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Kapa biosystems/KAPA hgDNA Quantification and QC Kit/KK4960/300 x 20 µL reactions
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Kapa biosystems/KAPA hgDNA Quantification and QC Kit/KK4960/300 x 20 µL reactions
品牌 / 
Kapa
货号 / 
KK4960
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Description:

qPCRMasterMix(Universal)

KAPAhgDNAQuantificationandQCKit

Qualitymatters.

KAPAhgDNAQuantificationandQCKitscontainallthereagentsneededfortheqPCR-basedquantificationandqualityassessmentofhumangenomicDNAsamplespriortoNGSlibraryconstruction.

KitscontainKAPASYBR®FASTqPCRMasterMix,optimizedforhigh-performanceSYBRGreenI-basedqPCR,aswellasapre-dilutedsetofDNAstandardsandprimerpremixestargetingdifferentportionsofahighlyconservedsingle-copyhumanlocus.Absolutequantificationisachievedwiththeprimerpairdefiningtheshortestfragment,whereastheadditionalprimersareusedtoderiveinformationabouttheamountofamplifiabletemplateintheDNAsample.Qualityscores(orQ-ratios)generatedwiththekitmaybeusedtopredicttheoutcomeoflibraryconstruction,ortailorworkflowsforsamplesofvariablequality,particularlyFFPEDNA.

ThemethodiseasytoautomateandcanbeappliedtoanyprocessorworkflowthatrequiresaccuratequantificationofdiluteDNAsamples,orsamplesthatmaycontainahighproportionofDNAthatisrecalcitranttoPCRamplification.

Downloadour KAPAhgDNAQuantificationandQCDataAnalysisTemplate.

ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.

ProductHighlights

Principle of the hgDNA Quantification and QC assay. A single set of DNA standards is used to generate up to three standard curves using three different primer pairs that amplify targets of 41 bp, 129 bp or 305 bp within a conserved, single-copy human locus. The 41 bp assay is used for absolute quantification of DNA samples. For an assessment of DNA quality, standard curves are generated and samples assayed with the 129 bp and/or 305 bp primer premix(es). Since poor DNA quality has a greater impact on the amplification of longer targets, the relative quality of a DNA sample can be inferred by normalizing the concentration obtained using the 129 bp or 305 bp assay against the concentration obtained from the 41 bp assay. This normalization generates a Q-ratio (with a value between 0 and 1) that is indicative of DNA quality, or the amount of amplifiable material in a DNA sample. Data on file.

Obtainconcentrationandqualityinformationwithasingleassay

  • AllowsforaccuratequantificationofdiluteDNAsamples
  • QuantificationwithanadditionalprimerpairprovidesaQ-ratiothatisindicativeofsamplequality
Conversion rates (% input DNA converted to adapter-ligated library) for libraries prepared for targeted re-sequencing on the Illumina platform. Libraries were prepared in duplicate from 80 – 100 ng FFPE DNA of variable quality (orange) or a commercial hgDNA preparation (grey), using the KAPA LTP Library Preparation Kit. FFPE DNA samples were assessed with the KAPA hgDNA Quantification and QC assay prior to Covaris shearing. Q-ratios were as indicated. The amount of fragmented DNA (average size ~180 bp) used for library construction was determined using the Qubit HS dsDNA assay (Life Technologies), whereas adapter-ligated libraries were quantified using the qPCR-based KAPA Library Quantification Kit. Results indicated that conversion rates for FFPE samples were significantly lower than for high-quality DNA. This limits the diversity of FFPE libraries, and necessitates more cycles of library amplification to generate sufficient material for target capture. This results in higher duplication rates and lower target coverage for FFPE libraries. Data on file.

