胞中合成电子导管的工程。美国国家科学院院刊，107，19213–19218。 PMID：20956333.Weigele, P.R., Pope, W.H., Pedulla, M.L., Houtz, J.M., Smith, A.L., Conway, J.F., King, J., Hatfull, G.F., Lawrence, J.G.和 Hendrix, R.W. (2007) Syn9 的基因组和结构分析，Syn9 是一种感染海洋 Prochlorococcus 和 Synechococcus 的噬藻体。环境。微生物学，9，1675–1695。 PMID: 17564603.

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徐双勇

高级科学家博士, 爱荷华大学, 1989

焦点区域：

细菌防御系统，包括修饰依赖性限制系统

查看更多徐双勇

高级科学家 大学博士爱荷华州，1989 年地区研究方向：

细菌防御系统，包括依赖于修饰的限制性系统

当前研究：

我的研究兴趣包括限制性内切酶的结构和功能研究以及催化机制。我也对修饰的发现感兴趣-依赖性限制酶和切口酶。

精选出版物：Kweon, S.M., Zhu, B., Chen, Y., Aravind, L., Xu, S.Y. and Feldman, D.E. (2017) Erasure of Tet-oxidized 5 -SRA 检测的甲基胞嘧啶P核酸酶。细胞报告，21(2):482-494。 doi：10.1016/j.celrep.2017.09.055。 PMID：29020633。Tsai, R., Corrêa, I.R. Jr., Xu, M.Y.和徐，S.Y. (2017) 含脱氧古生氨酸 (dG+) 的噬菌体 9 g DNA 的限制和修饰。科学。代表，7(1):8348。内政部：10.1038/s41598-017-08864-4。 PMID：28827753.Ponnaluri, V.K.C.、Zhang, G.、Estève, P.O.、Spracklin, G.、Sian, S.、Xu, S.Y.、Benoukraf, T. 和 Pradhan, S. (2017) NicE-seq：高分辨率开放染色质分析。基因组生物学，18(1):122。内政部：10.1186/s13059-017-1247-6。 PMID：28655330.Tamulaitiene, G.、Jovaisaite, V.、Tamulaitis, G.、Songailiene, I.、Manakova, E.、Zaremba, M.、Grazulis, S.、Xu, S.Y.和 Siksnys, V. (2017) 限制性核酸内切酶 AgeI 是一种单体，可二聚化以切割 DNA。核素。酸研究，45(6):3547-3558。 doi：10.1093/nar/gkw1310。 PMID：28039325.Xu, S.Y., Klein, P., Degtyarev, S.Kh.和罗伯茨，R.J. (2016) 修饰依赖性限制性内切酶BisI的表达与纯化及其同源酶。科学。代表，2016 年；6:28579。内政部：10.1038/srep28579。 PMID：27353146。

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Replication\' title=\"核酸复制\">核酸复制

核酸复制部门的研究兴趣包括：

DNA/RNA聚合酶和逆转录酶的复制、保真度和酶学分子诊断工具和方法下一代测序应用定向进化和蛋白质工程

核酸复制部门专注于 DNA 和 RNA 复制的酶、应用和生物学。聚合酶是推动分子诊断、下一代测序和合成生物学应用的分子机器。我们的目标是加深对聚合酶的了解，发现新的活性并设计更好的酶，以扩展可用于生命科学研究的分子工具箱。

视频+Jennifer Ong , NEB® 的核酸复制研究

在此视频中, Jennifer Ong 描述了 NEB 核酸研究部的目标和兴趣。

Jennifer Ong

剑桥大学科学主任博士，2005

关注领域：

DNA 聚合酶、RNA 聚合酶、逆转录酶、rep定位保真度、下一代序列、蛋白质工程

查看实验室页面Jennifer Ong

剑桥大学科学总监，2005 年

重点领域：

DNA 聚合酶, RNA 聚合酶, 逆转录酶, 复制保真度, 下一代序列, 蛋白质工程

当前研究：

遗传物质的复制对于生物学和遗传信息的维护具有根本的重要性。 DNA 聚合酶，即复制 DNA 的酶，也使现代分子生物学中的许多技术成为可能，例如 DNA 扩增、基于核酸的诊断和下一代测序。 DNA 聚合酶产生的错误会对此类应用产生重大影响。我们的实验室通过单分子测序研究复制错误，以评估 DNA 聚合酶和逆转录酶所犯错误的频率、身份和背景。我们还对研究 DNA 损伤和修饰碱基对聚合酶保真度的影响感兴趣。

除了研究复制保真度外，我们还对蛋白质工程感兴趣，以创建新的酶变体以实现新技术开发。虽然大自然一直是新酶和新活动的丰富来源，但许多新技术需要酶在自然界未选择的条件下发挥作用。我们结合计算蛋白质设计、高通量筛选、机器学习和进化策略来改变酶的功能和特性。我们的目标是通过假设、测试和开发用于进化新酶的新工具，从研究和发现的角度研究蛋白质工程。

