6.染色的选择 OO.WesternBlot哪种染色好?解答:(1)阴离子染料是最常用的,特别是氨基黑,脱色快,背景低检测极限可达到1.5μg,考马虽然与氨基黑有相同的灵敏度,但脱色慢,背景高。丽春红S和快绿在检测后容易从蛋白质中除去,以便进行随后的氨基酸分析。缺点是:溶剂系统的甲醇会引起硝化纤维素膜的皱缩或破坏。不能用语正电贺的膜。灵敏度低。(2)胶体金,灵敏度高,检测范围可到pg级,但染色比稳定。(3)生物素化灵敏度位于1、2之间,可用于任何一种膜。 7.参照的疑问 PP.是否WesternBlot实验半定量一定要加ACTIN内参?解答:对于发表文章的实验最好加内参,实验严谨。 QQ.用BANDSCAN分析结果行吗?解答:分析一般的结果没问题。 RR.核内抗原WesternBlot内参选择什么合适?解答:可以选用组蛋白,组蛋白在细胞核中的表达是很稳定的,有很多都可以当成内参,在网上查查就可以选出你要的内参。 SS.转膜时采用电流是否比电压准确,是否根据0.8mA/cm2,一般1小时左右?解答:不是的,半干法推荐用恒流,一般根据目的蛋白的大小来确定电流和时间。 TT.做半定量人卵巢癌细胞系的WesternBlot,内参B-actin,GAPDH,那个好?解答:选用beta-actin就可以。 UU.转膜后的脱脂奶粉封闭时,所用的防沫剂A是什么?还有Tris-HCl是不是就是用Tris和盐酸配出来的呢?解答:转膜后的脱脂奶粉封闭液是5%的TBST脱脂奶粉。Tris-HCl就是Tris盐用HCl调ph值,配置而成。 VV.准备做大鼠脑子的WesternBlot,蛋白质位于细胞核中,请问此蛋白质的提取液及操作方法是?每一步都必须要低温吗?这种蛋白质是磷酸化的蛋白质,操作时如何防止去磷酸化的发生?解答:可以用提取总蛋白的buffer提核蛋白,可以加NaF防止去磷酸化。 WW.想问一下细胞裂解液选择蛋白酶抑制剂时有什么原则吗?受不受组织来源的影响?胞膜和胞浆有区别吗?解答:一般来说提取时加入光谱的蛋白酶抑制剂就可以了,操作时保持低温。除非有文献特别指明用特殊的方法,一般来说都没有区别。 XX.最近作了两次WesternBlot,不但没阳性结果,显色背景都没有,电泳和转膜都染过,有条带。底片和显色液及DAB显色液均试过,没问题。1、检测GAD--分子量67kd,提取液有蔗糖,其余同三去污裂解液。蔗糖不会有影响把?样本--20度放置一周内测。2、一抗放置2年,可能效价不高!用的是1:100。如果是一抗的原因,不会背景都没有把?3、第一次有不均匀背景,因为一抗过夜时密封袋不均匀。后两次无背景显色。4、封闭液用的是含15%脱脂奶粉TBST,漂洗液用的是含1%BSA的TBST液,TWEEN-20为0.1%,不会是封闭液的问题吧?解答:可以在下面几个问题上找找原因。1.封闭液用5%Milk,漂洗液(washingbuffer用TBST)2.看看一抗是否能work,降到1:20。3.看看二抗是否有问题。 YY.加甲醇的目的是什么?解答:加甲醇起着一定的固定作用,因为小分子蛋白质容易转出去.(特别是在硝酸纤维素膜上,因为NC膜结合蛋白质的能力较弱)。 ZZ.“转膜后的脱脂奶粉封闭液是5%的TBST脱脂奶粉”,其中TBST最后那个T是Tween吗,浓度多大?解答:是Tween,配方如下:Tris-BufferedSalineTween-20(TBST),Dissolve8.8gofNaCl,0.2gofKCl,and3gofTrisbasein800mlofdistilledH2O,Add500ulofTween-20,AdjustthepHto7.4withHCl,AdddistilledH2Oto1L,Sterilizebyautoclaving. AAA.封闭,一抗,二抗时的温度有没有什么规定呢,比如现在我就在室温里做,或者要在4度下?解答:均可在室温进行,如果时间不够,一抗孵育可以先在室温进行一个小时,然后4度过夜。 BBB.实验室暂无NP40我用sds可以吗?另外有过用尿素和硫脲提取膜蛋白吗?配方如下:7M尿素,2M硫脲,Triton-x-1000.2ml,新鲜加入:65mMDTT蛋白酶抑制剂:试剂盒HaltTMProteaseinhibitorcocktailkit1%(v/v)是用于抽提双向电泳用蛋白的配方。不止用于抽提细胞全蛋白(主要是想得到其中的膜蛋白)是否可行?改良的RIPA裂解缓冲液(Tris.HCl,50mmol/L,pH7.5;NaCl,150mmol/L;NP-40,1%;脱氧胆酸钠,0.5%;SDS,0.1%;EDTA,1mmol/L;PMSF,1mmol/L;Leupeptin,2μg/ml)不知对于膜蛋白效果如何?此外该方中的EDTA,是否用做蛋白酶抑制剂?解答:做2-D绝对不推荐使用NP-40(因为即使进口的NP-40也不纯,,其中的杂质会影响质谱结果)。对于动物细胞,其蛋白酶活性较弱(相对于组织和大肠杆菌等),可以不使用cocktail,因为7M尿素+2M硫脲+4%CHAPS构成的变性环境已经足以抑制大部分蛋白酶的活性,2M硫脲+4%CHAPS对于抽提膜蛋白有很大的帮助,不过如果您专职做膜蛋白建议采用分级抽提法。此外还可以采用梯度离心法和一些基于去垢剂的方法。EDTA用于灭活金属蛋白酶(主要是其鏊合作用)。加过多的蛋白酶抑制剂可以导致蛋白质的修饰,做WB无所谓,做MAILDI时会给正确鉴定带来麻烦。裂解缓冲液中少了两性电解质(在2-D裂解缓冲液中,两性电解质起的作用:提供连续的PH梯度,从很大程度上增加蛋白质的溶解性;还可以去除一部分核酸);也不推荐采用SDS,因SDS会与蛋白质结合导致其等电点发生改变,如果您实在要用,终浓度降到0.1%以下。