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根据大小分离RNA:乙二醛化RNA的琼脂糖凝胶电泳
来自 : 蚂蚁淘
实验方法原理这个方法将乙二醛变性和琼脂糖凝胶电泳结合了起来(从McMaster和Carmichael(1977),Thomas(1983)的方法修改而来)。RNA的自动乙二醛化、溴化乙锭染色及电泳缓冲液的修改由Burnett(1977)提供。
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、材料

1.缓冲液和溶液

10XBFTE电泳缓冲液

DMSO

乙二醇

乙二醇反应混合物

RNA凝胶上样缓冲液

2.凝胶

琼脂糖凝胶

3.核酸和寡核苷

RNA样品

RNA大小标准参照物

4.专用装置

水平电泳装置

透明尺

预置到55℃的水浴

二、方法

1.配制乙二醛变性反应液。在无菌离心管中混合:

RNA(总共10μg)1~2μl,乙二醇反应缓冲液10μl。

2.盖上离心管的盖子,将RNA溶液在55℃放置60min,在冰水中冰浴10min,然后离心5s,使所有液体沉到离心管底部。

3.在样品加热过程中,将琼脂糖凝胶装到水平电泳仪的盒子中。加入足够的1XBPTE电泳缓冲液,使其没过凝胶约1mmol/L。

4.将1~2μlRNA上样缓冲液加到乙二醛化的RNA样品中,然后马上把RNA样品加到凝胶加样孔中,留着两边最外面的两个孔不要加样。将RNA相对分子质标准参照物加到最外面的孔中。

5.以5V/cm的电压进行电泳,直到溴酚蓝迁移大约8cm。

6.将凝胶放在保鲜膜上,在紫外灯下观察RNA。把透明尺和凝胶对齐,在紫外灯下拍照。

7.在照片上量出从加样孔到各RNA条带的距离。以RNA片断大小的对数(log10)值对迁移的距离作图。用得到的曲线计算点杂交检测到的RNA的大小。

8.用上行或下行毛细管转移法把RNA固定在固体支持物上。

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