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逆转录时到底需不需要引物。
2017-08-25
问题描述:

老贺说不要。刘不言说要。这就尴尬了。

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滑小稽的皮卡丘
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做题时候说是要
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明晰1993
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以课本为准啊书上没写应该是不用的
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牛掰掰
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书上写了要
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Xsylaohu
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好复杂的感觉
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沉默十斤
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要。合成的是DNA
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理想的同学
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需要引物。我笔记上写的是病毒tRNA中含有引物,具体原因忘啦。逆转录酶又叫依赖RNA的DNA聚合酶,~~既然是DNA聚合酶,那么生成DNA就得需要引物吧。
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么么哒sir
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生成dna的,需要
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huangzi1127
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seuzsl我没有做过血浆中miR楼主,刚设计遇到麻烦,miR引物序列为:GGUGGCCCGGCCGUGCCUGAGG;由于GC含量太高,无法使Tm值降至60左右,加AT好像要加很多很多,有没有更好的办法?
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指尖的格桑花
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楼主您好:1、谢谢楼主能做设计出这么好的软件来2、新人学习,我不太明白您的反转录特异引物是在某篇文献中找的,还是。。。因为我从别的文献中看到过其他的特异性引物。。3、特异性引物是什么动物都可以用么??还是每种动物都有不同的特异性引物?我做的是小鼠骨骼肌的MIRNA
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老谭
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好东西
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sunnyrain99999
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正需要这样的资料
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猫薄荷9143
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刚需,谢谢!
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绿色的地球
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楼主你好!你这个帖子的茎环序列,我在你其他帖子中也看到了,想必你们实验室用该序列效果是挺好的了。请问你用该茎环做的是什么物种?
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seuzsl
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人,其它物种也可以使用,与物种无关
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jandrea
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好东西,谢谢
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jandrea
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楼主,我想请问下,你的这个茎环序列是怎么确定的呢。你的这个反转录用的内参是哪个,U6吗?GAPDH可以用吗?因为是新手,所以好多问题都不太清楚。
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seuzsl
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jandrea楼主,我想请问下,你的这个茎环序列是怎么确定的呢。你的这个反转录用的内参是哪个,U6吗?GAPDH可以用吗?因为是新手,所以好多问题都不太清楚。序列是文献报道的,当然你也可以自己设计可以用U6。GAPDH是mRNA的内参
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lbcaihong
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谢谢,楼主,内参U6的引物需要怎么设计
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seuzsl
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lbcaihong谢谢,楼主,内参U6的引物需要怎么设计文献中找现成的,无需设计
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maomao0_0
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seuzsl文献中找现成的,无需设计能提供一篇文献吗?O(∩_∩)O谢谢
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seuzsl
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maomao0_0能提供一篇文献吗?O(∩_∩)O谢谢太多了,自己去PubMed找
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绿色的地球
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最近设计引物,用到楼主的小软件,很方便,赞一个!想请教一个问题。由于miRNA序列的特异性,为避免引物二聚体的ΔG过大,茎环尾加长度需要设为9。请问,你有没有使用过这么长的茎环尾加长度?你估计这样设计行得通不?
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seuzsl
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绿色的地球最近设计引物,用到楼主的小软件,很方便,赞一个!想请教一个问题。由于miRNA序列的特异性,为避免引物二聚体的ΔG过大,茎环尾加长度需要设为9。请问,你有没有使用过这么长的茎环尾加长度?你估计这样设计行得通不?一般尾部加8个,9个也可以
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seuzsl
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帖子已被删除1、比如miRNA序列中连续的CCC比较多,那么你就不能再在5‘端增加GGG,而是增加CCC;你增加CG后如果有发卡结构,软件也会提示的2、可以加,只能在5’端加3、主要看TM值,两个引物接近为主但是有时候难以设计出非常理想的引物,即使primer3.0提示引物存在问题,照样可以扩增的
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huangzi1127
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展开引用seuzsl1、比如miRNA序列中连续的CCC比较多,那么你就不能再在5‘端增加GGG,而是增加CCC;你增加CG后如果有发卡结构,软件也会提示的2、可以加,只能在5’端加3、主要看TM值,两个引物接近为主但是有时候难以设计出非常理想的引物,即使primer3.0提示引物存在问题,照样可以扩增的......非常感谢您的回复,神速啊,你的回复很有用,已经摸索一个多月了效果还是不好,有两个目的基因扩增不出来,主要原因可能还是血浆miR浓度太低,不知楼主有没有做过血浆的miR定量,有没有好的指导方法?跪谢~
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seuzsl
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huangzi1127非常感谢您的回复,神速啊,你的回复很有用,已经摸索一个多月了效果还是不好,有两个目的基因扩增不出来,主要原因可能还是血浆miR浓度太低,不知楼主有没有做过血浆的miR定量,有没有好的指导方法?跪谢~我没有做过血浆中miR
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huangzi1127
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seuzsl我没有做过血浆中miR楼主,刚设计遇到麻烦,miR引物序列为:GGUGGCCCGGCCGUGCCUGAGG;由于GC含量太高,无法使Tm值降至60左右,加AT好像要加很多很多,有没有更好的办法?
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huangzi1127
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seuzsl可以好的,多谢,我试试
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yyl蝶恋花
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楼主你好,正在学习你的经验,想请问你的通用下游引物是怎样确定的,看不懂,谢谢啦
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seuzsl
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yyl蝶恋花楼主你好,正在学习你的经验,想请问你的通用下游引物是怎样确定的,看不懂,谢谢啦是设计这个茎环的人设计的
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yyl蝶恋花
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嗯,懂了,可是按这些输入进去出现这种结果是怎么回事呢?谢谢!
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seuzsl
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展开引用yyl蝶恋花嗯,懂了,可是按这些输入进去出现这种结果是怎么回事呢?谢谢!......序列没有输对你把输入的模板序列及引物序列的截图发一个
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seuzsl
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展开引用yyl蝶恋花嗯......茎环序列明显跟我的不同,当然不能用我给出的通用引物
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yyl蝶恋花
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那这个通用下游引物需要怎样设计呢
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seuzsl
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yyl蝶恋花那这个通用下游引物需要怎样设计呢你想多了,茎环序列和通用下游引物直接拿来用就可以,用成熟的序列即可,别自己设计,除非你认为自己很牛掰
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