精选出版物：Isogawa, A.*, Ong, J. L.*, Potapov , V., Fuchs, R. P., & Fujii, S. (2018)。 Pol V 介导的跨损伤合成在复制后间隙修复过程中引发局部非靶向突变。细胞报告，24(5), 1290–1300。 http://doi.org/10.1016/j.celrep.2018.06.120。 PMID：30067983Potapov, V., Fu, X., Dai, N., Corrêa, I. R., Jr, Tanner, N. A., and Ong, J. L. (2018) 影响 RNA 聚合酶和逆转录酶保真度的碱基修饰。核素。酸研究，46(11)：5753-5763。 http://doi.org/10.1093/nar/gky341。 PMID：29750267Potapov, V.、Ong, J. L.、Langhorst, B. W.、Bilotti, K.、Cahoon, D.、Canton, B. 等。 (2018) 用于全面分析 DNA 末端连接过程中 T4 DNA 连接酶保真度和偏倚的单分子测序分析。核素。酸研究，106、687–11。 http://doi.org/10.1093/nar/gky303。 PMID：29741723 Potapov, V. 和 Ong, J.L. (2017) 通过单分子测序检查 PCR 中的错​​误来源。公共科学图书馆一号。 12(1)：e0169774。 http://doi.org/10.1371/journal.pone.0169774。 PMID：28060945. Pinheiro, V.、Ong, J.L. 和 Holliger, P. (2012) 聚合酶工程：从 PCR 和测序到合成生物学。在 Lutz, S., Bornscheuer, U.T. （编辑），蛋白质工程手册，（第 1 版），（第 279-302 页）。魏因海姆，威利 VCH。

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Bill Jack

高级科学家博士，杜克大学，1983 年

焦点区域：

DNA聚合酶功能

查看更多Bill Jack

高级科学家，杜克大学博士，1983 年

研究领域：

DNA 聚合酶功能 目前的研究：

我的实验室专注于 DNA 聚合酶，尤其是结合修饰核苷酸（包括链终止子）的能力。这个重点正在扩展到包括聚合酶对修饰的 DNA 模板的活性，例如修饰的噬菌体基因组的模板.

精选出版物：Gardner, A.F.、Wang, J.、Wu, W.、Karouby, J.、Li, H.、Stupi, B.P.、Jack, W.E.、Hersh, M.N. 和 Metzker, M.L. (2012)新型 3\'-OH 未封闭可逆终止子的快速掺入动力学和改进保真度。Nucl. Acids Res.，8 月；40(15):7404-15。doi：10.1093/nar/gks330。Epub 2012 年 5 月 8 日。PubMed PMID：22570423；PubMed Central PMCID：PMC 3424534Langhorst, B.W., Jack, W.E., Reha-Krantz, L. and Nichols, N.M. (2012) Polbase：生物化学、遗传和结构信息库DNA聚合酶。核素。酸研究，数据库问题：D381-7。 PMID：21993301.Gardner, A.F. 和 Jack, W.E. (2004) Vent DNA 聚合酶掺入核苷酸类似物的比较动力学。 J.生物学。化学，279：11834-11842。 PMID：14699133.Gardner, A.F. 和 Jack, W.E. (2002) 无环和双脱氧终止子偏好表示古细菌和 Taq DNA 聚合酶对糖的不同识别。Nucl。酸研究，30：605-613。 PMID：11788725.Gardner, A.F. 和 Jack, W.E. (1999) 古细菌 DNA 聚合酶中核苷酸糖识别的决定因素。核。酸研究，27：2545-2553。 PMID：10352184。

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Nathan Tanner

资深科学家博士，哈佛大学versity, 2010

焦点区域：

等温扩增、分子诊断、复制酶的单分子分析

查看实验室页面Nathan Tanner

研究员，哈佛大学博士，2 010

重点领域:

等温扩增、分子诊断、复制酶的单分子分析

当前研究：

核酸扩增是生物技术中的一个基本过程，用于从分子克隆到测序和分子诊断的应用。这种各种各样的扩增技术和应用需要一个灵活的酶和工具箱实现如此多样化的用户群的方法。我们专注于研究和改进这一系列的试剂和技术，努力开发改进的扩增聚合酶和酶以及用于实验室和需求点设置的新型扩增方法。我们使用各种方法，特别是等温扩增技术（LAMP、SDA、NASBA 等），努力确保 NEB 提供独特且优化的试剂，并支持各种核酸扩增和分子诊断应用。

已选出版物：Calvert, A.E.、Biggerstaff, B.J.、Tanner, N.A.、Lauterbach, M. 和 Lacicotti, R.S. (2017) 通过逆转录环介导等温扩增 (RT-LAMP) 快速比色检测血清和尿液标本中的寨卡病毒。公共科学图书馆一号，12(9)：e0185340。 PMID：28945787.Zhang, Y. 和 Tanner, N.A. (2017) Isothermal amplification of long, discrete DNA fragments facilied by single-stranded binding prot恩。科学。代表，7(1):8947。 PMID：28819114.Poole, C.B., Li, Z., Alhassan, A., Guelig, D., Diesburg, S., Tanner, N.A., Zhang, Y., Evans, T.C., LaBarre, P., Wanji, S. , 伯顿, R.A.和卡洛，C.K. (2017) 使用非仪器化核酸环介导等温扩增 (NINA-LAMP) 进行丝虫感染诊断和病媒监测的比色测试。公共科学图书馆一号，12(2):e0169011。 PMID：28199317.Tanner, N.A.、Zhang, Y. 和 Evans, T.C. (2015) 使用 pH 敏感染料对等温核酸扩增进行视觉检测。生物技术，58(2):59–68。 PMID：25652028.Tanner, N.A.、Zhang, Y. 和 Evans, T.C. (2012) 实时环介导等温扩增中的同时多目标检测。生物技术，53(2):81–9。 PMID：23030060。

