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MCLAB/RCA DNA Amplification Kit/PPK-200/1 Ea
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MCLAB/RCA DNA Amplification Kit/PPK-200/1 Ea
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RCADNAamplificationkitsarenovelproductsdevelopedspecificallytopreparetemplatesforDNAsequencing.TheRCAmethodutilizesbacteriophagephi29DNApolymerasetoexponentiallyamplifysingle-ordouble-strandedcircularDNAtemplatesbyrollingcircleamplification(RCA).ThisisothermalamplificationmethodproducesmicrogramquantitiesofDNAfrompicogramamountsofstartingmaterialinafewhours.

Description:
RCADNAamplificationkitsarenovelproductsdevelopedspecificallytopreparetemplatesforDNAsequencing.AsillustratedinFigure1,theRCAmethodutilizesbacteriophagephi29DNApolymerasetoexponentiallyamplifysingle-ordouble-strandedcircularDNAtemplatesbyrollingcircleamplification(RCA)(1,2).ThisisothermalamplificationmethodproducesmicrogramquantitiesofDNAfrompicogramamountsofstartingmaterialinafewhours.

AmplificationinvitroofverysmallamountsoftemplateDNAeliminatestheneedforovernightcellcultureandconventionalplasmidorM13DNApurification.TheproofreADIngactivityofphi29DNApolymeraseensureshighfidelityDNAreplication.(3)

Thestartingmaterialforamplificationcanbeasmallamountofbacterialcellscontainingaplasmid,anisolatedplasmid,intactM13phage,oranycircularDNAsample.BacterialcoloniescanbepickedfromagarplatesandaddeddirectlytotheRCAreaction.Alternatively,microliterquantitiesofasaturatedbacterialcultureoraglycerolstockcanserveasstartingmaterial.Dependingonthesourceofstartingmaterial,amplificationiscompletedin4–18hoursat30˚Cwithnoneedforthermalcycling.TheproductoftheRCAreactionishighmolecularweight,double-strandedconcatemersofthecirculartemplate.

NotethatwhenstartingwithM13clones,theRCAproductisdouble-strandedDNAandcanbesequencedwithforwardandreverseprimers.DNAamplifiedbytheRCAmethodcanbeuseddirectlyincyclesequencingreactionswithoutanypurification.

Figure:
MCRCA DNA Amplification Kit figure 1.png
Figure1,SchematicdiagramoftheRCAprocess.RandomhexamerprimersannealtothecirculartemplateDNAatmultiplesites.Phi29DNApolymeraseextendseachoftheseprimers.WhentheDNApolymerasereachesadownstreamextendedprimer,stranddisplacementsynthesisoccurs.Thedisplacedstrandisrenderedsingle-strandedandavailabletobeprimedbymorehexamerprimer.Theprocesscontinues,resultinginexponential,isothermalamplification.

MCRCA DNA Amplification Kit figure 2.png
Figure2.
 

Components:

RCADNAAmplificationKit(100reactions)
Cat#:PPK-100
Phi29DNAPolymerase,20µl,(10,000units/ml)
2xMCRCAmix,1ml
CellLysisBuffer,1ml

RCADNAAmplificationKit(500reactions)
Cat#:PPK-200
Phi29DNAPolymerase,100µl,(10,000units/ml)
2xMCRCAmix,5ml
CellLysisBuffer,5ml

References:
1.Dean,F.etal.,GenomeResearch11,1095–1099(2001).
2.Lizardi,P.etal.,Nat.Genet.19,225–232(1998).
3.Estaban,J.A.etal.,J.Biol.Chem.268,2719–2726(1993).

