•PCR反应的成分和作用总体积:一般为25μl~100μl(一)无Mg2buffer:由纯水、kcl、Tris组成。Tris用于调节反应体系pH值,使Taq酶在偏碱性环境中反挥活性。kcl可降低退火温度,但不能超过50mmol/L,否则会抑制DNA聚合酶活性。(二)Mg2:终浓度为1.5~2.0mmol/L,其对应dNTP为200μmol/L,注意Mg2与dNTPs之间的浓度关系,由于dNTP与Taq酶竟争Mg2,当dNTP浓度达到1mmol/L时会抑制Taq酶的活性。Mg2能影响反应的特异性和产率。(三)BSA:一般用乙酰化的BSA,起着减少PCR管对Taq酶的吸附作用,对Taq酶有保护作用。(四)底物(dNTPs):dNTPs具有较强酸性,其储存液用NaOH调pH值至7.0~7.5,一般存储浓度为10mmol/L,各成份以等当量配制,反应终浓度为20~200μmol/L。高浓度可加速反应,但同时增加错误掺入和实验成本;低浓度可提高精确性,而反应速度会降低。(五)Taq酶:能耐95℃高温而不失活,其最适pH值为8.3~8.5,最适温度为75~80℃,一般用72℃。能催化以DNA单链为模板,以碱基互补原则为基础,按5’→3’方向逐个将dNTP分子连接到引物的3’端,合成一条与模板DNA互补的新的DNA子链。无3’→5’的外切酶活性,没有校正功能。某种dNTP或Mg2浓度过高,会增加其错配率。用量一般为0.5~5个单位/100μl。(六)模板:PCR对模板DNA的纯度不要求很高,但应尽量不含有对PCR反应有抑制作用的杂质存在,如蛋白酶、核酸酶、TqaDNA聚合酶抑制剂、能与DNA结合的蛋白质。模板DNA的量不能太高,否则扩增可能不会成功,在此情况下可适当稀释模板。(七)引物:引物浓度一般为0.1~0.5μmol/L,浓度过高会引起错配和非特异扩增,浓度过低则得不到产物或产量过低。引物长度一般15~30个碱基,引物过长或过短都会降低特异性。其3’末端一定要与模板DNA配对,末位碱基最好选用A、C、G(因T错配也能引发链的延伸)。引物GC约占45~55%,碱基应尽量随机分布,避免嘧啶或嘌呤堆积,两引物之间不应有互补链存在,不能与非目的扩增区有同源性。 •PCR反应条件的选择(影响因素)•温度参数:1.变性:模板变性完全与否是PCR成功的关键,一般先于94℃(或95℃)变性3~10min,接着94℃变性30~60s。2.退火:退火温度一般低于引物本身变性温度5℃。引物长度在15~25bp可通过公Tm=(GC)×4℃(AT)×2℃计算退火温度,一般退火温度在40~60℃之间,时间为30~45s。如果(GC)低于50%,退火温度应低于55℃。较高的退火温度可提高反应的特异性。 •PCR扩增仪