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Tom Evans

执行董事，明尼苏达大学研究博士，1996 年

关注领域：

参与 DNA 修复和复制的酶和技术

查看更多Tom Evans

执行董事，研究博士，明尼苏达大学，1996 年

面积重点：

参与 DNA 修复和复制的酶和技术

当前研究：

之前我的团队开发了一种体外 DNA 修复混合物，该混合物以\"PreCR”的名称商业化，后来, 下一代eration sequencing (NGS) 聚焦混合物称为\"NEBNext FFPE DNA 修复混合物”。两种混合物都含有 7 种酶，并且被设计为尽可能具有一般的修复能力。这些混合物提高了受损 DNA 的 NGS 文库制备质量，并允许在长读长技术中进行更长的读长。我们对 DNA 损伤和修复的兴趣促使我们询问 DNA 操作过程中的损伤是否正在影响测序数据的质量。与 Laurence Ettwiller 和 Pingfang Liu 合作，我们证明了体外 DNA 损伤确实会导致测序错误，其程度会掩盖低频体细胞变异的识别，甚至是常用数据库中的数据（Chen，L，等人，科学 (2017), 355(6326):752)。我们正在继续这些研究，看看基因组区域是否对某些类型的体外 DNA 损伤特别敏感。

此外，我们正在开发使用当前测序仪器生成大 d 的方法atasets 以更准确地识别体内 DNA 损伤和基因组中的起始/终止位点。

精选出版物：Chen, L., Liu, P., Evans, T.C. Jr. 和 Ettwiller, L.M.（2017 年）DNA 损伤是测序错误的普遍原因，直接混淆变异识别。科学，355(6326):752-756。 PMID：28209900.Tanner, N.A.、Zhang, Y. 和 Evans, T.C. Jr. (2015) 使用 pH 敏感染料视觉检测等温核酸扩增。生物技术，58(2):59-68。 PMID：25652028.Lohman, G.J., Zhang, Y., Zhelkovsky, A.M., Cantor, E.J.和埃文斯，T.C. Jr. (2014) 通过小球藻病毒 DNA 连接酶在 DNA-RNA 杂交螺旋中进行高效 DNA 连接。核素。酸研究，42(3):1831-1844。 PMID：24203707.Mauris, J. 和 Evans, T.C. Jr. (2010) 来自 Aquifex aeolicus 的人类 PMS2 同系物刺激 ATP 依赖性 DNA 解旋酶。 J.生物学。化学，285(15):11087-11092。 PMID：20129926.Evans, T.C. Jr., Benner, J. 和 Xu, M.Q. (1998) 使用模式半合成细胞毒性蛋白固定蛋白剪接元件。蛋白质科学，7(11):2256-2264。 PMID：9827992。

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& Modification\' title=\"Protein Expression& Modification\">Protein Expression& Modification

Protein Expression and Modification Research 部门在两大领域开展研究：蛋白质表达，主要重点是改进微生物（尤其是大肠杆菌）中异源蛋白质的生产过程。宿主菌株是为了研究蛋白质折叠而设计的。通过遗传筛选和功能宏基因组学发现新的和有趣的酶活性。蛋白质的翻译后修饰，以了解氧化蛋白质折叠，特别是二硫键的形成。研究了蛋白质连接的聚糖的结构、功能和生物学，重点是改进蛋白质组学和糖组学工作流程。改进的工作流程用于研究复杂的生物样本像血清和哺乳动物和寄生虫细胞的细胞表面。视频+Chris Taron，NEB® 的蛋白质表达和修饰研究

在此视频中，Chris Taron 描述了蛋白质表达和修饰研究的目标和兴趣NEB 分部。

Christopher Taron

Scientific Director Ph.D., University of Illinois, 1999

领域焦点：

蛋白质表达和糖生物学

查看实验室页面 Christopher Taron

科学主任博士，伊利诺伊大学，1999 年

关注领域：

蛋白质表达和糖生物学

当前研究：

我们的大部分基础研究都在糖生物学和糖组学领域。目前，我们主要感兴趣的领域是改进糖组学方法，以发现基于聚糖的哺乳动物体液（如血清）中的疾病生物标志物。特别是，我们正在开发新的定量分析方法，旨在进一步提高基于聚糖的诊断测试的合理性。Erest 涉及开发新的分析方法以改进糖脂的研究，例如糖基磷脂酰肌醇锚 (GPI) 和糖鞘脂。

除了糖生物学，我们还重视蛋白质表达。我们开发了在各种酵母宿主中生产异源蛋白质的新技术。我们的目标是针对与酵母中蛋白质表达相关的各种瓶颈开发解决方案，这些解决方案可以在实验室和商业规模上实施。另一个重点领域涉及使用蛋白质表达作为发现新酶的手段。特别是，我们利用功能宏基因组学工作流程来筛选大型环境 DNA 文库，以确定新的酶活性。特别是，我们有兴趣定义碳水化合物活性酶的新家族。

