二代测序
IonPersonalGenomeMachine®(PGM™)System二代测序
Lifeiontorrent相关应用：
1.DNA&GenomeSequenceAnalysis
2.EpigeneticSequencingAnalysis
3.FragmentAnalysis
4.Genotyping&GenomicProfiling
5.IonSemiconductorSequencing
6.RNA&TranscriptomeSequenceAnalysis特点
1.运行成本经济可行2.序列读长长：平均可达400-500个碱基2.运行快：仪器单次运行数据处理时间短3.准确度高：超过400个碱基的单个序列阅读准确度高于99％4.获得的数据量大：平均可获得10，0000条数据，35Mb数据5.适合样本广泛。基因组DNA、扩增产物、CDNA或BAC等都可。且无需建库。
6.支持的测序方法多样：如鸟枪法（Shotgun）、配对末端（Pair-End）测序及扩增子变异分析
7.可应用的领域广泛
• 环境样品的宏基因组鉴定 • 微生物基因组测序 • 病原体检测 • 人类目标序列重测序 • 扩增子直接克隆测序（PCR产物） • 传染病源快速鉴定 • 转录组研究 • 肿瘤基因组和突变 • DNA甲基化 • 基因表达 • 细菌人工染色体 • 人体基因组结构和突变 • 染色质免疫沉淀 • 考古学
样品类型 | NGS 分析项目 |
全血 | 白血病 |
血浆 | HIV,HCV |
石蜡切片 | 黑色素瘤,肺癌,结肠癌 |
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发布于 ： 2018-11-27
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