Employqualityscores intheanalysisofNGSlibraryconstructionworkflows

  • Q-ratioscanprovidevaluableinsightsintothebottlenecksinNGSlibraryconstructionworkflows
  • ForFFPEsamples,libraryandsequencequalityisprimarilylimitedbyinefficientconversionofinputDNAtoadapter-ligatedlibrary

Obtainactionabledataforsamplepreparation

  • Q-ratioscorrelatewithkeysequencingmetricssuchasduplicationratesandmeantargetcoverage
  • FFPEsampleswithaQscore>0.4yieldlibrariesofacceptablequalitywhenprocessedinstandardsamplepreparationsfortargetcapture

Applications:

Applications
  • FFPEsamples
  • Free-circulatingDNAfromplasmaorserum
  • Samplesobtainedbylaser-capturemicrodissectionoffresh,frozenorFFPEtissue
  • Forensicsamples
  • Cellscollectedbyflowcytometry
  • Anyotherlimitingorpreciousclinicalsample

KitSpecificationsandContents/Storage:

KitSpecificationsandContents/Storage

Kitscanbestoredforupto12months at-20˚C.

Complete(MasterMix)kitsincludeKAPASYBRFASTqPCRMasterMix(2X),PrimerPremix(41bp,129bpand305bp,10X)andasetof5DNAStandards.PrimerPremixesandDNAStandardsarealsosoldseparately.

Components

Specifications

Spec
Description
CompatIBLePlatform
AllNGSplatforms
CompatibleSamples
HumangenomicDNA
Samplesources
FFPEtissueCellscollectedbylaser-capturemicrodissectionFlow-sortedcellsFree-circulatingDNAfromplasmaorserumForensicsamplesClinicalsamples
Standardcurveconcentrationrange
2.5ng/µL–10pg/µLor3,080–12copies
SequencingApplications
WholeGenomeSequencingWholeExomeSequencingTargetedSequencing(custompanels)AmpliconSequencing
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公司介绍
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V3.1用于大部分应用 De novo测序 : De Novo 测序也叫从头测序,不需要任何基因序列信息即可对某个物种进行测序。用生物信息学的分析方法对序列进行拼接、组装,从而获得该物种的基因 查看更多>
上海云序生物科技有限公司在发布的目标序列靶向测序供应信息,浏览与目标序列靶向测序相关的产品或在搜索更多与目标序列靶向测序相关的内容。 查看更多>
2021-09-09
红荣微再(上海)生物工程技术有限公司在发布的Illumina 基因测序试剂盒,Miniseq Kit,FC-420供应信息,浏览与Illumina 基因测序试剂盒,Miniseq Kit,FC-420相关的产品或在搜索更多与Illumina 基因测序试剂盒,Miniseq Kit,FC-420相关的内容。 查看更多>
Preparation of Yeast Protein Extracts (see Clontech YPH, p12) Cracking buffer stock solution (see p54 Clontech YPH) 8M Urea; 5% w/v SDS; 40mM Tris-HCl pH6.8; 0 查看更多>
2021-08-24
全球最知名的十大测序公司 查看更多>
Yeast Protein Isolation "Yaffe-Schatz"David AmbergAdapted from Yaffe, M.P. and Schatz, G., PNAS, 1984, 81, 4819-4823.Grow 25mls yeast cells to 5x10E6. Sequenti 查看更多>
Yeast Miniprepfrom Robzyk and Kassir, Nucleic Acid Res. (1992) 20:3790Materials:• 10 ml overnight culture yeast in drop out media (must be very dense) 查看更多>
默瑞(上海)生物科技有限公司,Leica显微系统,Merk Millipore实验室纯水超纯水仪,Roche实时定量PCR仪,Partec流式细胞仪,RPA,TwistDx 代理商,Echelon代理商,Jackson代理商,KAPA,enzymatics经销商等,莫纳生物集团企业。 查看更多>
微液滴数字PCR在靶向测序建库中的应用 查看更多>
提供商:Acebiox 查看更多>
北京亘辰科技有限公司在发布的ChIP-Seq 测序试剂盒 供应信息,浏览与ChIP-Seq 测序试剂盒 相关的产品或在搜索更多与ChIP-Seq 测序试剂盒 相关的内容。 查看更多>
High Efficency Yeast Plasmid Rescue(by Trey Powers, Fields Lab) Grow yeast overnight.Spin down 1.5 ml of culture in microfuge tubes.DecantAdd 250 µl of Q 查看更多>
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肺癌患者,想做一下基因检测,好知道用什么靶向治疗药物。另求告知一稳妥可信检测机构。谢谢
你用来干嘛都不讲,怎么给你推荐试剂盒?