精选出版物：O\'Flaherty, R.、Harbison, A.、Hanley, P.、Taron, C.H.、Fadda, E . 和 Rudd, P.M. (2017) 氨基喹啉荧光标记阻碍效率t 通过牛肾 α-L-岩藻糖苷酶 (BKF) 去除 N-聚糖核心 α(1-6) 岩藻糖。 J. 蛋白质组研究，16:4237-4243。 PMID：28953389.Chuzel, L., Ganatra, M.B., Schermerhorn, K.M., Gardner, A.F., Anton, B.P.和 Taron, C.H. (2017) 乳酸克鲁维酵母菌株 GG799 的完整基因组序列，一种用于异源蛋白表达的常见酵母宿主。基因组公告，5：e00623-17。 PMID：28751387.Chen, M., Shi, X., Duke, R.M., Ruse, C.I., Dai, N., Taron, C.H.和 Samuelson, J.C.（2017 年）一种工程化的高亲和力 Fbs1 碳水化合物结合蛋白，用于选择性和无偏见地捕获 N-聚糖和 N-糖肽。纳特。共同体，8:15487-15501。 PMID：28534482.Albrecht, S.、Vainauskas, S.、Stöckmann, H.、McManus, C.、Taron, C.H.和陆克文，P.M. (2016) 在高通量工作流程中使用新型广泛特异性内切神经酰胺酶对鞘糖脂聚糖进行全面分析。肛门。化学，88:4795-4802。 PMID：27033327.Vainauskas, S., Duke, R.M., McFarland, J., McClung, C., Ruse, C. 和 Taron, C.H. (2016) 使用特异性识别 α1,6 岩藻糖基化壳二糖的新型细菌凝集素分析核心岩藻糖化 N-聚糖。科学。代表，2016 年 9 月 28 日；6:34195。 PMID：27678371

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Jeremy M. Foster

Staff Scientist Ph.D.,利物浦大学，1989

焦点区域：

丝虫线虫的基因组学和糖生物学

查看实验室页面Jeremy M. Foster

职员科学家博士，利物浦大学，1989 年

重点领域：丝状线虫的基因组学和糖生物学当前研究：

寄生丝状线虫威胁着地球上五分之一人口的福祉，并使严重感染的社区陷入贫困。少数可用的疗法不会杀死成虫，但通过针对由昆虫载体传播的幼虫形式来防止传播。这些药物正在失去效力，而且没有可用的疫苗。丝状线虫的沃尔巴克氏体内共生体对于寄生虫发育和成虫存活至关重要，为丝虫病提供了新途径控制。实验室的研究旨在揭示丝虫和沃尔巴克氏体生物学的各个方面，这些方面可能突出分子或过程以进一步开发为药物靶标、候选疫苗或诊断c 试剂。

丝虫线虫可在具有免疫活性的哺乳动物宿主中存活多年。蠕虫表面富含与免疫调节和免疫逃避机制有关的糖缀合物。我们正在应用新的试剂和技术来表征特定类别的表面糖缀合物，并识别可能用作疫苗成分或诊断工具的异常糖修饰。我们还应用血清糖谱分析来突出疾病进展的潜在生物标志物。

我们使用 NextGen 测序来检查丝虫线虫及其 Wolbachia 内共生体的不同地理分离株和实验室菌株内部和之间的多样性。对处于不同选择压力下以及人类和昆虫宿主之间生命周期进展所需的基因进行详细的功能表征。

精选出版物：Dunning Hotopp, J.、Slatko, B. E. 和 Foster, J. M.（2017 年） ) 近期内共生体的靶向富集和测序nt 宿主横向基因转移。科学。代表，7:857。内政部：10.1038/s41598-017-00814-4。 PMID：28405008.Luck, A. N.、Slatko, B. E. 和 Foster, J. M.（2017）大海捞针：通过 Cappable-seq 从宿主线虫 RNA 中富集 Wolbachia 内共生体转录本。公共科学图书馆一号，12(3):e0173186。 PMID：28291780.Slatko, B. E., Luck, A. N., Dobson, S. L. and Foster, J. M. (2014) Wolbachia 内共生体和人类疾病控制。摩尔。生化。 Parasitol., 195, 88-95. PMID：25046729.Scott, A. L.、Ghedin, E.、Nutman, T. B.、McReynolds, L. A.、Poole, C. B.、Slatko, B. E. 和 Foster, J. M.（2012）丝虫和沃尔巴克氏体基因组学。寄生虫免疫学，34，121-9。 PMID：22098559.Foster, J., Ganatra, M., Kamal, I., Ware, J., Makarova, K., Ivanova, N., Bhattacharyya, A., Kapatral, V., Kumar, S., Posfai , J., Vincze, T., Ingram, J., Moran, L., Lapidus, A., Omelchenko, M., Kyripides, N., Ghedin, E., Wang, S., Goltsman, E., Joukov , V., Ostrovskaya, O., Tsukerman, K., Mazur, M., Comb, D., Koonin, E.和 Slatko, B. (2005) Brugia malayi 的 Wolbachia 基因组：人类致病性线虫内的内共生体进化。 PLoS Biol., 3, 0559-0614。 PMID：15780005。查看 NEB 的所有期刊出版物 »James Samuelson

高级科学家博士，俄亥俄州立大学，2000焦点区域：

微生物菌株工程、蛋白质工程和糖生物学

查看实验室页面 James Samuelson

高级科学家，俄亥俄州立大学博士，2000

重点领域：

微生物菌株工程、蛋白质工程和糖生物学

当前研究：

大肠杆菌菌株是生产重组蛋白的首选宿主。因此，我们正在开发大肠杆菌基因组工程的快速方法，以便为个体定制表达宿主。感兴趣的蛋白质。这项工作涉及开发可扩展、易于实施和产生高纯度蛋白质的表达系统。

