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六大类化学修饰：甲基化；去氨基化，硫代（S代替碱基的O分子），碱基的同分异构化（尿嘧啶变构生成假尿嘧啶）；二价键的饱和化；核苷酸的替代（用不常见的核苷酸替换常见的核苷酸）核酶核酶（ribozyme）是指一类具有催化功能的RNA分子，通过催化靶位点RNA链中磷酸二酯键的断裂，特异性地剪切底物RNA分子，从而阻断基因的表达.核酶的催化功能与其空间结构有密切关系，目前已知有多种特殊结构的核酶：RNaseP的RNA碱基（M1 RNA）、锤头型、发夹型丁型肝炎病毒RNA、1类内含子和2类内含子，大多有hammerhead structure。不同的核酶可分为两类：1 剪切型核酶：只剪不接，如M1 RNA2 剪接型核酶：该酶具有序列特异的内切核酸酶、RNA连接酶等多种酶活性，如1类和2类内含子向左转|向右转
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