亲子鉴定?

ID,promega.我们实验室主要用的是这两种,由于怕有突变还会备有凯杰的。

如果测序的话,那么就是AB的bigdye吧?

有什么问题我们可以交流。
不可以,测序用的酶和Taq酶是有区别的。
基于靶向药指征的肿瘤基因检测、二代和三代基因测序的应用。
求助做蓝白斑筛选后小提质粒用于测序试剂盒
核酸纯化 一氪就够
三博基因检测技术成熟,仪器准确
三博基因检测方法是一代Sanger测序法。公司暂未开展芯片业务。Sanger测序法准确度大大高于芯片和二代测序。三博基因所用仪器是法医和亲子鉴定专用仪器。Sanger测序法是目前基因检测的国际金标准,检测准确率高达99.9999%。三博基因拥有美国ABI公司的最新3730型全自动遗传分析仪,是经过国际和国家认证的仪器,可重复性达到100%。
Sanger测序法优点是准确,不会出现假阳性假阴性,而且可进行个性化基因检测,是疾病确诊和大夫用药的唯一指定方法。

三博基因检测的实力雄厚,基因检测集科研、生产、销售、实验、报告一条龙服务
北京三博远志生物技术有限责任公司,2000年成立,是北京市中关村高新技术企业。公司实体部门有五个:DNA合成部、DNA测序部、基因体检部、基因工程课题服务部、分子生物学试剂盒生产部。北京三博远志是国内基因合成、测序知名企业,16年科研服务为国内基因研究作出了巨大贡献。
多年为医院临床大夫提供癌症疾病诊断和临床治疗用药指导服务,为科研单位新药研发提供服务等。做基因体检我们有更多的发言权。

Sanger测序法不仅准确,而且适合小套餐检测
二代测序和芯片适合多基因、多位点、高通量、大数据的检测,新一代测序除了准确度不够以外,样品数量小数据量少价格也不具备优势,Sanger测序不仅准确,小规模测序Sanger测序有价格优势。我公司研发的基因检测服务,在全球科学家研究的基础上,我们选择热点靠谱的基因,精确定位,靶向精准测序,是我们多年协同医院及科研单位反复验证总结出来的,已经相当成熟、完善。我们的检测结果最大特点就是,与实际情况非常吻合,经得起实践和时间的考验,有非常好的健康管理价值和临床意义。
Sanger测序是指定目标的靶向检测没有臃冗的检测所以有价格优势,我们能够提供准确、实用、物美价廉的服务,小套餐和个性化靶向基因检测服务我们相当成熟、完善。

有用的、可信的、真实可见的检测,详实的有数据支撑的报告,具体的医疗保健指导建议
三博基因只做癌症、心脑血管、遗传病、代谢、儿童天赋、用药指导、疾病诊断等有用的,研究透彻的基因检测。多年科研和临床检测积累值得信赖,不炒作基因概念,很实在。
三博基因不使用芯片检测,杜绝假阳性、假阴性,检测报告真实可见(附带:基因检测峰图),
详实的《人体基因检测健康管理说明书》,健康管理很实用。
三博基因开展的基因检测位点是经过科学家和临床医生2万个以上验证案例作为数据支撑,主效的,而且也是经过我公司几年上万个临床案例验证,经过多次筛选得出的,很靠谱。

检测速度快
7-10个工作日可以完成基因检测项目。由于是单独检测所以不需要凑板等时间,即使只有几个样本,也可以随时检测。
检测报告制作完成后可以发送到指定邮箱或者网站在线查阅。
在2个工作日内安排专家进行一对一的电话解读或者来我公司现场讲解。