此外，该实验室专注于开发定制的诱变和文库筛选策略，以分离蛋白质变体具有改进的特性。最近的项目包括应用质粒展示来分离高亲和力结合试剂，以富集 N-连接聚糖和糖肽，以帮助发现疾病生物标志物。Fbs1 糖肽潮汐富集技术目前正被应用于研究癌细胞糖蛋白组和受刺激激活特定信号转导通路的细胞的糖蛋白组变化。

精选出版物：Chen, M., Shi, X., Duke, R.M.、Ruse、C.I.、Dai, N.、Taron, C.H.和 Samuelson, J.C.（2017 年）一种工程化的高亲和力 Fbs1 碳水化合物结合蛋白，用于选择性捕获 N-聚糖和 N-糖肽。纳特。社区，8:15487。内政部：10.1038/ncomms15487。 PMID：28534482.Chen, M. 和 Samuelson, J.C. (2016) 缺乏 DsbA 的周质能够在 M13 噬菌体上展示具有氧化还原敏感折叠功能的蛋白质。生物化学，55:3175-3179。 PMID：27210801.Tikh, I.B.和 Samuelson, J.C.（2016 年）利用现代 DNA 组装技术进行快速、无标记的基因组修饰。生物学方法和方案，doi:10.1093/biomethods/bpw004.Gupta, Y.K., Yang, L., Chan, S.H, Samuelson, J.C., Xu, S.Y.和 Aggarwal, A.K. (2012) 对 t 的组装和形状的结构洞察类型 III 限制修改 (R-M) EcoP15I 复杂的小角度 X 射线散射。 J.摩尔。生物学，420(4-5):261-8。 PMID：22560991.Robichon, C.、Luo, J.、Causey, T.B.、Benner, J.S.和 Samuelson, J.C. (2011) 工程化大肠杆菌 BL21(DE3) 衍生菌株，以在通过固定化金属亲和层析纯化后最大限度地减少大肠杆菌蛋白质污染。申请环境。微生物学，77:4634-4646。 PMID：21602383。

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Elisabeth Raleigh

名誉科学家博士，麻省理工学院，1981

焦点区域：

向细菌染色体添加新基因并控制它们的传播。

查看更多伊丽莎白·罗利

Emer itus 科学家，麻省理工学院博士，1981 年

重点领域：

向细菌染色体添加新基因并控制它们的传播。

当前研究：

我的研究兴趣是形成水平形状的机制基因转移。主要关注决定 RM 系统分布和表达的分子机制。

特别感兴趣的是修饰依赖性限制系统 (MDRS)，它在 DNA 被修饰时而不是未被修饰时切割。MDRS 的这种作用影响\"clonab”来自许多来源的 DNA 的\"能力”，无论是科学家还是通过自然转移；它还会影响哪些 RM 系统可以在小区中共存。此处开创了对这些酶的识别特异性和作用模式的研究。

我们转而探究哪些遗传机制有助于 RM 系统获得，以了解如何RM 库的多样化发生在人群中。这个具体问题举例说明了一个更普遍的问题，即\"基因组岛变异”的起源，它允许一个谱系探索与其环境相互作用的多种模式。在个别案例中有传闻式的答案——例如，转座因子、位点特异性重组系统和有利的局部 DNA 序列被推断在不同情况下发挥作用。我们专注于单个位置的多样化过程，即大肠杆菌染色体高度可变的\"移民控制区”e.我们发现了有助于大肠杆菌中非同源基因获取的新基因和蛋白质，并将研究扩展到其他肠道细菌。

精选出版物：Kingston, A.W.、Ponkratz, C. 和 Raleigh, E.A. (2017) 大肠杆菌 K-12 的 Rpn（YhgA 样）蛋白及其对 RecA 独立水平转移的贡献。 J. Bacteriol., 199, e00787-00716-00717.Fomenkov, A., Sun, Z., Dila, D.K., Anton, B.P., Roberts, R.J.和罗利，E.A. (2017) EcoBLMcrX，大肠杆菌 B 中一种经典的修饰依赖性限制酶：体内外表征，采用一种新的裂解位点测定方法。 PloS 1, 12, e0179853.Weigele, P. 和 Raleigh, E.A. (2016) 细菌及其病毒修饰碱基的生物合成和功能。化学。 Rev. 116, 12655-12687.Kingston, A.W.、Roussel-Rossin, C.、Dupont, C. 和 Raleigh, E.A. (2015) 大肠杆菌 K-12 中的新型 recA 独立水平基因转移。公共科学图书馆 1, 10, e0130813.Loenen, W.A. 和 Raleigh, E.A. (2014) 限制的另一面：修饰依赖酶。核酸研究，42, 56-69。

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Mehmet Berkmen

工作人员科学家博士，维也纳大学，休斯顿大学，2000

关注领域：

应变工程和二硫键蛋白质折叠

查看实验室页面Mehmet Berkmen

2000 年维也纳大学休斯顿大学研究员科学家

重点领域：

应变工程和二硫键蛋白质折叠

当前研究：

我们有兴趣了解控制蛋白质氧化折叠的分子机制。许多重要的蛋白质需要二硫键才能折叠和稳定，包括抗体、干扰素、蛋白酶和信号转导蛋白质。在蛋白质中形成正确的二硫键需要属于硫氧还蛋白家族的酶的协调活性。在真核生物中，二硫键的形成被划分到内质网，其中 30% 的所有蛋白质折叠；其中一半是预测的形成二硫键。在革兰氏阴性原核生物中，二硫键的形成发生在周质中。深入了解二硫键形成过程对于生产复杂的二硫键结合的蛋白质。

