InputType: | RNA |
ResearchArea: | RNAMethylation |
TargetApplication: | AmountQuantitation |
VesselFormat: | 96-WellPlate |
100%Guarantee: | 6months |
TheEpiNext™5-mC RNABisulfite-SeqEasyKit(Illumina) isacompletesetofoptimizedreagents designedforeasilycarryingoutRNAbisulfiteconversion,followedbya"post-bisulfite"librarypreparationprocessforIlluminaplatform-basedbisulfitesequencing,allinonekit.IntendedapplicationsincludewholetranscriptomeRNAbisulfitesequencingandvariousotherRNAbisulfite-basednextgenerationsequencingtechniquesfor5-methylcytosine(5-mC)basedRNAmethylationanalysis.TheoptimizedprotocolandcomponentsofthekitallowtheRNAtobebisulfiteconvertedandfragmentedsimultaneously,followedbyquicknon-barcoded(singleplexed)and barcoded (multiplexed) libraryconstructionusinglow-nanogramquantitiesofbisulfiteconvertedRNA.
BackgroundInformation Principle&Procedure StartingMaterials |
Fig.2. Sizedistributionoflibraryfragments:Post-bisulfitecDNAlibrarywaspreparedfrom50ngofinputmouseRNAusingtheEpiNext™5-mC RNABisulfite-SeqEasyKit(Illumina). |
ConversionBuffer
ConversionPowder
NABindingSolution
F-SpinColumn**
F-CollectionTube
DesulphonationSolution
5XReactionBuffer*
ReactionEnzymeMix*
Adaptor-A(10µM)*
Adaptor-B(10µM)*
RNADigestionBuffer
RNADigestionEnzyme*
MQBindingBeads*
2XHiFiPCRMasterMix*
PrimerU(10µM)*
PrimerI(10µM)*
ElutionBuffer*
UserGuide
*Spinthesolutiondowntothebottombeforeuse.
**Alwayscapspincolumnsbeforeplacingtheminthemicrocentrifuge.
ebiomall.com
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是否可以理解为纯化水得PH范围为6.3-7.6?能否直接用pH计测量?谢谢!
常用流动相加酸碱后PH的总结,希望大家能够提供一点自己测过的结果,谢谢先
两个CEX方法A和B测定同一单抗,结果碱性峰比例差不多,酸性峰比例相差约7%,相应主峰也差了7%左右。
具体来说,A方法酸性峰高,主峰低,碱性峰稍微低点;B方法酸性峰低,主峰高,碱性峰稍微高点;另外也做了CIEF,结果呢和A方法更接近。
仔细比较起来,AB两个方法的峰性和数量差不多,就不知道为什么会有这么大的差异。两个方法一个用的WCX柱-磷酸缓冲液,一个用SCX柱-MES缓冲液
大家帮我分析下:
1.两个方法哪个方法更准确,是以酸性峰高的为准还是什么?为什么?
2.这显著差异是由方法造成,具体原因是什么?柱子?
3.CIEF的结果和A方法更接近,是不是可以由此证明A方法更好或者CIEF的方法更好(因为CIEF更快更方便)?
欢迎讨论~
纠正下,A方法用的是Tosoh的柱子,B方法用的是SCX柱。TOSOH的柱子是7um的填料,10cm长。SCX是10um的填料。我本人TOSOH的阳离子柱子用的很少,这次信手用用,结果发现差异很大
那我现在就考虑,在以后方法开发过程中,除了通过流动相pH和组成、梯度、柱子选择来获得样品主峰和酸碱性的最大分离,还要关注各峰比例。因为之前比较方法好坏都只看分离度,尤其是主峰和邻近峰的分离度,获得最大分离度,自然可以做到主峰尽可能纯,但从未认真比较过各峰比例。这是一个大疏忽吧!
另外,CIEF和CEX方法原理还是有点差异的,所以分的是不同的异质体,原液放行两个方法肯定是都要做的。问题就是在早期细胞株筛选和工艺开发阶段,哪个方法才是又快又准。CIEF(iCE280)一般15分钟一个样,比CEX快多了。如果CIEF测得主峰要低于CEX结果,是不是真的完全可以取代CEX呢?CEX分离出的峰远比CIEF的多!
欢迎大家继续讨论~
因为是考察不同PH对药物的影响,样品又不好改变其PH值,这种情况怎么办?希望有经验的高手指教。
我的流动相是甲醇-水(90:10)
谢谢赐教!
请进子版按格式发贴,自行修改,谢谢。
这就是说不用酸碱预处理吗?
Whatman的网站上没有DE52最大耐受压力,请问又经验的战友应该是多少?
Whatman的网站上:
DE32DryMicrogranularDEAECellulose
SimilarperformancecharacteristicsafterprecyclingasDE52.
DE52PreswollenMicrogranularDEAECellulose
ProbablythemostwidelyusedDEAEcelluloseintheworld;usedforbiopolymerswithlowtohighnegativecharges;exhibitsexcellentresolutionwithgoodflowrates.
附件是一本图书(MethodsinMolecularMedicine,)的章节,上面说:
WhatmanDEAE52comesalreadypreswollenandonlyneedstobetransferred
totherunningbuffer50mMTE8.
lAntibodiesUsingIonExchangeChromatography.pdf(87.06k)
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