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제품특징
□ 형상 동결건조품
□ 보존 -20℃, 실온 수송
□ 서열
□ 제품설명
인산화한 것과 인산화하지 않은 2종류의 자기상보적이지 않은 올리고뉴클레오타이드로 형성된 이중가닥의 어댑터로 EcoR I site 외 내부에 Not I, BamH I site를 갖고 있다. 미리 어닐링한 상태이므로 그대로 멸균수 또는 TE Buffer에 용해하여 사용할 수 있다.
□ 용도
본 adaptor는 내부에 Not I, BamH I 사이트를 갖고 있으므로 EcoR I 이외에 이들 제한효소로도 벡터에 도입시킨 단편을 잘라낼 수 있다. 특히, Not I은 8염기 인식효소로 벡터 DNA나 도입한 DNA 단편중에 이 사이트가 존재할 확률이 매우 낮아, 도입시킨 DNA 단편을 완전한 형태로 잘라낼 수 있는 등 유용성이 높다. 통상의 linker를 사용하여 벡터 속에 DNA 단편을 삽입한 경우 드물게 말단에 이상이 생겨 삽입한 단편을 벡터로 부터 잘라낼 수 없는 경우가 있다. 본 어뎁터를 사용하면 안쪽의 Not I site나 BamH I site를 이용하여 삽입단편을 잘라낼 수 있다.
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1.怎么看两个反应-即目标基因和内参基因是否具有相同的扩增效率?
2.每次PCR反应的扩增情况都有差异,多次反应的扩增效率岂不是都不一样了吗?
3.如何设计才能让相对定量更可行?
由于对定量PCR的接触不多,希望各位高手多多帮助!谢谢!
检测荧光信号的步骤有误:一般SG法采用72℃延伸时采集,Taqman法则一般在退火结束时或延伸结束采集信号。
引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性。
模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起。
模板降解:避免样品制备中杂质的引入及反复冻融的情况。
2.Ct值出现过晚(Ct>38)
扩增效率低:反应条件不够优化。设计更好的引物或探针;改用三步法进行反应;适当降低退火温度;增加镁离子浓度等。
PCR各种反应成分的降解或加样量的不足。
PCR产物太长:一般采用80-150bp的产物长度。
3.标准曲线线性关系不佳
加样存在误差:使得标准品不呈梯度。
标准品出现降解:应避免标准品反复冻融,或重新制备并稀释标准品。
引物或探针不佳:重新设计更好的引物和探针。
模板中存在抑制物,或模板浓度过高
4.负对照有信号
引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。
引物浓度不佳:重庆新桥医院网上预约挂号www.cqxqyy.net适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。
镁离子浓度过高:适当降低镁离子浓度,或选择更合适的mix试剂盒。
模板有基因组的污染:RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。
5.溶解曲线不止一个主峰
引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。
引物浓度不佳:适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。
镁离子浓度过高:适当降低镁离子浓度,或选择更合适的mix试剂盒。
模板有基因组的污染:RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。
6.扩增效率低
反应试剂中部分成分特别是荧光染料降解。
反应条件不够优化:可适当降低退火温度或改为三步扩增法。
反应体系中有PCR反应抑制物:一般是加入模板时所引入,应先把模板适度稀释,再加入反应体系中,减少抑制物的影响。
7.同一试剂在不同仪器上产生不同的曲线,如何判断?
判断标准:扩增效率,灵敏度,特异性
如果扩增效率在90%-110%,都是特异性扩增,都可以把数据用于分析。
8.扩增曲线的异常?比如“S”型曲线?
参比染料设定不正确(MasterMix不加参比染料时,选NONE)
模板的浓度太高或者降解
荧光染料的降解
什么是纯荧光校正,多长时间校正一次:
纯荧光校正是测定各种纯荧光染料标准品的波长和信号强度,通俗地说是让仪器“认识”各种荧光染料。软件收集并储存各种纯荧光染料标准品的荧光信息。以后每次定量实验运行过程中,SDS软件收集样品的原始光谱信号,并将此原始光谱与纯荧光文件中的数据进行比较,精确扣除不同染料的信号重叠部分,从而确定样品中的荧光染料种类和信号强度。
推荐每半年进行一次纯荧光校正。在运行光谱校正之前,请先进行背景校正和ROI校正。
1.熔融温度为75,74,73度的样品是否是同一个产物?熔融温度为56度的是不是没有扩增产物?
2.为什么相同的标准品不同反应CT值差别这么大?是不是荧光染料降解?我用的是试剂盒中的扩增酶,还没用几次。
3.扩增曲线的形态是否说明标准品已经有降解?
4.另外,我原来做CDNA梯度稀释做的挺好,可是这个直接是RNA为标准品,我用一步法进行QRT-PCR。标准品梯度稀释线性效果不稳定,有的时候好,有的时候不好。请假大家有没有好的建议?
附件中有扩增曲线和熔融曲线,请大家帮忙分析,谢过了!
新建MicrosoftOfficeWord文档.docx(46.18k)
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