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用酸性酚硫氰酸胍氯仿提取法纯化组织和细胞中的 RNA
来自 : 蚂蚁淘
实验方法原理在提取过程的第一阶段细胞的RNA酶应尽快灭活。一旦内源的RNA酶被破坏,RNA受损的可能就大大降低,而纯化的过程就可以按合适的速度进行。
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、材料

1.溶液与缓冲液

氯仿:异戊醇(49:1,V/V)

乙醇

异丙醇

液氮

苯酚

磷酸缓冲盐溶液PBS(仅供悬浮细胞和单层细胞用)

乙酸钠(2mol/L,pH4.0)

溶液D(变性液)



去离子甲酰胺(可选)

细胞和组织

2.离心与转子

SorvallSS-34(或与之相当的转子);SorvallH1000(或与之相当的转子)

3.专用设备

测260nm吸光率的比色杯

组织匀浆器

用DEPC水处理过、预冷的研棒和研钵

聚丙烯管

65℃水浴

二、方法

1.选取从组织或细胞中提取RNA的适宜方法

(1)组织

①分离组织并立即置于液氮中。

②将约100mg冰冻组织含液氮的研钵中,用研棒研磨。研磨过程中可加入液氮使组织保持冰冻状态。

③将组织碎末移入含3ml溶液D的管中。

④用搅拌子室温下搅拌组织15~30s。

(2)哺乳动物悬浮细胞

①室温下200~1900g离心5~10min(1000~3000r/min用SorvallRT600,H1000转子)收获细胞。

②吸出培养基将细胞重悬于1~2ml冰预冷的PBS中。

③离心收获细胞,彻底吸尽PBS,每106细胞加2ml溶液D。

④用搅拌子室温下搅拌细胞15~30s。

(3)哺乳动物单层培养细胞

①吸出培养基用5~10ml冰冷的PBS洗细胞一次。

②吸出PBS加入溶液D覆盖细胞,90mm培养皿加2ml(60mm培养皿加1ml)。

③将细胞溶解物移至管中。

④用搅拌子室温下搅拌溶解细胞15~30s。

2.将混合物移至一管中,在每毫升溶液D中立即加入0.1ml2mol/L的醋酸钠(pH4.0),1ml酚,0.2ml氯仿-异戊醇。加入每种组分后,盖上管盖,倒置混匀。

3.将匀浆剧烈振荡10s。冰浴15min使核蛋白质复合体彻底裂解。

4.10000g(9000r/min用SorvallSS-34转子)4℃离心20min,将上层含RNA的水相移入一新管中。

5.加入与提取的RNA等量的异丙醇。充分混合液体,并在-20℃沉淀RNA1h或更长时间。

6.10000g(9000r/min用SorvallSS-34转子)4℃离心30min,收集沉淀的RNA。

7.轻轻倒出异丙醇加入溶液D溶解RNA颗粒,每1ml第一步所使用的溶液加0.3ml溶液D。

8.将溶液移至一微量离心管,涡旋混匀,并在-20℃用等量异丙醇沉淀RNA1h或更长时间。

9.在微量离心机上,于4℃最大速离心10min收集RNA沉淀。用75%的乙醇洗涤沉淀2次,重复离心。用一次性使用的吸头吸出残存的乙醇。将打开盖的离心管在实验台放置几分钟,以便乙醇蒸发。RNA不可完全干燥。

10.加50~100μlDEPC处理过的水。将RNA溶液贮存于-70℃。

11.估计RNA的浓度。


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