我们的研究重点是如何催化二硫键的形成。此外，我们对错误氧化的蛋白质如何异构化回到其原始正确折叠状态感兴趣。我们使用模式生物大肠杆菌在体内研究这些原理。具体而言，我们的研究重点是了解在大肠杆菌的两个不同区室（还原细胞质和氧化周质）内形成二硫键的机制。我们希望，(i) 提高我们对氧化折叠机制的理解，(ii) 鉴定可协助蛋白质氧化折叠的新型酶，以及 (iii) 设计可表达多二硫化物的突变大肠杆菌菌株以高产量键合蛋白质。

选定出版物：Cobo, M.P., Libro, S., Marechal, N., D\'Etermont, D., Cobo, D.P.和 Berkmen, M. (2017) 使用延时成像可视化细菌菌落形态。 J. Bacteriol.，12 月 20 日；200(2)。 PMID：29084858.Hibender, S., Landeta, C., Berkmen, M., Beckwith, J. 和 Boyd, D. (2017) Aeropyrum pernix 膜蛋白 VKOR 促进两个亚细胞区室中蛋白质二硫键的形成。微生物学，12 月；163(12)：1864-1879。 PMID：29139344.Mizrachi, D.、Robinson, M.P.、Ren, G.、Berkmen, M. 和 DeLisa, M. P.（2017）一种在体内催化二硫键形成的水溶性 DsbB 变体。纳特。化学。生物学，9 月；13(9)：1022-1028。 PMID：28628094.Landgraf, J. B.、Ren, G.、Thorsten, M.、Boyd, D. 和 Berkmen, M.（2017）从生物学到生物技术：大肠杆菌中二硫键的形成。在 Samie, A.（主编），大肠杆菌 - 生理学、发病机制和生物技术应用的最新进展。国际标准书号 978-953-51-3330-8。 Intech.Ren, G.、Ke, N. 和 Berkmen, M. (2016) 在蛋白质生产中使用 SHuffle 菌株。当前。协议书。在蛋白质科学中，8 月 1 日；85:5.26.1-5.26.2。 PMID：27479507。

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RNA

The RNA Research Division 致力于发现、理解和开发酶和工作流程，以实现 RNA 研究，包括：

新的酶和工作流程，以实现任何规模的信使 RNA 和 RNA 合成有助于理解表观转录组的酶和工作流程 RNA 引导的核酸酶能够按需进行可编程 DNA 审讯

这项研究将有助于指导 New England Biolabs 未来的产品供应。

视频+ Brett Robb，NEB® 的 RNA 研究

在此视频中，Brett Robb描述了 NEB RNA 研究部的目标和兴趣。

Brett Robb

多伦多大学科学主任博士，2004

研究领域：

RNA-programmed nucleases, mRNA capping

查看更多Brett Robb

科学总监，多伦多大学，2 004

关注领域：

RNA-programmed nucleases, mRNA capping

当前研究：

RNAs 扮演着许多生物学角色。它们可以作为信息载体、结构支架、生物催化剂，它们可以指导酶的活性. 此外，RN 的化学修饰As 可以影响这些功能中的每一个。

我们的实验室目前专注于 2 个领域：RNA 编程的 CRISPR 相关 (Cas) 核酸酶和信使 RNA 加帽酶。

RNA 引导的靶向和切割 DNA 的 Cas 核酸酶是原核生物获得性免疫的关键效应物。来自化脓性链球菌的 Cas9 核酸酶被改编成，然后迅速被用作可编程 DNA 结合和切割的多功能工具。基于 Cas9 的基因组工程是过去十年中开发的最重要的研究支持技术之一。为了进一步了解编程特异性、目标相互作用和询问的机制，我们使用分子生物学和生物化学来表征来自测序生物体和环境宏基因组的 Cas 核酸酶。

真核 mRNA 用 5\'-帽修饰包含以 5\' 到 5\' 三磷酸构型连接到 RNA 的甲基化鸟苷的结构。 5\'-帽在核博览会中发挥关键作用rt，mRNA 的剪接和翻译。通过研究来自不同生物体的 mRNA 加帽机制，我们正在努力了解 mRNA 加帽酶 (CE) 的酶活性，以寻找和设计更优质的酶。

