实验材料 | 质粒DNA玻璃珠 试剂、试剂盒 | YPD消解酶100TTris-HClSDS乙酸钾TE缓冲液RNaseA溶液山梨醇无水异丙醇裂解缓冲液 仪器、耗材 | 三角瓶离心管 实验步骤 | 一、酵母DNA微量制备(40ml)1.在125ml三角瓶中用40mlYPD培养液在30°C条件下培养细胞达最大生长量(过夜)。 2.将上述培养物移入螺盖离心管,用医用离心机或SarvallSS-34转头以5000r/mm离心5min,弃去上清液。 3.将细胞悬浮在3ml的0.9mol/L山梨醇-0.lmol/LNa2EDTA(pH7.5)溶液中。 4.加0.lml的2.5mg/ml消解酶100T,置37°C保温lh。 5.用医用离心机或SorvallSS-34转头以5000r/min离心5min,弃去上清液。 6.将细胞重悬于5ml的50mmol/LTris-HC1(pH7.4)-20mmol/LNa2EDTA溶液中。 7.加0.5ml的10%SDS,混匀。 8.置65°C保温30min。 9.加1.5ml的5mol/L乙酸钾溶液,在冰浴中放置lh。 10.用SorvallSS~34转头以10000r/min离心lOmin。 11.将上清液转移至干净的塑料离心管中,室温下加入两倍体积的95%乙醇,混勻,以5000?6000r/min室温离心15min。 12.弃上清液,将沉淀物干燥,然后悬浮在3mlTE缓冲液(PH7.4)中,此操作可能需要几个小时。 13.用SorvallSS-34转头以10000r/mm离心15min,将上清液转移到一个新试管,弃沉淀物。 14.加入150jul的lmg/irilRNaseA溶液,在37°C下保温30mino 15.加入一倍体积的100%异丙醇,轻轻混匀。取出呈松散纤维状的沉淀物,无需离心,让其自然干燥。 16.将沉淀物悬浮在0.5mlTE缓冲液(pH7.4)中,置4°C保存。酵母DNA的终浓度大约在ZOOjug/ml。如果最后的溶液不澄清,用异丙醇再次沉淀DNA或用SorvallSS-34转头以10000r/min离心15min。 二、酵母DNA微量制备(5ml)1.接种酵母于5mlYPD中,置30°C培养过夜。 2.用医用离心机以2000r/min离心5min沉淀细胞,弃上清液。 3.将细胞悬浮在0.5ml的lmol/L山梨醇-0.lmol/LNa2EDTA(pH7.5)缓冲液中,并转到一支1.5ml离心管中。 4.加入0.02ml的2.5mg/ml的消解酶100T溶液,置37°C保温lh。 5.离心lmin。 6.弃上清液,把细胞用0.5ml的50mmol/LTrls-Ha(pH7.4)-20mmol/LNa2EDTA溶液悬浮。 7.加0.05ml的10%SDS,混匀。 8.置65°C保温混合物30min。 9.加0.2ml的5mol/L乙酸钾,把离心管在冰浴中放置lh。 10.离心5min。 11.将上清液转移到一洁净微型离心管,室温下加入等体积的无水异丙醇,混匀,放置5min。短暂离心(10s)弃上清液,让沉淀自然干燥。 12.用0.3mlTE缓冲液(pH7.4)重新悬浮沉淀。 13.加15ul的lmg/ml的RNaseA溶液,置37°C保温30min(此步可任意选择)。 14.加0.03ml的3mol/L乙酸钠,混匀,用0.2ml的无水异丙醇沉淀,再短暂离心收集DNA。 15.弃上清液,自然干燥,用0.1~0.3mlTE缓冲液(pH7.4)重新悬浮DNA。 16.在使用限制性内切酶酶解DNA之前,有必要将最终溶液离心较长时间(15min)以便除去可能抑制酶解的不溶性物质。 三、10min制备酵母DNA大肠杆菌或酵母转化质粒的制备1.在质粒DNA选择性培养基(如SC-ura)中,置30°C培养少量培养物(至少1.4ml)过夜。 2.将培养物转人一支1.5ml的微型离心管,离心5s,收集细胞。 3.小心倾去上清液,轻弹离心管,使沉淀重新悬浮于残余培养液中。 4.加人0.2ml的2%TritonX-100,1%SDS,100mmol/LNaCl,10mmol/LTris-HCl(pH8),lmmol/LNa2EDTA;加入0.2ml的苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1);加人0.3g酸洗过的玻璃珠。 5.振荡2min。 6.离心5min。 7.用1~5ul含DNA的水相转化0.2ml的大肠杆菌受体菌,用15W水相转化酵母菌。 用于Southern分析的基因组DNA分离1.用YPD培养基,置30°C培养10ml酵母至最大生长量。 2.用医用离心机离心2mm,弃上清液,收集细胞,用0.5ml蒸馏水重新悬浮,将细胞转入1.5ml微型离心管中,离心5s收集细胞。 3.重复第2)步。 4.重复第2)步。 5.加0.2mlTE缓冲液(pH8),振荡3~4min。 6.离心5mm,将水相移至洁净试管,加lml的无水乙醇,上下颠倒,混合均匀。 7.离心2min,弃上清液,悬浮在0.4mlTE缓冲液和3ul的10mg/mlRNaseA溶液,置37°C保温5mm,加入10;ul4mol/L乙酸铵和lml的无水乙醇,上下颠倒,混合均匀。 8.离心2min,弃上清液,自然干燥后,用50ul的TE缓冲液悬浮,每份样品用lOul进行Southern印迹分析,每份用量2~4ugDNA。 四、制备酵母基因组DNA:玻璃珠法1.用5ml培养基(完全培养基或选择性培养基)在30°C下,摇床培养过夜。 2.转移培养物至13mmX100mm的玻璃离心管中,用台式离心机以1500r/min离心5min,收集细胞。 3.用3ml无菌水洗细胞,同上离心。 4.用500ul裂解缓冲液再次悬浮。 5.加入干净的玻璃珠(约1.5ml离心管的2/3体积)和25ul的5mol/LNaa。 6.以最高速振荡lmin。 7.以2000r/min离心2min。 9.加入500ul苯酰,振荡,离心lmin。用P-1000移液器吸取水相(上层),转移至洁净离心管,加入500ulSEVAG(氯仿:异戊醇,24:1),同上振荡,离心,抽提。 10.加人lml预冷的95%乙醇,在-20°C下沉淀lh。 11.以最高转速离心5min沉淀DNA,弃上清液,用70%乙醇清洗,最后悬浮在250ulTE缓冲液中。 12.加的EDTA-Sark和5ul的蛋白酶K(10mg/ml),至37°C保温30min。 13.加250ul5mol/L乙酸铵,重复9)、10)步骤。 14.收集DNA,用70%乙醇洗,悬浮于100ul的TE缓冲液(每个酶解反应使用约10ul)。 |
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