大肠杆菌细胞的破碎和包涵体的制备实验
实验材料 | 过表达σ32的大肠杆菌细胞株 试剂、试剂盒 | 氯霉素氨苄青霉素异丙基硫代-β-D-半乳糖苷利福平LB培养基SDS样品缓冲液脱氧胆酸钠 仪器、耗材 | OakRidge离心管带刻度的聚丙烯锥形离心管Tissue-TearorTM匀浆器超声破碎器 实验步骤 | 材料与设备 过表达σ32的大肠杆菌细胞株〔BL21(DE3)/pLysS,pLHN16〕 氯霉素 氨苄青霉素 异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG) 利福平 OakRidge离心管(40-ml) 带刻度的聚丙烯锥形离心管(50-ml) Tissue-TearorTM匀浆器(FisherScientific15-338-55) 超声破碎器 试剂 LB培养基 SDS样品缓冲液(2X) 脱氧胆酸钠(DOC)(20%储液) (配方,见"试剂的配制",PP.184~189) 操作程序 原材料的制备 本单元所用的大肠杆菌细胞株〔σ32的过表达质粒为pLHN16,宿主菌为BL21(DE3)/pLysS〕是按Nguyen等(1993)所述方法构建的〔参见Nuvagen公同出版的pETTMSystemManual(Novagen,Inc.1995)中关于pETll表达系统的应用〕。 1)大肠杆菌于37°C摇瓶培养,摇瓶体积为2000-ml,每瓶装500mlLB培养基,在氯霉素(25ug/ml)/氰苄青霉素(100ug/ml)的选择压力下,培养至A550nm达0.9。 2)加IPTG,至终浓度为1mmol/L,诱导T7RNA聚合酶表达。诱导0.5h后,加利福平至终浓度为150ug/ml,以获得最大程度的过表达。 3)加利福平后3.5小时结束培养,4°C、8000r/min离心30min,收集细胞。将毎升培养液所得的细胞沉淀物重悬于30mlLB培养基,再用40-mlOakRidge离心管,4°C、13000r/min离心10min。细胞用干冰速冻,储存于-70°C备用。 注:本单元所用的细胞虽是冻存的,但对于未知的蛋白质,用新鮮细胞制备要安全得多,特别是需要重折叠的话。细胞冻存最好不超过5d(天)。 为监测纯化操作步骤的取样 为监测纯化的进程和效果,有必要在每个纯化阶段对每个组分进行下列操作步骤。 1)测量体积。 注:一个非常便捷的办法是,对所用的各种大小的试管例如:Eppentbrf管、OakRidge离心管等,细心地加H2O并标出各体积所对应的水平线,准备好一套经过标定的管子,以用来快速测量溶液的体积。带刻度的锥形离心管也可方便地用于这一目的。 2)将一份36-ul的样品加入84ulSDS样品缓冲液(2X)中,70~90°C水浴加热2~5min,保存于4°C。 3)留取部分样品(150ul)供蛋白测定和免疫定量(inrnumo-quantitation)用。将上述信息记录在纯化记录表中,并以此编制纯化总结表。必须小心地留存好有代表性的样品。这就是说,应在临取样前将整个组分真正混合均匀。这一点对那些含有沉淀或重悬的不溶物质的组分来说尤为重要。为方便起见,在留取用于SDS凝胶电泳分析和蛋白质定量测定的样品时,可造一张表,列出样品A~J及其有关描述和体积,以及要检査的两种层析柱。在本单元中,还将指导你在不同的纯化阶段进行取样(如各实验中所述),这些样品将用于纯化方案的补充实验,如本单元最后一节所述。 超声破碎细胞 1)取3g大肠杆菌细胞[BL21(DE3)/PLysS,pLHN16〕于室温下解冻。细胞经组织破碎器短暂匀浆后,重悬于20ml缓冲液A(置一40-ml的OakRidge离心管)中。 注:纯化σ32时,缓冲液A中不加还原剂,因σ32不含半胱氨酸残基。通常,所有缓冲液中都要加(0.1~0.5mmol/L二硫苏糖醇,以防蛋白质氧化。 2)用大超声头,设定8个循环和50%的时间间隔,在冰浴中超声90s。 注:BL21DE3细胞携带有表达T7溶菌繭的pLysS。不过,该溶菌酶不能从内側攻击细胞壁,故此基因不是致死的。当细胞冻融时,溶菌醅会接近细胞壁,使细胞裂解。在有些情况下,这足以使细胞破裂,但必须解决好因DNA释出而产生的粘度问题。一种方法是用相当大量的DNA酶I消化,但这可能是昂贵的,并对混合物又加入了一种蛋白质,因而可能引起更多的麻烦(例如,正在纯化DNA结合蛋白的话)。为此,为确保细胞完全玻碎,我们采用了超声处理法。这可在很大程度上切断DNA,使包涵体的沉淀变得较为容易。 3)加DOC,使终浓度为0.2%(即,加约240ul的20%DOC储液)。混匀,静置10min 注:1.0.2%DOC是用来帮助释出少量不溶性蛋白质的,在高浓度(2.0%)下则释出细胞膜的成分(见实验2)。DOC溶解得相当慢,因此,其储液应提前1天配制。2.若只想分离包涵体.不希望对上清中的可溶性蛋白质作进一步的分级分离(如下文的样品B),则可在这一步加DOC至终浓度2%,并略去实验2中所述的第二次DOC洗涤。 4)取第一个样品(样品A),如上所述见p.146)。 包涵体和可溶性提取物的制备 1)为沉淀包涵体,细胞裂解物用小转头(SorvallSS-34或BeckmanJA20),4°C、13000r/min离心10min。 2)轻轻倾出上清(取样品B),冰上保存,供PEI沉淀和免疫亲和层析(IAC)纯化核心RNA聚合酶-P2复合物用(见实验3)。关于包涵体中的过表达的溶解和复性,见实验2。 |
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发布于 : 2018-08-10
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