 

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Steve HahnLast modified Fri, Oct 16, 1998Before trying this method, try rapid protein prep which involves boiling yeast in SDS PAGE buffer1. Grow 100 ml yeast 查看更多>
靶向新一代测序Panel可研究不同样品中的多个基因靶点的多种变异类型,从而帮助研究者深入了解各种人类遗传疾病。然而,找出所有致病相关基因,开发出稳定高效的用于多重靶标检 查看更多>
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默瑞(上海)生物科技有限公司,Leica显微系统,Merk Millipore实验室纯水超纯水仪,Roche实时定量PCR仪,Partec流式细胞仪,RPA,TwistDx 代理商,Echelon代理商,Jackson代理商,KAPA,enzymatics经销商等,莫纳生物集团企业。 查看更多>
2021-09-09
红荣微再(上海)生物工程技术有限公司在发布的Illumina 基因测序试剂盒,Miniseq Kit,FC-420供应信息,浏览与Illumina 基因测序试剂盒,Miniseq Kit,FC-420相关的产品或在搜索更多与Illumina 基因测序试剂盒,Miniseq Kit,FC-420相关的内容。 查看更多>
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医学僧jiangjiang的丁香客123
猪八戒他二姨2021-07-23

数据分析的小白一枚,最近开始学习二代测序仪IONTORRENT出来的靶向基因检测位点的数据分析。由于完全没有涉猎过这个领域,会有很多不懂得地方,望大神们不吝赐教!

比如上面这个搜索结果,就是根据一起出来的数据,也就是一个位点的rs号进行检索出来的界面,但是完全不知道如何下手,也不是很清楚具体模块的作用,我能得到什么结果。虽然在网上能看到一些说明,但是仍然一知半解的!

最后,还是想说,大神们快快带我入门吧,非常迫切!跪谢!

1.bigdye测序反应试剂盒 主要试剂是bigdye mix,内含pe专利四色荧光标记的ddntp和普通dntp,amplitaq dna polymerase fs,反应缓冲液等。
2.pgem-3zf (+) 双链dna对照模板 0.2g/l,试剂盒配套试剂。
3.m13(-21)引物 tgtaaaacgacggccagt,3.2μmol/l,即3.2pmol/μl,试剂盒配套试剂。
4.dna测序模板 可以是pcr产物、单链dna和质粒dna等。模板浓度应调整在pcr反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒dna,浓度为0.2g/l,即200ng/μl。
5.引物 需根据所要测定的dna片段设计正向或反向引物,配制成3.2μmol/l,即3.2pmol/μl。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物,如m13(-21)引物,t7引物等。
6.灭菌去离子水或三蒸水。
7.0.2ml或和0.5ml的pcr管 盖体分离,pe公司产品。
8.3mol/l 醋酸钠(ph5.2) 称取40.8g naac·3h2o溶于70ml蒸馏水中,冰醋酸调ph至5.2,定容至100ml,高压灭菌后分装。
9.70%乙醇和无水乙醇。
10.naac/乙醇混合液 取37.5ml无水乙醇和2.5ml 3mol/l naac混匀,室温可保存1年。
11.pop 6测序胶 abi产品。
12.模板抑制试剂(tsr) abi产品。
13.10×电泳缓冲液 abi产品。
14.abi prism 310型全自动dna测序仪。
15.2400型或9600型pcr仪。
16.台式冷冻高速离心机。
17.台式高速离心机或袖珍离心机。向左转|向右转
肺癌靶向药基因测序需要多长时间
试剂盒提DNA的原理123
孙叔▲豆司312021-07-24
碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其原理为:染色体DNA比质粒DNA分子大得多,且染色体DNA为线状分子,而质粒DNA为共价闭合环状分子;当用碱处理DNA溶液时,线状染色体DNA容易发生变性,共价闭环的质粒DNA在回到中性时即恢复其天然构象;变性染色体DNA片段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,而复性的超螺旋质粒DNA分子则以溶解状态存在液相中,离心去除沉淀后,就可从上清中回收质粒DNA。
目前,市面上质粒提取试剂盒大多数都是采取上述的碱裂解方法,不同之处在于纯化方式。目前比较常用的纯化系统是硅基质吸附材料,其原理为在高盐环境下质粒DNA能够结合到硅基质上,然后用低盐缓冲液或水将质粒DNA从硅基质上洗脱下来。得到的质粒可以用于酶切、PCR、测序、细菌转化、转染等分子生物学实验。