选定的出版物：Yourik P、Fuchs RT、Mabuchi M，Curcuru JL，Robb GB。金黄色葡萄球菌 Cas9 是一种多周转酶。核糖核酸。 2019 年 1 月；25(1)：35-44。内政部：10.1261/rna.067355.118。 Epub 2018 年 10 月 22 日。PubMed PMID：30348755.Ramanathan, A., Robb, G.B.和 Chan, S.H. (2016) mRNA 加帽：生物学功能和应用。核素。酸研究，9 月 19 日；44(16):7511-26。 doi:10.1093/nar/gkw551。 Epub 2016 年 6 月 17 日。评论。考研 PMID：27317694； PubMed Central PMCID：PMC5027499.Fuchs, R.T.、Sun, Z.、Zhuang, F. 和 Robb, G.B. (2015) 基于连接的小 RNA 测序文库构建的偏差由适配器和 RNA 结构决定。 PLoS One，5 月 5 日；10(5):e0126049。 doi：10.1371/journal.pone.0126049。 eCollection 2015. 考研 PMID：25942392； PubMed 中心 PMCID：PMC4420488.Yamanaka, S., Mehta, S., Reyes-Turcu, F.E., Zhuang, F., Fuchs, R.T., Rong, Y., Robb, G.B.和 Grewal, S.I. (2013) 由专门机器触发的 RNAi 使发育基因和反转录转座子沉默。自然，2013 年 1 月 24 日；493(7433)：557-60。 doi:10.1038/nature11716。 Epub 2012 年 11 月 14 日。PubMed PMID：23151475； PubMed Central PMCID：PMC3554839.Zhuang, F., Fuchs, R.T.和 Robb, G.B. (2012) 通过高通量测序进行小 RNA 表达谱分析：酶促操作的意义。 J.核。酸。 2012；2012：360358。内政部：10.1155/2012/360358。 Epub 2012 年 6 月 20 日。PubMed PMID：22778911； PubMed Central PMCID：PMC3388297.Zhuang, F.、Fuchs, R.T.、Sun, Z.、Zheng, Y. 和 Robb, G.B. (2012) T4 RNA 连接酶介导的 3\'-接头连接中的结构偏差。核素。酸研究，4 月；40(7):e54。 doi:10.1093/nar/gkr1263。 Epub 2012 年 1 月 12 日。PubMed PMID：22241775； PubMed Central PMCID：PMC3326334。

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Erbay Yigit

马萨诸塞大学医学院研究员，博士，2007

研究领域：

RNA 修饰和 RNA 修饰酶

查看实验室页面Erbay Yigit

Staff Scientist Ph.D., University of Massachusetts Medical School, 2007

研究领域focus:

RNA修饰和RNA修饰酶

当前研究ch:

已知的 RNA 化学修饰有一百多种。修饰是专门位于 RNA 分子中的位点，存在于生命的所有三个领域（古细菌、原核生物、真核生物）中。 tRNA 和 rRNA 包含许多不同的 RNA 修饰，而目前已知有六种修饰存在于 mRNA 中（2\'-O-甲基、假尿苷、5-甲基胞嘧啶、5-羟甲基胞嘧啶、N1-甲基腺苷、N6-甲基腺苷）。 mRNA 修饰的确切作用尚不清楚。在细胞中，转录后 RNA 修饰以两种方式引入。第一条途径使用一种独立的酶来修饰目标 RNA 上的特定位置，而第二条途径使用含有称为小核仁 RNA (snoRNA) 的短向导 RNA 的核糖核蛋白复合物来实现这一点。我的团队对这两种 RNA 修饰酶的鉴定和表征以及确定它们的底物特异性和在细胞中的生物学作用很感兴趣。

Selected Publications：Ettwiller, L.、Buswell, J.、Yigit, E. 和 Schildkraut, I. (2016) 一种新的富集策略揭示了模型原核生物和肠道微生物组中单碱基分辨率下前所未有的新转录起始位点数量。 BMC 基因组学，3 月 8 日；17(1):199。 PMID：26951544.Yigit, E.、Hernandez, D.I.、Trujillo, J.T.、Dimalanta, E. 和 Bailey, C.D. (2014) 基因组和宏基因组测序：使用人类甲基结合结构域来划分源自植物组织的基因组 DNA。申请植物科学，11 月 3 日；2(11)。 PMID：25383266.Feehery, G.R., Yigit, E., Oyola, S.O., Langhorst, B.W., Schmidt, V.T., Stewart, F.J., Dimalanta, E.T., Amaral-Zettler, L.A., Davis, T., Quail, M.A. and Pradhan, S. (2013) 一种从污染的脊椎动物宿主 DNA 中选择性富集微生物 DNA 的方法。 PLoS One，10 月 28 日；8(10)：e76096。 PMID：24204593.Yigit, E., Zhang, Q., Xi, L., Grilley, D., Widom, J., Wang, J.P., Rao, A. and Pipkin, M.E. (2013) 高分辨率核小体映射目标地区我们进行基于 BAC 的富集。核素。酸研究。四月; 41(7):e87。 PMID：23413004.Yigit。 E., Bischof, J.M., Zhang, Z., Ott, C.J., Kerschner, J.L., Leir, S.H., Buitrago-Delgado, E., Zhang, Q., Wang, J.P., Widom, J. 和 Harris, A.（ 2013）跨 CFTR 基因座的核小体映射识别新的监管因素。核素。酸研究。 3 月 1 日；41(5)：2857-68。 PMID：23325854。

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Ira Schildkraut

名誉科学家博士，迈阿密大学，1974 年

焦点区域：

RNA 的酶促操作

查看实验室页面Ira Schildkraut

迈阿密大学名誉科学家博士，1974 年

重点领域：

RNA 的酶促操作

当前研究：

我目前的研究兴趣是识别酶/活性可用于操纵 RNA。我们已经表征了与各种真核帽结构发生特异性反应以从真核 RNA 上去除帽的活动。这些特殊活动很有趣，因为它们会留下 5\' 二磷酸。我们还表明，牛痘加帽酶 ( VCE) can add a 3\' biotinylated GMP to the 5\' triphosphate or diphosphate of RNA. 这些新描述的特性共同使我们能够开发出一种富集原核 R 初级转录本的方法NA 以及真核加帽 RNA。该方法克服了所有微生物 RNA 制剂中固有的过多核糖体 RNA 的挑战，无论属。随后在链霉亲和素磁珠上选择生物素化的转录物，同时消除不需要的加工和核糖体转录物。该方法产生 NextGen 测序文库，用于确定转录起始位点到一个碱基对分辨率，原核生物或真核生物。目前正在对这些方法进行调整，以使用长读长测序技术揭示真核剪接变体。