周到的服务、完善的客服平台和培训体系
公司具有完善的客户服务系统,不论是电话、QQ、QQ群、微信、网站留言、还是邮箱咨询,均有专业的人员予以第一时间解答和支持。对于顾客投诉,均在1小时之内给予回复解决。
我公司可以配合合作单位的业务需求,定期的对内部人员进行基因检测服务专业培训以及面对大众的基因检测讲座服务。
DNA提取试剂盒是根据氯化芐法构建的,能够从样本中提取基因组DNA的试剂盒。氯化苄具有能将含有纤维素等的细胞壁中的羟基苄基化,从而破坏细胞壁的特性。本制品利用了氯化苄的这一特性,将植物样品冻结融解后,再使用Pipet Tip的尖端将植物样品在Microtube壁上数次按压即可破坏细胞壁。本法与传统方法相比,省去了液氮研磨等烦琐步骤,有利于一次性处理大量样品。而且,本制品经过了改良,热处理时间只需15分钟,使用本制品从实验开始至水相回收只需30分钟时间。得到的基因组DNA可以进行PCR扩增及限制酶处理等。
各位师兄师姐,可否介绍一下国内做基因测序和分析的哪些学校和老师比较牛。还有想问一下基因测序结束后需要和可以做哪些工作。哪些公司试剂盒比较好用…………
试剂盒提DNA的原理123
孙叔▲豆司312021-07-24
碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其原理为:染色体DNA比质粒DNA分子大得多,且染色体DNA为线状分子,而质粒DNA为共价闭合环状分子;当用碱处理DNA溶液时,线状染色体DNA容易发生变性,共价闭环的质粒DNA在回到中性时即恢复其天然构象;变性染色体DNA片段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,而复性的超螺旋质粒DNA分子则以溶解状态存在液相中,离心去除沉淀后,就可从上清中回收质粒DNA。
目前,市面上质粒提取试剂盒大多数都是采取上述的碱裂解方法,不同之处在于纯化方式。目前比较常用的纯化系统是硅基质吸附材料,其原理为在高盐环境下质粒DNA能够结合到硅基质上,然后用低盐缓冲液或水将质粒DNA从硅基质上洗脱下来。得到的质粒可以用于酶切、PCR、测序、细菌转化、转染等分子生物学实验。
接下来的实验需要用石蜡切片组织提取DNA用于测序判断基因突变,请问各位经验人士是否可行?
先谢了
1.bigdye测序反应试剂盒 主要试剂是bigdye mix,内含pe专利四色荧光标记的ddntp和普通dntp,amplitaq dna polymerase fs,反应缓冲液等。
2.pgem-3zf (+) 双链dna对照模板 0.2g/l,试剂盒配套试剂。
3.m13(-21)引物 tgtaaaacgacggccagt,3.2μmol/l,即3.2pmol/μl,试剂盒配套试剂。
4.dna测序模板 可以是pcr产物、单链dna和质粒dna等。模板浓度应调整在pcr反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒dna,浓度为0.2g/l,即200ng/μl。
5.引物 需根据所要测定的dna片段设计正向或反向引物,配制成3.2μmol/l,即3.2pmol/μl。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物,如m13(-21)引物,t7引物等。
6.灭菌去离子水或三蒸水。
7.0.2ml或和0.5ml的pcr管 盖体分离,pe公司产品。
8.3mol/l 醋酸钠(ph5.2) 称取40.8g naac·3h2o溶于70ml蒸馏水中,冰醋酸调ph至5.2,定容至100ml,高压灭菌后分装。
9.70%乙醇和无水乙醇。
10.naac/乙醇混合液 取37.5ml无水乙醇和2.5ml 3mol/l naac混匀,室温可保存1年。
11.pop 6测序胶 abi产品。
12.模板抑制试剂(tsr) abi产品。
13.10×电泳缓冲液 abi产品。
14.abi prism 310型全自动dna测序仪。
15.2400型或9600型pcr仪。
16.台式冷冻高速离心机。
17.台式高速离心机或袖珍离心机。向左转|向右转