虚拟筛选依赖分子模拟技术，从大量的有机化合物中遴选出可能有效的候选化合物，避免了对化合物的盲目筛选，从而大大降低了发现活性先导化合物的成本。虚拟筛选作为计算机辅助药物设计中的一项实用化技术，在当代的创新药物研发中发挥着重要的作用。近些年来，国内外针对一些重大疾病药物靶标均有许多成功使用虚拟筛选的实例。在这些成功的实例中，多种不同类型的小分子化合物数据库（通常包括100,000~1000,000个化合物）被用于虚拟筛选，从中获得了生物活性达到μM甚至nM级别的结构新颖的活性先导化合物。在此基础上，选择合适的小分子化合物库不仅能极大的提升工作效率同时能节省工作时间、购买费用等。鉴于多年从事虚拟筛选的经验，总结出一些心得分享给大家。1.电子数据的获得：不建议的方案：1）ZINC库，emolecules库：这两个属于平台服务性质，收集各个化合物库的公司的数据，放在平台上供大家筛选中。优势：数据量非常全劣势：很多筛出来的结果买不到实体化合物，且提供的数据更新不及时，或者筛选结果很分散，要去多个化合物库公司分别购买，多掏好几笔国际运费，效率和性价比都不高；2） Molport，Ambinter：这两个属于国外的贸易公司，如果从这两家公司购买，他们也是分别向原厂订购并加收高额的服务费；建议的方案：因为各化合物库供应商的定价政策是：单次购买化合物数量越多价格越便宜。所以直接使用各化合物库公司自己的电子数据并在单次筛选中尽量选用一个公司的分子库最好。这样既可以避免找不到实体化合物的情况,还能降低化合物单价及运费操作费；有的时候直接去国外工厂要数据比较麻烦，可以让专业的筛选化合物库代理公司免费提供电子数据。国内专业做这方面代理的不多，我知道的只有Topscience 就是陶素在做，大家有自己资源的也可以提下，互通有无嘛.从代理订还有个好处，定货的时候可以和其他客户一起运输，省了一半儿的国际运费，好几百块呢，呵呵。2.常用化合物库介绍：1）筛选化合物库分类：多样性化合物库、上市药物分子库、已知活性库、靶点化合物库，天然产物库，片段库等等；2）常用化合物库品牌：Chemdiv、Enamine、Lifechemicals、Specs、Chembridge、Maybridge、Microsource 、Vitas-M、Interbioscreen等；3）各品牌化合物的优劣势介绍：a.ChemDiv：140万库存分子，多样性被认为是商业库中最好的，每年新增20万以上的分子，每年新增的量就和Specs全部的分子数一样多了，而且有很多虚拟筛选的针对各靶点的子库，被大量的高通量筛选的客户选用。到货很快，快的时候1周就可以到货了。b.Enamine：100万以上，乌克兰的公司，多样性也不错，但价格要高于chemdiv；c.Lifechemicals：60多万种分子，库存量充足，如部分产品库存不足可很快完成合成及补充工作，进入中国市场较晚，价格中等；d.SPEC：20多万种分子，价格最便宜，最早进入中国市场，已经被各大研究单位无数次的反复筛选过。近年有些研究单位实验结果显示：没有新的化合物已经有将近10年未更新化合物，溶解性，多样性都相对比较差；e.Chembridge：有70万种小分子，将化合物分成1，2，3 或4类，价格都不一样，是依赖于化合物合成的难易来分的。相对价格较贵。f.Maybridge：只有6万种小分子，杂环化合物比较多，但因为定价最高，选择的人相对较少，同时到货周期也比较慢；g.Interbioscreen:主要优势在天然产物及其衍生物上。分为常规天然产物，稀有天然产物，常规天然产物衍生物，稀有天然产物衍生物，定价各不一样。但总体上天然产物的价格跟多样性化合物相比肯定是贵些，毕竟得到的难度要更大。h.如果想要筛选特色分子已知活性化合物，天然产物，上市药物分子等，可以找国内的代理上索要电子数据；以上这些都是我个人的一些心得，有感兴趣的话可以联系我。希望能够对同行的兄弟姐妹们有帮助。O(∩_∩)o…我想问问，我这里有一批maybridge的化合物，但是瓶子上的不适CAS号，例如AW00939SC， SCR00898SC。我该怎么样才能知道这个化合物的CAS号？？？？？？？？？Target Molecule坐落于美国生物医药最发达的马赛诸塞州，这里有多达900家Healthcare领域的公司，从大型医院到Starup的生物技术公司，都对药物小分子的研究注以浓厚的兴趣。为了以最快的速度获得新型药物分子或进行细胞诱导的实验，各家公司都对于已经上市或报道的药物小分子进行研究。但通常这些药物小分子的收集工作是非常繁琐的，会耗费科学家们大量的时间。同时，由于分子和细胞水平的实验用量非常小，又增加了收集的难度和对实验材料的浪费。为了解决这个问题，Target-Molecule公司推出了各种上市药物小分子库和活性抑制剂小分子库，以1mg，5mg的干粉和10mM的溶液向医药领域的客户提供灵活的产品集合，帮助生物学家和药学家得到了具有明确活性和毒性的上市药物研究的小分子，并收集了大量的抑制剂小分子以供科学家们进行细胞信号转导，细胞诱导，老药新用以及阳性对照的实验。现在Target Molecule与中国药物筛选的平台供应商陶素生化合作，把这一系列实用的产品带到了中国，目前主推的1600种上市药物小分子化合物库已经为中国的客户提供了从50ul到5mg的多种选择，同时还为信号转导的客户提供了品质卓越的抑制剂小分子，方便客户进行信号通路的针对性研究。感谢楼主，总结的很好，会对大家有所帮助的~Maybridge那个貌似破产啦，用那个库慎重点。。请教楼主知不知道哪些成药性较好的片段分子库？引用回帖:11楼: Originally posted by 331268942 at 2015-01-22 14:30:50感谢楼主，总结的很好，会对大家有所帮助的~Maybridge那个貌似破产啦，用那个库慎重点。。请教楼主知不知道哪些成药性较好的片段分子库？ 您方便留下一个联系方式吗？我们可以把详细关于成药性片段分子库的详细信息以邮件发送给您，或者联系邮箱info@tsbiochem.com