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直接原位PCR
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实验方法原理原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、组织切片和细胞样品的制备
 
1. 试剂与配置
 
10%福尔马林;二甲苯;PBS。
 
2. 操作方法
 
(1)用10%福尔马林固定组织8~15h,石蜡包埋,切片(4μm),将切片置于新鲜的二甲苯中处理5min,放入无水乙醇中浸泡5min,取出,空气干燥;
 
(2)对于培养细胞,可直接制备爬片,也可有PBS洗细胞一次,加10%福尔马林静置过夜,用橡胶刮下细胞;用PBS洗细胞两次,2000rpm×3min,用5mlPBS重悬细胞,即可用甩片机甩片或直接吸50μl点在载玻片上。
 
二、切片预处理(蛋白酶消化)
 
1. 试剂与配置
 
0.1mol/LTris-HCl(pH7.4)
 
缓冲液A:0.1mol/LTris-HCl(pH7.4),0.3%Tween-20,0.5%NP-40
 
蛋白酶K:20-50μg/ml,溶于TE中
 
2. 操作方法
 
(1)干燥后的切片置于0.1mol/LTris-HCl(pH7.4)中,室温孵育5min;
 
(2)浸入缓冲液A中,室温孵育10min;
 
(3)滴加20μl蛋白酶K液于标本上,在湿盒中37℃孵育20min;
 
(4)在室温下,用0.1mol/LTris-HCl(pH7.4)漂洗两次,每次5min。
 
三、原位扩增(以标记生物素为例)
 
1. 试剂与配置
 
PCR反应缓冲液:两种引物各100pmol,dATP、dCTP、dGTP和dTTP各200μmol,Bio-dUTP50mol,1×PCR缓冲液;
 
Tag酶:5U/μl
 
缓冲液B:0.01mol/LPBS,0.1%Triton-X100
 
指甲油(市售)
 
无水乙醇
 
2. 操作方法
 
(1)切片用1×PCR缓冲液平衡3次,每次5min;
 
(2)用滤纸吸去切片上多余的液体,置60℃,每片加入30μlPCR反应缓冲液,5UTag酶,用盖玻片封片,四周封以指甲油,防止蒸发;
 
(3)94℃变性5min,按下列条件(94℃×2min,55℃×2min,72℃×3min)循环20~25次后,72℃延伸5min;
 
(4)玻片浸入无水乙醇中10min,以软化指甲油;
 
(5)用刀片撬开盖玻片并除去;
 
(6)用缓冲液B漂洗两次,每次3min;
 
(7)用无水乙醇固定5min,并吹干。
 
四、检测(以ABC法为例)
 
1. 试剂与配置
 
缓冲液C:0.1mol/LTris-HCl(pH7.5),0.1mol/LNaCl,2mmol/LMgCl2,0.5%Triton-X100
 
封闭液:3%BSA(溶于缓冲液C中)
 
显色液:0.05%DAB,溶于0.05mol/LTris-HCl(pH7.4),临用前每10ml加30%过氧化氢50μl。
 
1%盐酸酒精液
 
苏木素染色液
 
2. 操作方法
 
(1)用30μl3%BSA滴加在玻片上,封闭1h;
 
(2)用缓冲液C简洗1min,每片滴加ABC复合物20~30μl,室温放置40min;
 
(3)缓冲液B室温漂洗3次,每次15min;
 
(4)滴加显色液于玻片上,镜下观察控制显色时间(一般7~14min);
 
(5)流水洗片,浸入苏木素液中复染30s,1%盐酸酒精分化(提抽2次);
 
(6)常规脱水、透明、封片,镜下观察。
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