SNaPshot技术是美国应用生物公司(ABI)开发,是一种基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。
中文名
SNaPshot技术
优势
分型准确
别称
小测序
开发公司
美国应用生物公司(ABI)开发
首先,使用引物扩增目标SNPs所在片段,在扩增产物中加入核酸外切酶I(ExoI)和碱性磷酸酶(ShrimpAlkalinePhosphatase,SAP)消化掉反应体系中的引物序列和剩余的dNTPs;然后,以纯化后的扩增产物为模板,使用测序酶、四种荧光标记ddNTP和5′-端紧靠SNP位点的延伸引物进行PCR反应,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。通常用于10~30个SNP位点分析[1]。
1.分型准确;2.通量高:也称小测序;3.检测速度快;4.不受SNP位点多态性特性限制;5.不受样本个数限制;
参考资料
1.赵春霞.一种同时检测多个单核苷酸多态性位点的新方法:分析化学研究报告,2003