Denovo FCS Express6使用指南-流式数据分析入门篇(上)-蚂蚁淘生物

今天分享的内容主要按照数据分析的逻辑来讲，微信篇幅有限，并没有着重去介绍版面上每个按钮的界面和功能，有想了解这部分内容的可以点击文末视频链接~1.打开软件在开始菜单栏中单击软件（或者在桌面上双击FCS Express6快捷方式） 2.版面介绍以下绘图均是FCS express6的flow版本，试用版本为6plus版本，后者的功能更全，操作界面基本相似，略有不同。如需要分析数据，点击右上角的New layout。会出现如下类似于microsoft的操作版面： 3.添加数据打开数据文件夹，将数据文件(FCS or LMD格式)拖入页面空白处，松手。会出现下边的界面： $\"\"$ 对话框会让您选择数据显示的方式，散点图，密度图，彩点图，等高线图，三维模拟图，峰图等等，在您希望的数据显示方式前边勾上复选框（示例中选中的彩点图），点击OK！如下图所示： $\"\"$ 此时点击Data List按钮，会发现文件夹中的数据都被加载过来了，如下图所示：选中彩点图后，您会发现，Data栏下边会有previous和next 2个按钮，这2个按钮可以切换当前散点图的数据源，遵循的顺序就是Data List中的顺序。例如我们点击next，彩点图的数据源会切换由”blank.fcs”切换为”cd3.fcs”。如果当前数据的绘图不符合您的需求，坐标轴的标签是可以在标签出左键单击改动的。如有进一步的改动需求，您可以选中图形，点击右键会出现一系列选项，点击”format”，基本的关于图形的编辑都在这里。（如果是Diva experiment或者是C6的数据，可以点击File-Open from-Import 选择Diva experiment或者是C6，然后再选择文件，以C6为例，如下图） C6的实验数据分别用Denovo和C6仪器自带软件打开后的结果展示如下：此时点开Data-Data list,C6文件中的每个well的数据都被加载进来了。 4.圈门在软件上方菜单栏中有一项是\"Gate”，点击它，会出现可以画门的图形选项，圆形门，方形门，多边形门，自由门，十字门是针对散点图，等高线图，彩点图等等二维图型的，其中marker是针对峰图等一维图型的，具体示例如下图：圈门之后，若希望下一个图形只展示Gate1门内的数据，需要做这样一个简单的操作，左键点击Gate1门，拖住Gate1门，往页面空白处拖动并松手，新的图形便形成了，此时可以根据需求改动横纵坐标轴的参数，示例如下图所示：如果您有进一步圈门的需求，您可以继续圈门，并使用拖放功能来实现新的图形只展示目标门中的数据。另外门与门之间的逻辑图可以点击”Insert”——\"Gate View”，然后在空白版面出画出。 5.坐标轴标签的改动如果您采集数据的时候并没有命名细胞marker和荧光素的关系，您可以在软件中设置。步骤如下图：以上五步做完之后，按照下图继续设置：如果您有多个marker，您需要继续点击Add按钮添加，全部添加完成后如下图所示：然后点击右下角的OK。Parameter lables编辑成功之后如何应用到绘图上呢？选中待改变坐标的绘图，点击菜单栏的Format,点击Axes，如下图所示：标签就可以应用过来了，应用前后如下图： $\"\"$ 本期的介绍先到这里啦，是不是等不及去试试拖放功能呢？下期会为大家介绍补偿的调节和应用，实验数据统计以及一些实用的小技巧。感兴趣的可以保持关注哦！视频百度网盘链接：链接: https://pan.baidu.com/s/1pLsU8Ld 密码: 2a84（软件的中文视频是FCS express4的，数据导入等基本操作和FCS Express6 试用版一致）

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