选定出版物：Boutard, M., Ettwiller, L., Cerisy, T., Alberti, A., Labadie, K., Salanoubat , M., Schildkraut, I. 和 Tolonen, A.C. (2016) 植物发酵细菌中转录起始位点的全球重新定位。 Nature Communications, 7, 13783. PMID: 27982035.Ettwiller, L., Buswell, J., Yigit, E. and Schildkraut, I. (2016) 一种新颖的富集策略揭示了前所未有的数量模型原核生物和肠道微生物组中单碱基分辨率的新转录起始位点的错误率。 BMC 基因组学，17:199。 PMID：26951544.Tzertzinis, G.、Schildkraut, E. 和 Schildkraut, I. (2012) 海洋荧光素酶中的底物协同作用。公共科学图书馆一号，7(6):e40099。 Epub 2012 年 6 月 29 日。PMID：22768230.Bitinaite, J., Rubino, M., Varma, K.H., Schildkraut, I., Vaisvila, R. 和 Vaiskunaite, R. (2007) 用户友好的 DNA 工程和尿嘧啶切除克隆方法.核素。酸研究，35(6):1992-2002。 PMID：17341463.Vanamee, E.S.、Viadiu, H.、Kucera, R.、Dorner, L.、Picone, S.、Schildkraut, I. 和 Aggarwal, A.K. (2005) 从与 DNA 结合的四聚体核酸内切酶 SfiI 的结构看连续结合事件。 EMBO J.，12 月 7 日；24(23)：4198-208。 PMID：16308566。

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Ivan Correa

高级科学家，坎皮纳斯州立大学博士，2003

关注领域：

核酸修饰、生物正交探针、合成化学、质谱。

查看实验室页面伊万科雷亚

资深科学家，坎皮纳斯州立大学博士，2003 年

重点领域：

核酸修饰、生物正交探针、合成化学、质谱分析。

当前研究：

我实验室的主要重点是设计和合成化学物质s 的探针在体外和活细胞中研究生物分子。我们努力将合成化学的概念引入生物系统，以跟踪、操纵、分离和询问核酸、蛋白质、聚糖和其他细胞物种。我们对开发用于研究 DNA、RNA 及其具有生物学意义的修饰的化学和生物分析工具特别感兴趣。项目涉及多阶段质谱、化学合成和生化分析在表观遗传和表观转录组修饰的筛选、鉴定和量化方面的应用。另一个重点领域是开发新的化学和生物学策略来组装 RNA 5\'-cap 结构，用于细胞转录本的靶向富集和测序。我们的实验室从事多项研究合作，旨在研究各种生物体的核酸修饰以及相应修饰的表征n 酶。

我们还对设计用于 SNAP-tag 和 CLIP-tag 蛋白质标记系统的创新化学探针感兴趣。我们在合成荧光染料、阻断剂、生物素标记和具有独特特性的功能化构建块方面所做的努力使研究人员能够以更高的分辨率和更小的背景对生物结构进行成像。目前的项目侧重于改进固定 SNAP 标签融合蛋白的方法，以及扩大用于检测蛋白质-蛋白质和蛋白质-核酸相互作用的多功能探针的范围。

精选出版物：Tsai, R. , Corrêa, I.R. Jr., Xu, M.Y.和徐，S.Y. (2017) 含脱氧古生氨酸 (dG+) 的噬菌体 9 g DNA 的限制和修饰。科学。 Rep., 7(1): 8348. PMID: 28827753.Sun, Z., Dai, N., Borgaro, J.G., Quimby, A., Sun, D., Corrêa, I.R. Jr., Zheng, Y., Zhu, Z. 和 Guan, S. (2015) 绘制全基因组 5-羟甲基胞嘧啶的灵敏方法和单碱基分辨率的 5-甲酰基胞嘧啶。分子细胞，57：750-761。 PMID：25639471.Hashimoto, H., Pais, J. E., Zhang, X., Saleh, L., Fu, Z.Q., Dai, N., Corrêa, I.R. Jr., Zheng, Y. 和 Cheng, X. (2014) 与 5-甲基胞嘧啶 DNA 复合的 Naegleria Tet 样双加氧酶的结构。自然，506：391-395。 PMID：24390346.Dai, N.、Bitinaite, J.、Chin, H.G.、Pradhan, S. 和 Corrêa, I.R. Jr. (2013) 用于选择性标记 5-羟甲基胞嘧啶的 UDP-GlcN 衍生物的评估。化学生物化学，14：2144-2152。 PMID：24106095.Sun, X., Zhang, A., Baker, B., Sun, L., Howard, A., Buswell, J., Maurel。 M.、Masharina, A.、Johnsson, K.、Noren, C. J.、Xu, M.Q.和 Corrêa, I.R. Jr. (2011) 用于免洗荧光成像的 SNAP 标签荧光探针的开发。化学生物化学，12：2217-2226。 PMID：21793150。

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S. Hong Chan

Staff Scientist Ph.D, 香港中文大学, 2000

研究领域：

mRNA 加帽和 5\' 修饰酶和技术

查看实验室页面S. Hong Chan

St香港中文大学aff科学家博士Kong, 2000

重点领域：

mRNA 加帽和 5\' 修饰酶和技术

当前研究：

精选出版物：