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基于小鼠神经元细胞的 HR 报告基因(需要 I-Sce 转染)动物细胞中的 DNA 修复途径可分为两大类:HR 和 NHEJ。 HR 或同源重组是一条次要途径,但对于保护细胞免受基因毒性非常重要。 HR需要同源序列并且仅限于S期。基于特定报告基因的 HR 测定对于药物发现项目非常有益,可以更多地了解 DNA HR 修复过程并建立交叉途径和可药物途径目标。
这是第一个已被证实的 HR 报告基因。被设计成神经元衍生的小鼠细胞系模型。 CN1.4 细胞系是源自小鼠胚胎第 13 天神经元培养物的克隆。该线路已改造为using 温度敏感的 SV-40 大 T 抗原。该细胞系表达多种神经元标记,包括神经丝、谷氨酸脱羧酶 67、神经元特异性烯醇化酶和髓磷脂碱性蛋白基因的 BG21 亚型。由于温度敏感T抗原的存在,细胞在34℃的正常条件下培养。在这些条件下,细胞将不断分裂,并且一些细胞将显示部分分化表型,延长短神经突(J Neurosci Res.54(3):309-19)。细胞通常在 34°C 正常培养条件下在补充有 10% FBS 的 DMEM 中培养。 CN1.4 细胞可以通过在具有结合底物(即聚-D-赖氨酸、胶原蛋白或层粘连蛋白)的培养皿中于 39oC 下培养细胞来进行终末分化。某些神经营养因子,例如 BDNF 和 IGF,以及将分化培养基中的 FBS 量减少至 1-2%,可能有助于分化过程,但细胞会在也不存在这些因素。一旦分化,细胞就会表现出神经元形态并产生长而复杂的树突和神经元网络。如果培养时间较长,分化后,树突网络可能会变得相当广泛和密集。
CN1.4 系代表了一种独特的神经元模型,可用于研究神经元过程和事件,例如系统中的神经变性与原代培养物密切相关,但可以作为稳定的细胞系维持。迄今为止,利用 CN1.4 系来研究神经元表型细胞中 DNA 修复机制的研究很少(如果有的话)。该细胞系将是一个强大的工具,可用于研究分化前和分化后神经元系中 DNA 修复机制和神经元过程的交叉点。
在 HR(有时称为基因转换)中,供体 DNA DSB 两侧具有同源性的序列提供修复断裂的遗传信息。同源se序列被复制到损坏的基因座中,使修复的基因座成为供体序列的精确副本,而不改变供体序列(图 1)。
基于细胞/细胞背景系统的设计使研究人员能够检查和询问活细胞中的 HR 过程。 HR 试剂盒使用双 GFP 盒,通过同源重组 (HR) 将 GFP 阴性细胞转化为 GFP 阳性细胞。由于野生型(同源)GFP 片段紧邻 DNA 断裂,因此会通过 HR(如基因转换)进行 DNA 修复。为了实现精确的 DNA 切割,大型核酸内切酶 (I-Sce1) 在 Cassette 1 的 GFP 基因座中引入 DS 断裂(图 1)。值得注意的是,人类基因组不包含 I-Sce1 位点;因此,盒 1 中的 I-Sce1 位点意味着 DS 断裂仅发生在该精确位置,而不发生在基因组的其他位置。 DS 中断启动 HR 并使用 WT 序列作为同源模板(位于盒 2 中),基因转换为 WT,并出现 GFP 阳性细胞(图 2)。 HR 由 DS 断裂触发,DS 断裂是通过用 I-Sce1 表达质粒转染细胞来实现的(图 2)。 HeLa 细胞模型中的 HR 如图 3 所示。通过 pSCE1 转染可以轻松诱导 CN1.4 细胞中的 HR,典型结果如图 4 所示。通常 2-10% 的细胞会转化为转染后 48 小时内出现 GFP+。
HR-CN1.4 细胞准备在 T-25 烧瓶中培养或作为冷冻细胞沉淀(客户可以要求)。我们为希望储存细胞以供将来使用的客户提供冷冻细胞。我们还可以将活细胞发送给希望立即开始使用该生产线的客户。I-Sce1 基因表达质粒、pSCE1。嘌呤霉素原液。详细的协议描述了如何设置和使用该试剂盒来分析细胞宿主中的 HR 机制。客户rs 可能会要求接收准备用于培养的报告细胞系(在环境温度下运输)。细胞在接种前可在 4°C 下保存不超过 1 周。其他试剂应在收到后储存在 4°C(短期)或 -20°C(长期)下。客户还可以要求冷冻细胞,这些细胞必须放置在超低温冰箱(-80°C)或液氮储存中,直到准备使用。
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