时间:2016-7-1518:51  来源:测序中国

新药研发是场艰难、昂贵的持久战。以美国的流程为例,3-6年的时间从约5,000-10,000个化合物中海选出250个选手进入临床前研究:基于细胞水平的体外实验检测化合物的毒性、致癌性和致突变的作用,经过筛选的化合物化学改性,以提高靶向特异性、效力、化学和代谢稳定性、水溶性等药理学参数;此外,先导化合物还需在实验室内开展动物实验,对化合物在动物体内的吸收、分布、代谢和排泄进行药代动力学试验。层层筛选后,需获得监管机构的新药临床研究申请批复方可开展人体试验。

通常会有5个种子选手进入临床研究,在20-100名不等的健康志愿者和患者小样本人群中确定最大耐受剂量、药代动力学和药效学的1期,约50-60%的试验药物可进入100-500人的2期研究。接下来,约30-35%的试验药物进入1,000-5,000的大规模3期证明疗效。顺利的话,整个临床研究将耗时6-7年。临床研究完成之后需将相关数据材料交给政府部门予以审核,最终只有1个幸运儿跨过独木桥获得国家级别的批准,进入规模生产。

利用BRCA1或BRCA2作为靶点的研究也毫无疑问地经历了上述过程。FarmerH等在05年使用BRCA1或BRCA2缺陷的胚胎干细胞研究细胞的生存情况,首次证实BRCA1或BRCA2功能异常的胚胎干细胞对PARP酶抑制剂非常敏感,导致染色体不稳定、细胞周期停滞和凋亡;证实BRCA和PARP两条不同的通路合作修复DNA损伤。这意味着靶向抑制特定的DNA修复通路可能可以设计特定的肿瘤治疗靶点。同年,BryantHE等利用PARP1-/-小鼠和BRCA2缺陷的细胞株,得出与FarmerH类似的结论,一个新概念的肿瘤治疗方案由此产生。

08年,EversB等首次在BRCA2缺陷的小鼠乳腺肿瘤细胞系评估AZD2281、顺铂单药以及联合使用的协同效果,发现无论AZD2281单药还是两种药物的组合,对BRCA2缺陷型细胞显示出增效的细胞毒性。

正是在这些强烈的临床前证据下,利用DNA修复的合成致死机制,第一款靶向药物AZD2281启动了一系列临床研究,逐步夯实了奥拉帕利作为卵巢癌领域第一个口服靶向药的基石地位。

奥拉帕利临床研究一览表

多篇高影响因子文献反复验证了奥拉帕利作为第一个使用合成致死机制的口服靶向药,逐步摸索锁定有效人群、最佳治疗阶段、用药方式。2014年12月奥拉帕利迎来美国适应症,紧接着2015年2月获得欧盟适应症,亚洲地区澳门2015年9月获批。

美国适应症:奥拉帕利可单药治疗携带致病或疑似致病的胚系BRCA突变(根据FDA批准的检测方法)、经三线或更多化疗的晚期卵巢癌患者。

欧盟/澳门适应症:对含铂化疗敏感(完全缓解或部分缓解),铂敏感复发、BRCA突变的(胚系和/或体细胞)高级别上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌的成年患者,奥拉帕利可作为其维持治疗阶段的单药治疗。

其它PARP抑制剂的研发进度在今年也不断刷屏,希望为癌症患者带来新曙光。

时间:2016-7-1518:51  来源:测序中国

不可以,测序用的酶和Taq酶是有区别的。
基于靶向药指征的肿瘤基因检测、二代和三代基因测序的应用。
你用来干嘛都不讲,怎么给你推荐试剂盒?

亲子鉴定?

ID,promega.我们实验室主要用的是这两种,由于怕有突变还会备有凯杰的。

如果测序的话,那么就是AB的bigdye吧?

有什么问题我们可以交流。
核酸纯化 一氪就够
各位师兄师姐,可否介绍一下国内做基因测序和分析的哪些学校和老师比较牛。还有想问一下基因测序结束后需要和可以做哪些工作。哪些公司试剂盒比较好用…………
接下来的实验需要用石蜡切片组织提取DNA用于测序判断基因突变,请问各位经验人士是否可行?
先谢了
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